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瀬尾　茂人
Seno Shigeto
瀬尾　茂人
Seno Shigeto
機関リポジトリ
情報科学研究科　バイオ情報工学専攻，教授

keyword 発現プロファイル，バイオインフォマティクス，類似構造探索，遺伝子発現解析，ゲノム，生物情報学，トランスクリプトーム解析，生体イメージング，細胞トラッキング

機関リポジトリ

経歴 10

  1. 2025年8月 ～ 継続中
    大阪大学　大学院情報科学研究科　教授

  2. 2024年4月 ～ 継続中
    大阪大学感染症総合教育研究拠点（兼任）

  3. 2023年7月 ～ 継続中
    大阪大学蛋白質研究所 蛋白質先端データ科学研究センター（兼任）

  4. 2023年7月 ～ 継続中
    大阪大学微生物病研究所 バイオインフォマティクスセンター（兼任）

  5. 2023年4月 ～ 継続中
    脳情報通信融合研究センター（兼任）

  6. 2018年4月 ～ 継続中
    大阪大学D3センター（データビリティフロンティア機構）（兼任）

  7. 2017年11月 ～ 2025年7月
    大阪大学　大学院情報科学研究科　准教授

  8. 2007年4月 ～ 2017年11月
    大阪大学　大学院情報科学研究科　助教

  9. 2006年4月 ～ 2007年3月
    大阪大学　大学院情報科学研究科　助手

  10. 2004年4月 ～ 2005年3月
    日本学術振興会　特別研究員

学歴 3

  1. 大阪大学　大学院情報科学研究科　バイオ情報工学専攻

    2003年4月 ～ 2006年3月

  2. 大阪大学　大学院基礎工学研究科　情報数理系専攻

    2001年4月 ～ 2003年3月

  3. 大阪大学　基礎工学部　情報科学科

    1997年4月 ～ 2001年3月

委員歴 15

  1. 情報処理学会, バイオ情報学（BIO）研究会　編集委員　学協会

    2025年4月 ～ 継続中

  2. 情報処理学会, 数理モデル化と問題解決（MPS）研究会　幹事　学協会

    2025年4月 ～ 継続中

  3. 情報処理学会, バイオ情報学（BIO）研究会　運営委員　学協会

    2024年4月 ～ 継続中

  4. 情報処理学会, 数理モデル化と問題解決（MPS）研究会　編集委員　学協会

    2024年4月 ～ 継続中

  5. NGS EXPO　ファシリテーター　学協会

    2022年3月 ～ 継続中

  6. ICBBE　Technical Program Comittee　学協会

    2020年 ～ 継続中

  7. Mathematical Modeling and Problem Solving”Satellite Workshop; International Conference on Parallel & Distributed Processing Techniques & Applications　プログラム委員　学協会

    2014年7月 ～ 継続中

  8. 日本バイオインフォマティクス学会　IIBMP2025 プログラム委員　学協会

    2025年4月 ～ 2025年9月

  9. 日本バイオインフォマティクス学会　IIBMP2022 実行委員・プログラム委員　学協会

    2021年10月 ～ 2022年12月

  10. 一般社団法人情報処理学会　論文誌ジャーナル/JIP編集委員会　学協会

    2020年4月 ～ 2022年3月

  11. 情報処理学会　数理モデル化と問題解決（MPS）研究会編集委員　学協会

    2017年4月 ～ 2021年3月

  12. 情報処理学会　論文誌ジャーナル/JIP編集委員　学協会

    2014年6月 ～ 2018年5月

  13. 情報処理学会　論文賞選定ワーキンググループ委員　学協会

    2015年12月 ～ 2017年3月

  14. 情報処理学会　数理モデル化と問題解決（MPS）研究会運営委員　学協会

    2013年4月 ～ 2017年3月

  15. 情報処理学会　論文誌ジャーナル「学生・若手研究者論文」特集号編集委員　学協会

    2015年8月 ～ 2016年3月

所属学会 2

  1. 日本バイオインフォマティクス学会

  2. 情報処理学会

研究内容・専門分野 2

  1. 情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

  2. ライフサイエンス / システムゲノム科学 /

受賞 10

  1. 情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用 優秀論文賞

    長村 徹, 瀬尾 茂人, 藤本 健二, 繁田 浩功, 松田 秀雄　一般社団法人情報処理学会　2025年3月

  2. Excellent Poster Award

    Ayaka Mae, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Yu, Chen Liu, Sangeun Kim, Daisuke Okuzaki, Ryoichi Mori, Hideo Matsuda　CBI学会　2023年10月

  3. Best Crowd Award

    Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Tsutomu Murata　KICSS2022　2022年11月

  4. BBB論文賞

    Mari Iwase, Shoko Sakai, Shigeto Seno, Yu-Sheng Yeh, Tony Kuo, Haruya Takahashi, Wataru Nomura, Huei-Fen Jheng, Paul Horton, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto　日本農芸化学会　2021年3月

  5. 大阪大学総長奨励賞（研究部門）

    瀬尾 茂人　大阪大学　2014年7月

  6. 情報処理学会論文賞(IPSJ Outstanding Paper Award)

    Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda　情報処理学会　2014年6月

  7. 2013年度（平成25年度）山下記念研究賞

    瀬尾 茂人　情報処理学会　2013年7月

  8. The 10th Asia Pacific Bioinformatics Conference, Best paper award

    2012年1月

  9. The 21st International Conference on Genome Informatics, Best poster award

    2010年12月

  10. 1st IEEE Computer Society Bioinformatics Conference (CSB2002), Best Poster Award

    瀬尾 茂人　2002年8月

論文 140

  1. Exploration of Key Signals in Alopecia Areata by Cell-Cell Interaction Analysis

    Ayaka Mori-Ichioka, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    International Journal of Pharma Medicine and Biological Sciences　p. 75-79　2025年6月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：EJournal Publishing

  2. High HER2 Intratumoral Heterogeneity Is Resistant to Anti-HER2 Neoadjuvant Chemotherapy in Early Stage and Locally Advanced HER2-Positive Breast Cancer

    Takaaki Hatano, Tomonori Tanei, Shigeto Seno, Yoshiaki Sota, nanae masunaga, Chieko Mishima, Masami Tsukabe, Tetsuhiro Yoshinami, Tomohiro Miyake, Masafumi Shimoda, Kenzo Shimazu

    Cancers　2025年6月　研究論文（学術雑誌）

  3. IRSN-23 gene diagnosis enhances breast cancer subtype classification and predicts response to neoadjuvant chemotherapy: new validation analyses.

    Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Yasuto Naoi, Keiichiro Honma, Masafumi Shimoda, Tomonori Tanei, Hideo Matsuda, Kenzo Shimazu

    Breast cancer (Tokyo, Japan)　2025年3月24日　研究論文（学術雑誌）

  4. Inference of Cell–Cell Interactions Through Spatial Transcriptomics Data Using Graph Convolutional Neural Networks

    Takahiro Hiura, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    Parallel and Distributed Processing Techniques (CSCE 2024)　p. 139-152　2025年3月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  5. Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring.

    Sang-Eun Kim, Ryota Noda, Yu-Chen Liu, Yukari Nakajima, Shoichiro Kameoka, Daisuke Motooka, Seiya Mizuno, Satoru Takahashi, Kento Takaya, Takehiko Murase, Kazuya Ikematsu, Katsiaryna Tratsiakova, Takahiro Motoyama, Masahiro Nakashima, Kazuo Kishi, Paul Martin, Shigeto Seno, Daisuke Okuzaki, Ryoichi Mori

    EMBO reports　2024年11月18日　研究論文（学術雑誌）

  6. Communication Analysis between Human Hair-Follicles and Immune Cells with Single-cell RNA-seq

    Ayaka Mori-Ichioka, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    Proceedings of the 2024 11th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering　p. 248-252　2024年11月8日　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：ACM

  7. Quantifying the recovery process of skeletal muscle on hematoxylin and eosin stained images via learning from label proportion

    Yu Yamaoka, Weng Ian Chan, Shigeto Seno, Kanako Iwamori, So-ichiro Fukada, Hideo Matsuda

    Scientific Reports　Vol. 14　No. 1　2024年11月7日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  8. 網羅的生体情報の統合解析の課題 全血球トランスクリプトームと血漿プロテオームの関連性の評価

    松本 寿健, 蛯原 健, 伊藤 弘, 瀬尾 茂人, 奥崎 大介, 織田 順

    日本救急医学会雑誌　Vol. 35　No. 11　p. 877-877　2024年11月

    出版者・発行元：(一社)日本救急医学会

  9. A single fast Hebbian-like process enabling one-shot class addition in deep neural networks without backbone modification

    Kazufumi Hosoda, Keigo Nishida, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Hideki Kashioka, Izumi Ohzawa

    Frontiers in Neuroscience　Vol. 18　2024年6月12日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Frontiers Media SA

  10. Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation

    Yu Miyamoto, Junichi Kikuta, Takahiro Matsui, Tetsuo Hasegawa, Kentaro Fujii, Daisuke Okuzaki, Yu-chen Liu, Takuya Yoshioka, Shigeto Seno, Daisuke Motooka, Yutaka Uchida, Erika Yamashita, Shogo Kobayashi, Hidetoshi Eguchi, Eiichi Morii, Karl Tryggvason, Takashi Shichita, Hisako Kayama, Koji Atarashi, Jun Kunisawa, Kenya Honda, Kiyoshi Takeda, Masaru Ishii

    Nature　2024年4月24日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  11. Regulation of muscle hypertrophy through granulin: Relayed communication among mesenchymal progenitors, macrophages, and satellite cells

    Lidan Zhang, Hayato Saito, Tatsuyoshi Higashimoto, Takayuki Kaji, Ayasa Nakamura, Kanako Iwamori, Ryoko Nagano, Daisuke Motooka, Daisuke Okuzaki, Akiyoshi Uezumi, Shigeto Seno, So ichiro Fukada

    Cell Reports　Vol. 43　No. 4　2024年4月23日　研究論文（学術雑誌）

  12. Plasma Proteomics Profile-Based Comparison of Torso Versus Brain Injury: A Prospective Cohort Study.

    Jotaro Tachino, Yuki Togami, Hisatake Matsumoto, Tsunehiro Matsubara, Shigeto Seno, Hiroshi Ogura, Jun Oda

    The journal of trauma and acute care surgery　2024年4月10日　研究論文（学術雑誌）

  13. Association between tranexamic acid administration and mortality based on the trauma phenotype: a retrospective analysis of a nationwide trauma registry in Japan.

    Jotaro Tachino, Shigeto Seno, Hisatake Matsumoto, Tetsuhisa Kitamura, Atsushi Hirayama, Shunichiro Nakao, Yusuke Katayama, Hiroshi Ogura, Jun Oda

    Critical care (London, England)　Vol. 28　No. 1　p. 89-89　2024年3月19日　研究論文（学術雑誌）

  14. High HER2 Intratumoral Heterogeneity Is a Predictive Factor for Poor Prognosis in Early-Stage and Locally Advanced HER2-Positive Breast Cancer

    Tomonori Tanei, Shigeto Seno, Yoshiaki Sota, Takaaki Hatano, Yuri Kitahara, Kaori Abe, nanae masunaga, Masami Tsukabe, Tetsuhiro Yoshinami, Tomohiro Miyake, Masafumi Shimoda, Hideo Matsuda, Kenzo Shimazu

    Cancers　2024年3月　研究論文（学術雑誌）

  15. A Novel Approach to Detection Algorithms for Artifacts in Clinical Endoscopy

    Seiryo Watanabe, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 17　p. 18-26　2024年　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Information Processing Society of Japan

  16. 血漿プロテオミクスプロファイルによる体幹部外傷と外傷性脳損傷の比較 前向きコホート研究

    舘野 丈太郎, 松本 寿健, 戸上 由貴, 松原 庸博, 瀬尾 茂人, 小倉 裕司, 織田 順

    日本救急医学会雑誌　Vol. 34　No. 12　p. 641-641　2023年12月

    出版者・発行元：(一社)日本救急医学会

  17. Biodiversity and Constrained Information Dynamics in Ecosystems: A Framework for Living Systems

    Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Rikuto Kamiura, Naomi Murakami, Michio Kondoh

    Entropy　2023年12月　研究論文（学術雑誌）

  18. Synthetic model ecosystem of 12 cryopreservable microbial species allowing for a noninvasive approach.

    Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Naomi Murakami, Hideo Matsuda, Yutaka Osada, Rikuto Kamiura, Michio Kondoh

    Bio Systems　Vol. 235　p. 105087-105087　2023年11月19日　研究論文（学術雑誌）

  19. Cell Tracking via Reinforcement Learning with Microscopic Image Simulator

    Toru Nagamura, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Hideo Matsuda

    Proceedings of the 2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology　2023年6月15日　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：ACM

  20. Pseudotime-based Deep Learning of Gene Regulatory Relationships from Single-Cell Expression Data

    Koki Nishi, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda

    Proceedings of the 2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology　2023年6月15日　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：ACM

  21. A Cell Tracking Method for Dynamic Analysis of Immune Cells Based on Deep Learning

    Aya Watanabe, Kenji Fujimoto, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    International Journal of Machine Learning　Vol. 13　No. 2　p. 64-69　2023年4月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：EJournal Publishing

  22. UCP1レポーター脂肪細胞株を用いたβ-アドレナリンシグナル調節遺伝子の探索

    川原崎 聡子, 瀬尾 茂人, 岡松 優子, 高橋 春弥, 野村 亘, 神戸 大朋, 木村 和弘, 斉藤 昌之, 松田 秀雄, 井上 和生, 後藤 剛

    日本栄養・食糧学会大会講演要旨集　Vol. 77回　p. 267-267　2023年3月

    出版者・発行元：(公社)日本栄養・食糧学会

  23. Identification of a unique subset of tissue-resident memory CD4+ T cells in Crohn's disease.

    Takehito Yokoi, Mari Murakami, Takako Kihara, Shigeto Seno, Mitsuru Arase, James Badger Wing, Jonas Nørskov Søndergaard, Ryuichi Kuwahara, Tomohiro Minagawa, Eri Oguro-Igashira, Daisuke Motooka, Daisuke Okuzaki, Ryota Mori, Atsuyo Ikeda, Yuki Sekido, Takahiro Amano, Hideki Iijima, Keiichi Ozono, Tsunekazu Mizushima, Seiichi Hirota, Hiroki Ikeuchi, Kiyoshi Takeda

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America　Vol. 120　No. 1　2023年1月3日　研究論文（学術雑誌）

  24. Combination of WFDC2, CHI3L1, and KRT19 in Plasma Defines a Clinically Useful Molecular Phenotype Associated with Prognosis in Critically Ill COVID-19 Patients.

    Takeshi Ebihara, Tsunehiro Matsubara, Yuki Togami, Hisatake Matsumoto, Jotaro Tachino, Hiroshi Matsuura, Takashi Kojima, Fuminori Sugihara, Shigeto Seno, Daisuke Okuzaki, Haruhiko Hirata, Hiroshi Ogura

    Journal of clinical immunology　Vol. 43　No. 2　p. 1-13　2022年11月4日　研究論文（学術雑誌）

  25. レポーター脂肪細胞株を用いたβ-アドレナリン刺激応答性UCP1発現誘導調節遺伝子の探索

    川原崎 聡子, 瀬尾 茂人, 岡松 優子, 高橋 春弥, 野村 亘, 神戸 大朋, 木村 和弘, 斉藤 昌之, 松田 秀雄, 井上 和生, 後藤 剛

    肥満研究　Vol. 28　No. Suppl.　p. 318-318　2022年11月

    出版者・発行元：(一社)日本肥満学会

  26. Myeloid cell-specific ablation of Runx2 gene exacerbates post-infarct cardiac remodeling.

    Masashi Tomimatsu, Kotaro Matsumoto, Moe Ashizuka, Shohei Kumagai, Shota Tanaka, Takafumi Nakae, Kosei Yokota, Shunsuke Kominami, Ryota Kajiura, Daisuke Okuzaki, Daisuke Motooka, Aki Shiraishi, Takaya Abe, Hideo Matsuda, Yoshiaki Okada, Makiko Maeda, Shigeto Seno, Masanori Obana, Yasushi Fujio

    Scientific reports　Vol. 12　No. 1　p. 16656-16656　2022年10月5日　研究論文（学術雑誌）

  27. Development of clinical phenotypes and biological profiles via proteomic analysis of trauma patients

    Jotaro Tachino, Hisatake Matsumoto, Fuminori Sugihara, Shigeto Seno, Daisuke Okuzaki, Tetsuhisa Kitamura, Sho Komukai, Yoshiyuki Kido, Takashi Kojima, Yuki Togami, Yusuke Katayama, Yuko Nakagawa, Hiroshi Ogura

    Critical Care　Vol. 26　No. 1　2022年8月6日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  28. MPP6 stimulates both RRP6 and DIS3 to degrade a specified subset of MTR4-sensitive substrates in the human nucleus.

    Naoko Fujiwara, Maki Shigemoto, Mizuki Hirayama, Ken-Ichi Fujita, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Masami Nagahama, Seiji Masuda

    Nucleic acids research　Vol. 50　No. 15　p. 8779-8806　2022年7月29日　研究論文（学術雑誌）

  29. A Novel Method for Gene Regulatory Network Inference with Pseudotime Data Using Information Criterion

    Shuhei Yao, Kaito Uemura, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    International Jounral of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics　Vol. 12　No. 3　p. 43-52　2022年7月　研究論文（学術雑誌）

  30. Relayed signaling between mesenchymal progenitors and muscle stem cells ensures adaptive stem cell response to increased mechanical load

    Akihiro Kaneshige, Takayuki Kaji, Lidan Zhang, Hayato Saito, Ayasa Nakamura, Tamaki Kurosawa, Madoka Ikemoto-Uezumi, Kazutake Tsujikawa, Shigeto Seno, Masatoshi Hori, Yasuyuki Saito, Takashi Matozaki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Michael Potente, Shuichi Watanabe, Thomas Braun, Akiyoshi Uezumi, So-ichiro Fukada

    Cell Stem Cell　Vol. 29　No. 2　p. 265-280　2021年12月2日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Elsevier BV

  31. Osteoclasts adapt to physioxia perturbation through DNA demethylation

    Keizo Nishikawa, Shigeto Seno, Toshitada Yoshihara, Ayako Narazaki, Yuki Sugiura, Reito Shimizu, Junichi Kikuta, Reiko Sakaguchi, Norio Suzuki, Norihiko Takeda, Hiroaki Semba, Masamichi Yamamoto, Daisuke Okuzaki, Daisuke Motooka, Yasuhiro Kobayashi, Makoto Suematsu, Haruhiko Koseki, Hideo Matsuda, Masayuki Yamamoto, Seiji Tobita, Yasuo Mori, Masaru Ishii

    EMBO reports　Vol. 22　No. 12　2021年10月18日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：EMBO

  32. SC-JNMF: Single-cell clustering integrating multiple quantification methods based on joint non-negative matrix factorization

    Mikio Shiga, Shigeto Seno, Makoto Onizuka, Hideo Matsuda

    PeerJ　Vol. 9　2021年8月27日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Cold Spring Harbor Laboratory

  33. A CNN-based cell tracking method for multi-slice intravital imaging data.

    Kenji Fujimoto, Tsubasa Mizugaki, Utkrisht Rajkumar, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Vineet Bafna, Hideo Matsuda

    Proceedings of the 12th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics 2021　p. 35-7　2021年8月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：ACM

  34. SLPI is a critical mediator that controls PTH-induced bone formation.

    Akito Morimoto, Junichi Kikuta, Keizo Nishikawa, Takao Sudo, Maki Uenaka, Masayuki Furuya, Tetsuo Hasegawa, Kunihiko Hashimoto, Hiroyuki Tsukazaki, Shigeto Seno, Akira Nakamura, Daisuke Okuzaki, Fuminori Sugihara, Akinori Ninomiya, Takeshi Yoshimura, Ryoko Takao-Kawabata, Hideo Matsuda, Masaru Ishii

    Nature communications　Vol. 12　No. 1　p. 2136-2136　2021年4月9日　研究論文（学術雑誌）

  35. Determining homologous recombination deficiency scores with whole exome sequencing and their association with responses to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer.

    Seung Jin Kim, Yoshiaki Sota, Yasuto Naoi, Keiichiro Honma, Naofumi Kagara, Tomohiro Miyake, Masafumi Shimoda, Tomonori Tanei, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Shinzaburo Noguchi, Kenzo Shimazu

    Translational oncology　Vol. 14　No. 2　p. 100986-100986　2021年2月　研究論文（学術雑誌）

  36. Dlk1 regulates quiescence in calcitonin receptor-mutant muscle stem cells.

    Lidan Zhang, Manami Kubota, Ayasa Nakamura, Takayuki Kaji, Shigeto Seno, Akiyoshi Uezumi, Ditte Caroline Andersen, Charlotte Harken Jensen, So-Ichiro Fukada

    Stem cells (Dayton, Ohio)　Vol. 39　No. 3　p. 306-317　2020年12月8日　研究論文（学術雑誌）

  37. Correlated chromosomal periodicities according to the growth rate and gene expression

    Liu Liu, Masaomi Kurokawa, Motoki Nagai, Shigeto Seno, Bei-Wen Ying

    Scientific Reports　Vol. 10　No. 1　2020年12月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  38. Development of an intravital imaging system for the synovial tissue reveals the dynamics of CTLA-4 Ig in vivo

    Tetsuo Hasegawa, Junichi Kikuta, Takao Sudo, Erika Yamashita, Shigeto Seno, Tsutomu Takeuchi, Masaru Ishii

    Scientific Reports　Vol. 10　No. 1　p. 13480-13480　2020年12月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  39. A model ecosystem of twelve cryopreservable microbial species allowing for a non-invasive approach

    Kazufumi Hosoda, Shigeto Seno, Naomi Murakami, Hideo Matsuda, Yutaka Osada, Michio Kondoh

    2020年10月23日　研究論文（その他学術会議資料等）

    出版者・発行元：Cold Spring Harbor Laboratory

  40. Glycerol kinase stimulates uncoupling protein 1 expression by regulating fatty acid metabolism in beige adipocytes.

    Mari Iwase, Soshi Tokiwa, Shigeto Seno, Takako Mukai, Yu-Sheng Yeh, Haruya Takahashi, Wataru Nomura, Huei-Fen Jheng, Sigenobu Matsumura, Tatsuya Kusudo, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto

    The Journal of biological chemistry　Vol. 295　No. 20　p. 7033-7045　2020年5月15日　研究論文（学術雑誌）

  41. Anti-Inflammatory and Antioxidative Properties of Isoflavones Provide Renal Protective Effects Distinct from Those of Dietary Soy Proteins against Diabetic Nephropathy.

    Huei-Fen Jheng, Kanako Hayashi, Yasuki Matsumura, Teruo Kawada, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Wataru Nomura, Haruya Takahashi, Tsuyoshi Goto

    Molecular nutrition & food research　Vol. 64　No. 10　2020年5月　研究論文（学術雑誌）

  42. In vivo dynamic analysis of BMP-2-induced ectopic bone formation

    Kunihiko Hashimoto, Takashi Kaito, Masayuki Furuya, Shigeto Seno, Daisuke Okuzaki, Junichi Kikuta, Hiroyuki Tsukazaki, Hideo Matsuda, Hideki Yoshikawa, Masaru Ishii

    Scientific Reports　Vol. 10　No. 1　2020年3月　研究論文（学術雑誌）

  43. Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes.

    Mari Iwase, Shoko Sakai, Shigeto Seno, Yu-Sheng Yeh, Tony Kuo, Haruya Takahashi, Wataru Nomura, Huei-Fen Jheng, Paul Horton, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry　Vol. 84　No. 2　p. 305-313　2020年2月　研究論文（学術雑誌）

  44. URH49 exports mRNA by remodeling complex formation and mediating the NXF1-dependent pathway.

    Ken-Ichi Fujita, Tomohiro Yamazaki, Kotaro Harada, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Seiji Masuda

    Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms　Vol. 1863　No. 2　p. 194480-194480　2020年1月7日　研究論文（学術雑誌）

  45. Migration arrest of chemoresistant leukemia cells mediated by MRTF-SRF pathway.

    Maho Morimatsu, Erika Yamashita, Shigeto Seno, Takao Sudo, Junichi Kikuta, Hiroki Mizuno, Daisuke Okuzaki, Daisuke Motooka, Masaru Ishii

    Inflammation and regeneration　Vol. 40　p. 15-15　2020年　研究論文（学術雑誌）

  46. Tracking and Analysis of FUCCI-Labeled Cells Based on Particle Filters and Time-to-Event Analysis

    Kenji Fujimoto, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics　Vol. 10　No. 2　p. 94-109　2020年　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：International Academy Publishing (IAP)

  47. Thrombomodulin induces anti-inflammatory effects by inhibiting the rolling adhesion of leukocytes in vivo

    Shino Nishizawa, Junichi Kikuta, Shigeto Seno, Masahiro Kajiki, Ryuichi Tsujita, Hiroki Mizuno, Takao Sudo, Tomoka Ao, Hideo Matsuda, Masaru Ishii

    Journal of Pharmacological Sciences　2020年1月

  48. Food-Derived Compounds Apigenin and Luteolin Modulate mRNA Splicing of Introns with Weak Splice Sites.

    Masashi Kurata, Naoko Fujiwara, Ken-Ichi Fujita, Yasutaka Yamanaka, Shigeto Seno, Hisato Kobayashi, Yusaku Miyamae, Nobuyuki Takahashi, Yasuyuki Shibuya, Seiji Masuda

    iScience　Vol. 22　p. 336-352　2019年12月20日　研究論文（学術雑誌）

  49. Single-cell transcriptome analysis of mouse leukocytes in inflammatory stimulation

    Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)　p. 1229-1231　2019年11月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：

  50. Analyzing Leukocyte Migration Trajectories by Deformable Image Matching

    Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Shino Nishizawa, Yutaka Uchida, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE)　p. 94-98　2019年10月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  51. 嶋田彩人, 瀬尾茂人, 繁生体蛍光観察動画像の深度を考慮した深層学習による細胞追跡精度の改善

    嶋田彩人, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 間下以大, 内田穣, 石井優, 松田秀雄

    情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用　Vol. 12　No. 2　p. 82-91　2019年7月　研究論文（学術雑誌）

  52. Improvement of detection performance of fusion genes from RNA-seq data by clustering short reads

    Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzabro Noguchi, Hideo Matsuda

    Journal of Bioinformatics and Computational Biology　Vol. 17　No. 3　p. 1940008-1940008　2019年7月　研究論文（学術雑誌）

  53. In vivo Multicolor Imaging with Fluorescent Probes Revealed the Dynamics and Function of Osteoclast Proton Pumps

    Masafumi Minoshima, Junichi Kikuta, Yuta Omori, Shigeto Seno, Riko Suehara, Hiroki Maeda, Hideo Matsuda, Masaru Ishii, Kazuya Kikuchi

    ACS Central Science　Vol. 5　No. 6　p. 1059-1066　2019年5月　研究論文（学術雑誌）

  54. Asymmetric Integration of Single-Cell Transcriptomic Data using Latent Dirichlet Allocation and Procrustes Analysis

    Mitsuhiro Eto, Wataru Hirota, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)　p. 2129-2135　2018年12月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：

  55. Roles of Enhancer RNAs in RANKL-induced Osteoclast Differentiation Identified by Genome-wide Cap-analysis of Gene Expression using CRISPR

    Yukako Sakaguchi, Keizo Nishikawa, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Hiroshi Takayanagi, Masaru Ishii

    Scientific Reports　Vol. 8　No. 1　2018年12月1日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Nature Publishing Group

  56. 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張

    赤沢 秀樹, 渡邊 誓旅, 繁田 浩功, 間下 以大, 瀬尾 茂人, 松田 秀雄

    2018年8月　研究論文（その他学術会議資料等）

  57. Rising Stars in Skeletal Biology 二光子励起生体イメージングを用いた骨芽細胞・破骨細胞コミュニケーションの解明

    古家 雅之, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 前田 拓樹, 吉川 秀樹, 石井 優

    日本骨代謝学会学術集会プログラム抄録集　Vol. 36回　p. 117-117　2018年7月

    出版者・発行元：(一社)日本骨代謝学会

  58. The dipeptidyl peptidase‐4 (DPP‐4) inhibitor teneligliptin enhances brown adipose tissue function, thereby preventing obesity in mice

    Kenichiro Takeda, Honami Sawazaki, Haruya Takahashi, YuSheng Yeh, HueiFen Jheng, Wataru Nomura, Takeshi Ara, Nobuyuki Takahashi, Shigeto Seno, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto

    FEBS openbio　Vol. 8　No. 11　2018年7月　研究論文（学術雑誌）

  59. Automated transition analysis of activated gene regulation during diauxic nutrient shift in Escherichia coli and adipocyte differentiation in mouse cells

    Yoichi Takenaka, Kazuma Mikami, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    BMC Bioinformatics　Vol. 19　No. 89　p. 49-59　2018年5月8日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：BioMed Central Ltd.

  60. 生体骨イメージング技術と計測解析の最前線 生体骨イメージングで見る破骨細胞・骨芽細胞間の4D相互作用

    古家 雅之, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 前田 拓樹, 吉川 秀樹, 石井 優

    日本骨形態計測学会雑誌　Vol. 28　No. 2　p. S57-S57　2018年5月

    出版者・発行元：日本骨形態計測学会

  61. Chromatin 3D reconstruction from chromosomal contacts using a genetic algorithm

    Viacheslav Kapilevich, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Yoichi Takenaka

    IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics　Vol. 16　No. 5　2018年3月　研究論文（学術雑誌）

  62. A Phytol-Enriched Diet Activates PPAR-α in the Liver and Brown Adipose Tissue to Ameliorate Obesity-Induced Metabolic Abnormalities

    Ji-Yeong An, Huei-Fen Jheng, Hiroyuki Nagai, Kohei Sanada, Haruya Takahashi, Mari Iwase, Natsumi Watanabe, Young-Il Kim, Aki Teraminami, Nobuyuki Takahashi, Rieko Nakata, Hiroyasu Inoue, Shigeto Seno, Hideo Mastuda, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto

    Molecular Nutrition & Food Research　Vol. 62　No. 6　2018年3月1日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：

  63. Direct cell–cell contact between mature osteoblasts and osteoclasts dynamically controls their functions in vivo

    Masayuki Furuya, Junichi Kikuta, Sayumi Fujimori, Shigeto Seno, Hiroki Maeda, Mai Shirazaki, Maki Uenaka, Hiroki Mizuno, Yoriko Iwamoto, Akito Morimoto, Kunihiko Hashimoto, Takeshi Ito, Yukihiro Isogai, Masafumi Kashii, Takashi Kaito, Shinsuke Ohba, Ung-il Chung, Alexander C. Lichtler, Kazuya Kikuchi, Hideo Matsuda, Hideki Yoshikawa, Masaru Ishii

    Nature Communications　Vol. 9　No. 1　p. 300-300　2018年1月19日　研究論文（学術雑誌）

  64. Detection of Fusion Genes from Human Breast Cancer Cell-line RNA-Seq Data Using Shifted Short Read Clustering

    Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda

    PROCEEDINGS 2018 IEEE 18TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOENGINEERING (BIBE)　p. 159-162　2018年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  65. Diagnostic Assessment of Deep Learning Algorithms for Detection of Lymph Node Metastases in Women With Breast Cancer

    Babak Ehteshami Bejnordi, Mitko Veta, Paul Johannes van Diest, Bram van Ginneken, Nico Karssemeijer, Geert Litjens, Jeroen A. W. M. van der Laak

    JAMA-JOURNAL OF THE AMERICAN MEDICAL ASSOCIATION　Vol. 318　No. 22　p. 2199-2210　2017年12月　研究論文（学術雑誌）

  66. Bone marrow cavity segmentation using graph-cuts with wavelet-based texture feature

    Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Shigeto Seno, Haruo Takemura, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY　Vol. 15　No. 5　2017年10月　研究論文（学術雑誌）

  67. Over-expression of PPARα in obese mice adipose tissue improves insulin sensitivity

    Haruya Takahashi, Kohei Sanada, Hiroyuki Nagai, Yongjia Li, Yumeko Aoki, Takeshi Ara, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Rina Yu, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto

    Biochemical and Biophysical Research Communications　Vol. 493　No. 1　p. 108-114　2017年9月　研究論文（学術雑誌）

  68. The hepatokine FGF21 is crucial for peroxisome proliferator-activated receptor-α agonist-induced amelioration of metabolic disorders in obese mice

    Tsuyoshi Goto, Mariko Hirata, Yumeko Aoki, Mari Iwase, Haruya Takahashi, Minji Kim, Yongjia Li, Huei-Fen Jheng, Wataru Nomura, Nobuyuki Takahashi, Chu-Sook Kim, Rina Yu, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Megumi Aizawa-Abe, Ken Ebihara, Nobuyuki Itoh, Teruo Kawada

    The Journal of Biological Chemistry　Vol. 292　No. 22　p. 9175-9190　2017年6月　研究論文（学術雑誌）

  69. A simple comparison of the extrinsic noise in gene expression between native and foreign regulations in Escherichia coli

    Bei-Wen Ying, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Tetsuya Yomo

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　Vol. 486　No. 3　p. 852-857　2017年5月　研究論文（学術雑誌）

  70. Correlation between genome reduction and bacterial growth

    Masaomi Kurokawa, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Bei-Wen Ying

    DNA RESEARCH　Vol. 23　No. 6　p. 517-525　2016年12月　研究論文（学術雑誌）

  71. 模様特徴量とグラフカットを利用した生体骨組織の骨髄腔の領域分割

    繁田 浩功, 間下 以大, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 石井 優, 松田 秀雄

    2016年9月　研究論文（その他学術会議資料等）

  72. ウェーブレット特徴量を用いた生体骨組織の骨髄腔の領域分割手法

    繁田浩功, 間下以大, 菊田順一, 瀬尾茂人, 竹村治雄, 松田秀雄, 石井優

    2016年6月　研究論文（その他学術会議資料等）

  73. Comparative Analysis of Transformation Methods for Gene Expression Profiles in Breast Cancer Datasets

    Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda

    2016 IEEE 16TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOENGINEERING (BIBE)　p. 328-333　2016年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  74. Proinflammatory cytokine interleukin-1β suppresses cold-induced thermogenesis in adipocytes

    Tsuyoshi Goto, Supaporn Naknukool, Rieko Yoshitake, Yuki Hanafusa, Soshi Tokiwa, Yongjia Li, Tomoya Sakamoto, Takahiro Nitta, Minji Kim, Nobuyuki Takahashi, Rina Yu, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Teruo Kawada

    Cytokine　Vol. 77　p. 107-114　2016年1月　研究論文（学術雑誌）

  75. A Bone Marrow Cavity Segmentation Method using Wavelet-based Texture Feature

    Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Junichi Kikutat, Shigeto Seno, Haruo Takemura, Hideo Matsuda, Masaru Ishii

    2016 23RD INTERNATIONAL CONFERENCE ON PATTERN RECOGNITION (ICPR)　Vol. 15　No. 5　p. 2133-2138　2016年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  76. 生体イメージング技術を駆使したトロンボモジュリンの新たな作用機序解明

    西澤 志乃, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 松田 秀雄, 石井 優

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集　Vol. 88回・38回　p. [3T23p-05(3P0080)]　2015年12月

    出版者・発行元：(公社)日本生化学会

  77. Functional specialization in regulation and quality control in thermal adaptive evolution

    Kazuma Yama, Yuki Matsumoto, Yoshie Murakami, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Kazuyoshi Gotoh, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Bei-Wen Ying, Tetsuya Yomo

    GENES TO CELLS　Vol. 20　No. 11　p. 943-955　2015年11月　研究論文（学術雑誌）

  78. Detecting shifts in gene regulatory networks during time-course experiments at single-time-point temporal resolution

    Yoichi Takenaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY　Vol. 13　No. 5　2015年10月　研究論文（学術雑誌）

  79. Evolutionary Consequence of a Trade-Off between Growth and Maintenance along with Ribosomal Damages

    Bei-Wen Ying, Tomoya Honda, Saburo Tsuru, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Yasuaki Kazuta, Tetsuya Yomo

    PLOS ONE　Vol. 10　No. 8　2015年8月　研究論文（学術雑誌）

  80. コンポーネントツリーを用いたグローバルデータアソシエーションによる細胞追跡手法

    藏重昂平, 瀬尾茂人, 間下以大, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2015年6月　研究論文（その他学術会議資料等）

  81. グラフカットを用いた骨髄腔画像の領域分割

    宇佐見潤, 繁田浩, 間下以大, 黒田嘉宏, 菊田順一, 瀬尾茂人, 石井優, 松田秀雄, 竹村治雄

    情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用　Vol. 8　No. 3　p. 18-27　2015年3月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  82. 生体骨組織における骨髄腔画像のウェーブレット変換を用いた骨髄腔領域の認識手法

    繁田 浩功, 間下 以大, 金子 雄, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 竹村 治雄, 松田 秀雄, 石井 優

    2015年1月　研究論文（その他学術会議資料等）

  83. Directed evolution of cell size in Escherichia coli

    Mari Yoshida, Saburo Tsuru, Naoko Hirata, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Bei-Wen Ying, Tetsuya Yomo

    BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY　Vol. 14　No. 1　2014年12月　研究論文（学術雑誌）

  84. Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information

    Kohei Kurashige, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2014年10月

  85. An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data

    Kojiro Fukuda, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2014年10月

  86. 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法

    藏重 昂平, 福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告　2014年9月　研究論文（その他学術会議資料等）

  87. Metagenome fragment classification based onmultiple motif-occurrence profiles

    Naoki Matsushita, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    PEERJ　Vol. 2　2014年9月　研究論文（学術雑誌）

  88. A Segmentation Method for Bone Marrow Cavity Imaging Using Graph Cuts

    Tomohiro Mashita, Jun Usam, Hironori Shigeta, Yoshihiro Kuroda, Junichi Kikuta, Shigeto Senoo, Masaru Ishi, Hideo Matsuda, Haruo Takemura

    2014 1st Workshop on Pattern Recognition Techniques for Indirect Immunofluorescence Images　2014年8月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：IEEE

  89. タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析

    福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    2014年6月　研究論文（その他学術会議資料等）

  90. マルチチャンネル蛍光顕微鏡動画のためのパーティクルフィルタを用いた細胞追跡手法

    小森康祐, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    第76回全国大会講演論文集　Vol. 2014　No. 1　p. 291-292　2014年3月　研究論文（その他学術会議資料等）

  91. Gene expression scaled by distance to the genome replication site

    Bei-Wen Ying, Saburo Tsuru, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Tetsuya Yomo

    MOLECULAR BIOSYSTEMS　Vol. 10　No. 3　p. 375-379　2014年　研究論文（学術雑誌）

  92. 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法

    渡邉 之人, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会論文誌. 数理モデル化と応用　Vol. 6　No. 3　p. 151-162　2013年12月27日

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  93. 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法

    瀬尾 茂人, 間下 以大, 前田 栄, 竹中 要一, 石井 優, 松田 秀雄

    情報処理学会論文誌. 数理モデル化と応用　Vol. 6　No. 3　p. 140-150　2013年12月27日

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  94. Integrative prediction of miRNA-mRNA interactions from high-throughput sequencing data

    Tomoshige Ohno, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics, with DREAM Challenges 2013　2013年11月

  95. 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法

    福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2013年8月　研究論文（その他学術会議資料等）

  96. Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法

    尾野貴広, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2013年7月　研究論文（その他学術会議資料等）

  97. An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles

    Ryo Araki, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    Gene　Vol. 518　No. 1　p. 17-25　2013年4月10日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：1

  98. Multilevel comparative analysis of the contributions of genome reduction and heat shock to the Escherichia coli transcriptome

    Bei-Wen Ying, Shigeto Seno, Fuyuro Kaneko, Hideo Matsuda, Tetsuya Yomo

    BMC GENOMICS　Vol. 14　2013年1月　研究論文（学術雑誌）

  99. 多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法

    瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2012年12月　研究論文（その他学術会議資料等）

  100. Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data

    Tomoyoshi Nakayama, Yoshiyuki Kido, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    2012年12月

  101. 多色蛍光タイムラプスイメージングによる細胞周期観測データのための細胞自動追跡手法

    瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2012年11月　研究論文（その他学術会議資料等）

  102. Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle

    Shigeto Seno, Sakae Maeda, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2012年10月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  103. Estimation of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Splitting Time Course Data

    Tomoyoshi Nakayama, Yoshiyuki Kido, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    2012年10月

  104. A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images

    Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2012年9月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  105. A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping

    Ohno Tomoshige, Seno Shigeto, Takenaka Yoichi, Matsuda Hideo

    Information and Media Technologies　Vol. 7　No. 2　p. 921-927　2012年

    出版者・発行元：Information and Media Technologies Editorial Board

  106. An estimation method for inference of gene regulatory net-work using Bayesian network with uniting of partial problems

    Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    Series on Advances in Bioinformatics and Computational Biology　Vol. 13　2012年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：Imperial College Press

  107. A method for isoform prediction from RNA-seq data by iterative mapping

    Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 5　p. 27-33　2012年　研究論文（学術雑誌）

  108. An estimation method for inference of gene regulatory net-work using Bayesian network with uniting of partial problems

    Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    BMC GENOMICS　Vol. 13　2012年1月　研究論文（学術雑誌）

  109. INFERENCE OF S-SYSTEM MODELS OF GENE REGULATORY NETWORKS USING IMMUNE ALGORITHM

    Tomoyoshi Nakayama, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY　Vol. 9　p. 75-86　2011年12月　研究論文（学術雑誌）

  110. Reduction in genome size decreased fluctuation in gene expression.

    Bei-Wen Ying, Shigeto Seno, Tetsuya Yomo

    2011年12月　研究論文（その他学術会議資料等）

  111. 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法

    吉澤陽志, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用　Vol. 4　No. 4　p. 59-68　2011年11月　研究論文（学術雑誌）

  112. Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping

    Yoichi Takenaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    BMC GENOMICS　Vol. 12　2011年11月　研究論文（学術雑誌）

  113. Size evolution with a laboratory Escherichia coli strain.

    Mari Yoshida, Nao Hiramoto, Shigeto Seno, Saburo Tsuru, Bei-Wen Ying, Tetsuya Yomo

    2011年10月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  114. 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法

    池田成吾, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会バイオ情報学研究会報告　Vol. 2011　No. 9　p. 1-7　2011年6月　研究論文（その他学術会議資料等）

  115. Exploration of Potential Genomic Portraits Associated with Intrahepatic Recurrence in Human Hepatocellular Carcinoma

    Nobuyoshi Kittaka, Ichiro Takemasa, Shigeto Seno, Yutaka Takeda, Shogo Kobayashi, Shigeru Marubashi, Keizo Dono, Koji Umeshita, Hiroaki Nagano, Hideo Matsuda, Morito Monden, Masaki Mori, Yuichiro Doki

    ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY　Vol. 17　No. 12　p. 3145-3154　2010年12月　研究論文（学術雑誌）

  116. メタデータを利用した生物情報解析ワークフローの作成支援手法の提案

    福本貴紀, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会関西支部 支部大会講演論文集　Vol. 2010　2010年9月　研究論文（その他学術会議資料等）

  117. A Metadata Management System for Composing Bioinformatics Workflows

    Takuya Ishibashi, Yoshiyuki Kido, Takanori Fukumoto, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    9th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)　2010年9月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  118. Gene Expression Profile Prospectively Predicts Peritoneal Relapse After Curative Surgery of Gastric Cancer

    Atsushi Takeno, Ichiro Takemasa, Shigeto Seno, Makoto Yamasaki, Masaaki Motoori, Hiroshi Miyata, Kiyokazu Nakajima, Shuji Takiguchi, Yoshiyuki Fujiwara, Toshiro Nishida, Toshitsugu Okayama, Kenichi Matsubara, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda, Morito Monden, Masaki Mori, Yuichiro Doki

    ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY　Vol. 17　No. 4　p. 1033-1042　2010年4月　研究論文（学術雑誌）

  119. 立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良

    吉川達也, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告　Vol. 2010　No. 1　p. 1-8　2010年3月

  120. Improved Prediction Method for Protein Interactions Using Both Structural and Functional Characteristics of Proteins

    Yoshikawa Tatsuya, Seno Shigeto, Takenaka Yoichi, Matsuda Hideo

    Information and Media Technologies　Vol. 5　No. 2　p. 489-502　2010年

    出版者・発行元：Information and Media Technologies 編集運営会議

  121. Improved prediction method for protein interactions using both structural and functional characteristics of proteins

    Tatsuya Yoshikawa, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 3　No. 2　p. 10-23　2010年　研究論文（学術雑誌）

  122. A METHOD FOR EFFICIENT EXECUTION OF BIOINFORMATICS WORKFLOWS

    JUNYA SEO, YOSHIYUKI KIDO, SHIGETO SENO, YOICHI TAKENAKA, HIDEO MATSUDA

    Genome Informatics 2009　Vol. 23　p. 139-148　2009年10月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：PUBLISHED BY IMPERIAL COLLEGE PRESS AND DISTRIBUTED BY WORLD SCIENTIFIC PUBLISHING CO.

  123. Ｗｅｂサービス情報の統合のためのレポジトリ連携手法の提案

    野中崇史, 瀬尾淳哉, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田 秀雄

    情報処理学会バイオ情報学研究会報告　Vol. 2009　No. 25　p. 1-4　2009年3月　研究論文（その他学術会議資料等）

  124. Architecture of an Efficient Data Transfer System and Manager for Genome-wide Analysis Workflows

    Junya Seo, Yoshiyuki Kido, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    The 3rd MEI International Symposium 2008　2008年12月　研究論文（その他学術会議資料等）

  125. A Method for Reducing Bounds of Compound Search by Dividing Structure Key

    Takashi Shimizu, Yoshiyuki Kido, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  126. A Method for Making a New Reference Set of PDB Entries for Retrieving Protein 3D Structures with Structural Annotations

    Masahiko Hamada, Yoshiyuki Kido, Shigeto Seno, Hiromi Daiyasu, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月　研究論文（国際会議プロシーディングス）

  127. 脂肪細胞・骨芽細胞分化における遺伝子制御ネットワークの推定

    松田秀雄, 竹中要一, 水野洋介, 瀬尾茂人, 徳澤佳美, 仲地豊, 坊農秀雅, 岡崎康司

    第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会大会合同大会　2008年12月

  128. 構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法

    清水隆史, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会バイオ情報学研究会報告　Vol. 2008　No. 86　p. 5-8　2008年9月　研究論文（その他学術会議資料等）

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  129. A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research using Data-Staging

    Yoshiyuki Kido, Shigeto Seno, Susumu Date, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 49　No. 5　p. 58-64　2008年3月　研究論文（学術雑誌）

  130. A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction

    Gen Kawamura, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 49　No. 5　p. 46-57　2008年3月　研究論文（学術雑誌）

  131. A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research Using Data-Staging

    Kido Yoshiyuki, Seno Shigeto, Date Susumu, Takenaka Yoichi, Matsuda Hideo

    IPSJ Digital Courier　Vol. 4　p. 250-256　2008年

    出版者・発行元：Information Processing Society of Japan

  132. A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction

    Kawamura Gen, Seno Shigeto, Takenaka Yoichi, Matsuda Hideo

    IPSJ Digital Courier　Vol. 4　p. 238-249　2008年

    出版者・発行元：Information Processing Society of Japan

  133. A Method for Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows

    Junya Seo, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka

    Proceedings of 2007 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics　2007年12月

  134. 生物情報解析ワークフローにおけるデータ転送経路の効率化

    瀬尾淳哉, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    日本ソフトウェア科学会第２４回大会　2007年9月

  135. Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows using TF-IDF Filtering.

    Junya Seo, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    IPSJ Transactions on Bioinformatics　Vol. 2007　No. 128　p. 259-266　2007年3月　研究論文（学術雑誌）

  136. Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows Using TF-IDF Filtering

    Seo Junya, Seno Shigeto, Takenaka Yoichi, Matsuda Hideo

    IPSJ Digital Courier　Vol. 3　p. 164-173　2007年

    出版者・発行元：Information Processing Society of Japan

  137. A method for similarity search of genomic positional expression using CAGE

    Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Chikatoshi Kai, Jun Kawai, Piero Carninci, Yoshihide Hayashizaki, Hideo Matsuda

    PLOS GENETICS　Vol. 2　No. 4　p. 578-586　2006年4月　研究論文（学術雑誌）

  138. The transcriptional landscape of the mammalian genome

    P Carninci, T Kasukawa, S Katayama, J Gough, MC Frith, N Maeda, R Oyama, T Ravasi, B Lenhard, C Wells, R Kodzius, K Shimokawa, VB Bajic, SE Brenner, S Batalov, ARR Forrest, M Zavolan, MJ Davis, LG Wilming, Aidinis, V, JE Allen, Ambesi-Impiombato, X, R Apweiler, RN Aturaliya, TL Bailey, M Bansal, L Baxter, KW Beisel, T Bersano, H Bono, AM Chalk, KP Chiu, Choudhary, V, A Christoffels, DR Clutterbuck, ML Crowe, E Dalla, BP Dalrymple, B de Bono, G Della Gatta, D di Bernardo, T Down, P Engstrom, M Fagiolini, G Faulkner, CF Fletcher, T Fukushima, M Furuno, S Futaki, M Gariboldi, P Georgii-Hemming, TR Gingeras, T Gojobori, RE Green, S Gustincich, M Harbers, Y Hayashi, TK Hensch, N Hirokawa, D Hill, L Huminiecki, M Iacono, K Ikeo, A Iwama, T Ishikawa, M Jakt, A Kanapin, M Katoh, Y Kawasawa, J Kelso, H Kitamura, H Kitano, G Kollias, SPT Krishnan, A Kruger, SK Kummerfeld, Kurochkin, IV, LF Lareau, D Lazarevic, L Lipovich, J Liu, S Liuni, S McWilliam, MM Babu, M Madera, L Marchionni, H Matsuda, S Matsuzawa, H Miki, F Mignone, S Miyake, K Morris, S Mottagui-Tabar, N Mulder, N Nakano, H Nakauchi, P Ng, R Nilsson, S Nishiguchi, S Nishikawa, F Nori, O Ohara, Y Okazaki, Orlando, V, KC Pang, WJ Pavan, G Pavesi, G Pesole, N Petrovsky, S Piazza, J Reed, JF Reid, BZ Ring, M Ringwald, B Rost, Y Ruan, SL Salzberg, A Sandelin, C Schneider, C Schonbach, K Sekiguchi, CAM Semple, S Seno, L Sessa, Y Sheng, Y Shibata, H Shimada, K Shimada, D Silva, B Sinclair, S Sperling, E Stupka, K Sugiura, R Sultana, Y Takenaka, K Taki, K Tammoja, SL Tan, S Tang, MS Taylor, J Tegner, SA Teichmann, HR Ueda, E van Nimwegen, R Verardo, CL Wei, K Yagi, H Yamanishi, E Zabarovsky, S Zhu, A Zimmer, W Hide, C Bult, SM Grimmond, RD Teasdale, ET Liu, Brusic, V, J Quackenbush, C Wahlestedt, JS Mattick, DA Hume, C Kai, D Sasaki, Y Tomaru, S Fukuda, M Kanamori-Katayama, M Suzuki, J Aoki, T Arakawa, J Iida, K Imamura, M Itoh, T Kato, H Kawaji, N Kawagashira, T Kawashima, M Kojima, S Kondo, H Konno, K Nakano, N Ninomiya, T Nishio, M Okada, C Plessy, K Shibata, T Shiraki, S Suzuki, M Tagami, K Waki, A Watahiki, Y Okamura-Oho, H Suzuki, J Kawai, Y Hayashizaki

    SCIENCE　Vol. 309　No. 5740　p. 1559-1563　2005年9月　研究論文（学術雑誌）

  139. A method for clustering gene expression data based on graph structure.

    Seno S, Teramoto R, Takenaka Y, Matsuda H

    Genome informatics. International Conference on Genome Informatics　Vol. 15　No. 2　p. 151-160　2004年　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：2

  140. P-quasi complete linkage analysis for gene-expression data

    S. Seno, R. Teramoto, H. Matsuda

    Proceedings - IEEE Computer Society Bioinformatics Conference, CSB 2002　2002年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

    出版者・発行元：Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc.

MISC 25

  1. 臨床の疑問を分子の言葉に“みえる化”!臨床バイオインフォマティクス9ステップ 第3回(最終回)

    松本寿健, 瀬尾茂人, 奥崎大介

    実験医学　Vol. 42　No. 18　2024年

  2. 外傷におけるフェノタイプ分類の開発と応用

    舘野丈太郎, 松本寿健, 瀬尾茂人, 北村哲久, 片山祐介, 小倉裕司, 織田順

    日本集中治療医学会学術集会(Web)　Vol. 51st　2024年

  3. 外傷フェノタイプに基づくトラネキサム酸の治療効果推定(日本国内多施設コホート研究)

    舘野丈太郎, 瀬尾茂人, 松本寿健, 平山敦士, 北村哲久, 中尾俊一郎, 片山祐介, 小倉裕司, 織田順

    日本集中治療医学会学術集会(Web)　Vol. 51st　2024年

  4. 血漿プロテオミクスプロファイルによる体幹部外傷と外傷性脳損傷の比較 前向きコホート研究

    舘野 丈太郎, 松本 寿健, 戸上 由貴, 松原 庸博, 瀬尾 茂人, 小倉 裕司, 織田 順

    日本救急医学会雑誌　Vol. 34　No. 12　p. 641-641　2023年12月

    出版者・発行元：(一社)日本救急医学会

  5. レポーター前駆脂肪細胞株を用いた新規UCP1発現調節遺伝子の探索

    川原崎 聡子, 瀬尾 茂人, 鄭 惠芬, 高橋 春弥, 野村 亘, 神戸 大朋, 松田 秀雄, 井上 和生, 河田 照雄, 後藤 剛

    肥満研究　Vol. 27　No. Suppl.　p. 338-338　2022年3月

    出版者・発行元：(一社)日本肥満学会

  6. 核特異的コファクターによるヒトRNAエキソソーム複合体の活性および基質特異性の制御

    藤原奈央子, 藤田賢一, 藤田賢一, 瀬尾茂人, 増田誠司, 増田誠司

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　Vol. 2022　2022年

  7. 全血mRNA/miRNAネットワーク解析による重症COVID-19の病態解明

    戸上由貴, 松本寿健, 松原庸博, 蛯原健, 石川昌和, 杉原文徳, 瀬尾茂人, 奥崎大介, 平田陽彦, 小倉裕司

    日本集中治療医学会学術集会(Web)　Vol. 49th　2022年

  8. 核内エキソソームの分解ターゲットとなるpolyA+RNAの解析

    杉元啓悟, 藤原奈央子, 瀬尾茂人, 増田誠司

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　Vol. 2021　2021年

  9. 白色脂肪組織のglycerol kinaseは細胞内脂肪酸代謝調節を介して褐色化を制御する

    後藤剛, 後藤剛, 岩瀬麻里, 常盤颯志, 瀬尾茂人, 向井貴子, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huei-Fen, 松村成暢, 楠堂達也, 大里直樹, 松田秀雄, 井上和生, 井上和生, 河田照雄, 河田照雄

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　Vol. 2021　2021年

  10. PEA法を用いた血漿プロテオミクス解析による重症新型コロナ感染症の分子病態型と患者層別化マーカー開発

    松本寿健, 蛯原健, 松原庸博, 戸上由貴, 舘野丈太郎, 松浦裕司, 松浦裕司, 児島嵩, 平田陽彦, 杉原文徳, 瀬尾茂人, 奥崎大介, 小倉裕司

    日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集　Vol. 66th (CD-ROM)　2021年

  11. 骨芽細胞・破骨細胞は細胞間接触を介して骨リモデリングを調節する

    古家雅之, 古家雅之, 古家雅之, 菊田順一, 瀬尾茂人, 前田拓樹, 柏井将文, 柏井将文, 海渡貴司, 橋本国彦, 橋本国彦, 松田秀雄, 菊地和也, 石井優, 吉川秀樹, 吉川秀樹

    Journal of Spine Research (Web)　Vol. 11　No. 3　2020年

  12. UAP56とURH49によるスプライシング制御を介した選択的mRNA輸送機構の解明

    藤田賢一, 池田宥哉, 吉岡英恵, 瀬尾茂人, 増田誠司

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)　Vol. 42nd　2019年

  13. スプライシング阻害作用を持つ活性フラボノイドの作用機序の解明

    倉田 雅志, 高島 裕之, 瀬尾 茂人, 増田 誠司, 渋谷 恭之

    日本口腔科学会雑誌　Vol. 67　No. 2　p. 187-187　2018年7月

    出版者・発行元：(NPO)日本口腔科学会

  14. Quantitative data analysis for live imaging of bone

    Shigeto Seno

    Vol. 28　No. 2　p. 193-200　2018年1月　記事・総説・解説・論説等（その他）

  15. 二光子励起生体イメージングを用いた破骨細胞・骨芽細胞コミュニケーションの解明

    古家雅之, 古家雅之, 古家雅之, 菊田順一, 瀬尾茂人, 前田拓樹, 柏井将文, 海渡貴司, 菊地和也, 松田秀雄, 吉川秀樹, 石井優

    日本整形外科学会雑誌　Vol. 91　No. 8　2017年

  16. Gene Set Enrichment Analysis for Time-Series Gene Expression Profile

    Yuta Yuta Okuma, Seno Shigeto, takenaka yoichi, Matsuda Hideo

    生体医工学　Vol. 51　p. R-166-R-166　2013年

    出版者・発行元：Japanese Society for Medical and Biological Engineering

  17. 近隣リードを考慮したショートリードクラスタリングによる塩基配列構造情報の有向非循環グラフ表現

    上田 大介, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）　Vol. 2012　No. 27　p. 1-2　2012年2月23日

  18. 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法

    池田 成吾, 木戸 善之, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング　Vol. 111　No. 96　p. 51-57　2011年6月16日

    出版者・発行元：一般社団法人電子情報通信学会

  19. 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法

    吉澤 陽志, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）　Vol. 2011　No. 10　p. 1-8　2011年2月28日

    出版者・発行元：情報処理学会

  20. Tanimoto係数を用いた類似化合物検索のクラスタリングによる高速化手法

    グエンカムリー, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    研究報告バイオ情報学（BIO）　Vol. 2010　No. 7　p. 1-8　2010年2月25日

    出版者・発行元：情報処理学会

  21. 大規模な化合物データベースからの類似化合物探索手法

    河村 元, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    全国大会講演論文集　Vol. 70　p. 233-234　2008年3月13日

  22. 化合物活性予測のためのTanimoto係数とRandom ForestのProximity Measureの組合せ手法

    河村 元, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）　Vol. 2008　No. 15　p. 39-46　2008年3月4日

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  23. Tanimoto係数の性質に基づく化合物の類似度検索の高速化手法

    清水 隆史, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）　Vol. 2008　No. 15　p. 47-54　2008年3月4日

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  24. 反応分類番号によるバスウェイアライメントの提案

    新免 剛, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO）　Vol. 2007　No. 21　p. 41-48　2007年3月5日

    出版者・発行元：一般社団法人情報処理学会

  25. D-7-9 CAGEデータに基づく組織特異的な代謝反応パスウェイの抽出(D-7.MEとバイオサイバネティックスA(バイオサイバネティックス),一般講演)

    迫岡 洋輔, 瀬尾 茂人, 瀧 浩平, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会総合大会講演論文集　Vol. 2006　No. 1　p. 63-63　2006年3月8日

    出版者・発行元：一般社団法人電子情報通信学会

著書 5

  1. 骨格筋の老化によるサルコペニアその理解と戦略 : 筋生物学を超えた総合知で、運動・栄養・創薬による介入をめざす!

    武田, 伸一

    羊土社　2025年3月

    ISBN: 9784758104258

  2. 実験医学 AIで識別してオミクスで理解する生体イメージング

    瀬尾茂人, 繁田浩功

    羊土社　2024年11月

  3. 実験医学2024年9,10,11月号

    松本寿健

    羊土社　2024年9月

  4. 医学のあゆみ 生体イメージングの最前線─絶え間ない技術革新と生命医科学の新展開

    瀬尾茂人, 長村徹

    医歯薬出版　2023年7月

  5. 骨格筋の維持機構を暴き、サルコペニアに挑む！

    上住聡芳

    羊土社　2020年10月

講演・口頭発表等 202

  1. AI時代のデータ解析プログラミング

    瀬尾茂人

    NGS EXPO 2024　2024年9月4日

  2. 細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析方法の開発への取り組み

    瀬尾茂人

    第46回 日本基礎老化学会大会　2023年6月17日

  3. バイオインフォマティクスツールのエコシステム

    瀬尾茂人

    NGS EXPO 2022　2022年10月19日

  4. 細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発

    瀬尾茂人

    学術変革(B)「セルコミュニティ」キックオフミーティング　2022年10月4日

  5. 1細胞発現解析と細胞画像処理，またその共同研究について

    瀬尾茂人

    大阪大学医学系研究科 第３回バイオインフォマティクスセミナー　2022年1月12日

  6. 生命科学データの情報処理について

    瀬尾茂人

    化学工学会 第52回秋季大会　2021年9月22日

  7. シングルセル発現解析ツールの動向について

    瀬尾茂人

    Single-Cell 2021 OSAKA Onlineセミナー シングルセルの免疫学への応用　2021年9月15日

  8. IT系から見たシングルセル遺伝子発現解析

    瀬尾茂人

    2018年5月

  9. バイオインフォマティクスのデータマイニング

    瀬尾茂人

    奈良先端科学技術大学院大学DSCトーク　2018年3月

  10. バイオイメージインフォマティクスと共同研究について

    瀬尾茂人

    日本生物工学会・バイオインフォマティクス相談部会第一回講演会　2017年12月

  11. バイオサイエンスのための生体医用画像

    瀬尾茂人

    生体医用画像研究会第3回若手の会　2016年3月

  12. イメージングデータの定量化とトランスオミクス解析

    瀬尾茂人

    2015年9月

  13. シングルセルデータ解析における前処理について

    瀬尾茂人

    NGS EXPO 2023　2023年11月16日

  14. 脂肪細胞におけるSTAT3を介したUCP1発現制御機構の解明

    疋田菜光, 岩瀬麻里, 川原崎聡子, 酒井章子, 坂本智弥, 大里直樹, 瀬尾茂人, 野村亘, 野村亘, 高橋春弥, 松田秀雄, 井上和生, 井上和生, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本栄養・食糧学会近畿支部大会および公開シンポジウム講演抄録集　2020年

  15. 一細胞遺伝子発現解析のためのJoint-NMFを用いたクラスタリング手法

    志賀幹夫, 瀬尾茂人, 鬼塚真, 松田秀雄

    第42回日本分子生物学会年会　2019年12月

  16. 脂肪組織におけるglycerol kinaseのUcp1発現制御機構

    岩瀬 麻里, 常盤 颯志, 瀬尾 茂人, 向井 貴子, 高橋 春弥, 野村 亘, Jheng Huei-Fen, 楠堂 達也, 大里 直樹, 松田 秀雄, 井上 和生, 河田 照雄, 後藤 剛

    肥満研究　2019年10月

  17. Single-cell transcriptome analysis of mouse leukocytes in inflammatory stimulation

    IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2019)　2019年10月

  18. Data Augmentation for Immune Cell Tracking using Random Walk Models and Generative Adversarial Networks

    Kenji Fujimoto, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    Bioimage Informatics 2019　2019年10月

  19. 細胞画像の領域分割のための敵対的生成ネットワークを用いた訓練データ生成手法

    藤本健二, 瀬尾茂人, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 松田秀雄

    第22回 画像の認識・理解シンポジウム (MIRU2019)　2019年8月

  20. A method for inferring gene regulatory networks based on pseudo time-series gene expression profiles from single-cell RNA-seq data

    27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)　2019年7月

  21. A study on novel estimation method of cell differentiation lineage by single cell trajectory inference

    27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)　2019年7月

  22. Single-cell RNA-seq analysis combined with live cell imaging on inflammatory response

    27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)　2019年7月

  23. 蛍光顕微鏡画像のための情報処理技術～グラフカットによる毛細血管の抽出

    瀬尾茂人, 池田わたる, 繁田浩功, 松田秀雄

    第2回蛍光ガイド手術研究会　2019年5月

  24. 白色脂肪組織の褐色化に対するglycerol kinaseの役割

    岩瀬麻里, 常盤颯志, 瀬尾茂人, 向井貴子, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huei‐Fen, 荒武, 楠堂達也, 大里直樹, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本栄養・食糧学会大会講演要旨集　2019年4月22日

  25. Data augmentation using image analogies for adipocyte image segmentation

    ISBI19 (IEEE International Symposium on Biomedical Imaging)　2019年4月

  26. DNN models and postprocessing thresholds for endoscopy artifact detection in practice”; Challenge on Endoscopy Artefacts Detection

    Multi-Class Artefact Detection in Video Endoscopy; CEUR Workshop Proceedings　2019年4月

  27. Cell Tracking and Quantitative Analysis for Microscopy Imaging Data

    Shigeto Seno

    UCSD-OU Workshop on Information Science for Future Society　2019年3月

  28. 生体蛍光観察動画像の深度を考慮した深層学習による細胞追跡精度の改善

    嶋田彩人, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 間下以大, 内田穣, 石井優, 松田秀雄

    第122回数理モデル化と問題解決研究発表会　2019年3月

  29. バイオインフォマティクスと機械学習

    瀬尾茂人

    阪大AI Meet UP　2019年2月

  30. Asymmetric Integration of Single-Cell Transcriptomic Data using Latent Dirichlet Allocation and Procrustes Analysis

    Mitsuhiro Eto, Wataru Hirota, Shigeto Seno, Hideo Matsuda

    IDASB2018 (The 9th Integrative Data Analysis in Systems Biology)　2018年12月3日

  31. Deep Learning Technique for Skeletal Muscle Image Analysis

    第６回若手による骨格筋細胞研究会　2018年11月

  32. Detection of Fusion Genes from Human Breast Cancer Cell-line RNA-Seq Data Using Shifted Short Read Clustering

    BIBE2018 (The 18th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering)　2018年10月

  33. IL‐1βが白色脂肪組織におけるUCP1発現誘導に及ぼす影響の検討

    新谷真和, 吉竹里依子, 岩瀬麻里, 高橋春弥, 野村亘, JHENG Huie‐Fun, 荒武, 大里直樹, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    肥満研究　2018年9月25日

  34. 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張

    赤沢 秀樹, 渡邊 誓旅, 繁田 浩功, 間下 以大, 瀬尾 茂人, 松田 秀雄

    2018年8月

  35. 生体イメージングによる破骨細胞の骨吸収動態の画像解析

    柳澤篤, 菊田順一, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 菊地和也, 松田秀雄, 石井優

    第36回日本骨代謝学会学術集会　2018年7月

  36. FGF21はPPARαアゴニスト摂取時の代謝異常改善に重要である

    岩瀬麻里, 平田茉莉子, 高橋春弥, JHENG Huei‐Fen, 野村亘, 荒武, 高橋信之, 高橋信之, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 阿部恵, 海老原健, 伊藤信行, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本栄養・食糧学会大会講演要旨集　2018年4月27日

  37. Ucp1発現を制御するnon‐coding RNAの探索と機能解析

    岩瀬麻里, 酒井章子, 瀬尾茂人, TONY Kuo, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huie‐Fun, 荒武, PAUL Horton, 大里直樹, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2018年3月5日

  38. DPP‐4阻害剤テネリグリプチンが脂肪組織のUCP‐1発現に与える影響

    澤崎穂菜美, 武田健一郎, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huei‐fen, 荒武, 高橋信之, 高橋信之, 大里直樹, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 河田照雄, 後藤剛

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)　2018年3月5日

  39. Pachinko Allocation Modelを用いたクラスタリングによるシングルセル発現解析手法

    広田航, 江藤充宏, 瀬尾茂人, 松田秀雄

    第117回数理モデル化と問題解決研究発表会　2018年3月

  40. 褐色脂肪細胞機能におけるglycerol kinaseの役割

    岩瀬麻里, 常盤颯志, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huei-Fun, 荒武, 大里直樹, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本食品科学工学会関西支部大会市民フォーラム講演要旨集　2018年

  41. Automated Transition Analysis of Activated Gene Regulation during Diauxic Nutrient Shift in Escherichia Coli and Adipocyte Differentiation in Mouse Cells

    APBC 2018 (The Sixteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference)　2018年1月

  42. Functional analysis of metagenome using composition-based method

    Meya Cho, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Yoichi Takenaka

    APBC 2018 (The Sixteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference), Yokohama, Japan　2018年1月

  43. Missing value imputation for gene expression data with Deep Learning

    Kazumasa Saito, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Yoichi Takenaka

    APBC 2018 (The Sixteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference), Yokohama, Japan　2018年1月

  44. 発現制御に関するmiRNAの探索及び機能解析

    酒井章子, 大久保麻里, 高橋春弥, 野村亘, 野村亘, JHENG Huie‐Fen, 荒武, 瀬尾茂人, 大里直樹, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    日本栄養・食糧学会近畿支部大会および公開シンポジウム講演抄録集　2017年11月1日

  45. Chromatin 3D reconstruction from chromosomal contacts using a genetic algorithm

    The 28th International Conference on Genome Informatics GIW/BIOINFO 2017　2017年11月

  46. 脂肪細胞特異的PPARα高発現マウスの糖代謝異常改善とメタボローム解析

    高橋春弥, 眞田康平, 永井宏幸, 青木ゆめこ, 伊藤哲朗, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 河田照雄, 河田照雄, 後藤剛, 後藤剛

    肥満研究　2017年9月22日

  47. Bone Marrow Cavity Segmentation using Graph-cuts with Wavelet-Based Texture Feature

    The 16th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2017)　2017年9月

  48. ディープラーニングを用いた脂肪組織画像における細胞の計数

    瀬尾茂人, 渡邊誓旅, 後藤剛, 竹中要一, 河田照雄, 松田秀雄

    第22回アディポサイエンス・シンポジウム　2017年8月

  49. 蛍光顕微鏡画像のためのグラフカットによる毛細血管の抽出手法

    嶋田彩人, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 池田わたる, 竹中要一, 松田秀雄

    MIRU2017　2017年8月

  50. Analyzing cell migration dynamics from intravital imaging by deformable image matching

    The 25th conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16th European Conference on Computation Biology (ISMB/ECCB 2017)　2017年7月

  51. Clustering of cells for single cell analysis using Latent Dirichlet Allocation

    Mitsuhiro Eto, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    2017年7月

  52. A method of bioimage analysis for spatial pattern of cellular interaction and intercalation

    Shigeto Seno, Masayuki Furuya, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2017年7月

  53. １細胞RNA-seqの特性を考慮した遺伝子発現差解析手法の検討

    大里直樹, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 松田秀雄

    NGS現場の会第5回研究会　2017年5月

  54. 一細胞解析のための潜在的ディリクレ配分法を用いた遺伝子群の機能予測手法

    江藤充宏, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    2017年5月

  55. 畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案

    薮崎隼人, 瀬尾茂人, 竹中要一, 後藤剛, 河田照雄, 松田秀雄

    第112回数理モデル化と問題解決研究発表会　2017年3月

  56. 細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法

    伊藤澄美, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    第112回数理モデル化と問題解決研究発表会　2017年3月

  57. 生体イメージング技術を駆使したトロンボモジュリンの新たな作用機序解明

    西澤志乃, 菊田順一, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 石井優

    BMB2015　2016年12月

  58. 粒子フィルタを用いた細胞核の追跡

    瀬尾茂人, 間下以大, 繁田浩功, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    外観検査アルゴリズムコンテスト2016　2016年12月

  59. A Bone Marrow Cavity Segmentation Method Using Wavelet-Based Texture Feature

    the 23rd International Conference on Pattern Recognition　2016年12月

  60. Comparative Analysis of Transformation Methods for Gene Expression Profiles in Breast Cancer Datasets

    Proceedings of 2016 IEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering; BIBE 2016　2016年10月

  61. 脂肪細胞特異的PPARα高発現が食餌誘導性の糖代謝異常に与える影響

    眞田康平, 高橋春弥, 永井宏幸, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 河田照雄, 後藤剛, 河田照雄, 後藤剛

    肥満研究　2016年9月20日

  62. 模様特徴量とグラフカットを利用した生体骨組織の骨髄腔の領域分割

    繁田浩功, 間下以大, 菊田順一, 瀬尾茂人, 石井優, 松田秀雄

    第5回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP-2016)　2016年9月

  63. A Method for Reducing False Positives of Target Genes of MicroRNAs by Combining Two Prediction Tools

    Hideo Matsuda, Junko Tsuda, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology　2016年7月

  64. An Accurate Estimation Method for Expression Profiles of Novel Transcripts from RNA-Seq Data

    Fuki Iwasaki, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology　2016年7月

  65. 画像処理とディープラーニングの手法を用いた病理診断支援

    渡邊誓旅, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田 秀雄

    2016年6月

  66. オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法

    松原周平, 瀬尾茂人, 西澤 志乃, 菊田 順一, 竹中 要一, 石井 優, 松田 秀雄

    2016年6月

  67. Bayesian network inference from gene expression profiles with a small number of samples

    International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)　2016年4月

  68. Dynamic analysis of gene regulations using leaving-one-out expression profile

    International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)　2016年4月

  69. 乳癌データベースを用いた遺伝子発現プロファイルの数値変換の検討

    草田義昭, 瀬尾茂人, 竹中要一, 野口眞三郎, 松田秀雄

    第45回バイオ情報学研究発表会　2016年3月

  70. 小サンプル数データに対するベイジアンネットワークのスコアベース構造学習改善手法

    齋藤和正, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    2016年3月

  71. Deep learningを用いた脂肪組織画像における細胞の認識

    水野雄太, 瀬尾茂人, 渡邊誓旅, 竹中要一, 平松拓郎, 後藤剛, 河田照雄, 松田秀雄

    2016年3月

  72. コンポーネントツリーとデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法

    藏重昂平, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    2016年3月

  73. オプティカルフローを用いた3次元生体イメージングデータからの細胞動態の解析

    藤代昂希, 瀬尾茂人, 竹中要一, 古家雅之, 菊田順一, 石井優, 松田秀雄

    2016年3月

  74. Intravital imaging of coupling between osteoblasts and osteoclasts by using multiphoton Microscopy

    American Society for Bone and Mineral Research: ASBMR　2015年9月

  75. Detecting the shifts of gene regulatory networks during time-course experiments with a single time point temporal resolution

    2015年9月

  76. 共通k-mer種別数に基づくメタゲノム分類手法

    吉田拓真, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    第4回NGS現場の会　2015年7月

  77. A method for predicting compound-protein interactions using canonical correlational analysis

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2010)　2015年7月

  78. 抗がん剤の薬効評価のための経時観察蛍光画像からのデータマイニング

    瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ2015　2015年6月

  79. ダイナミックベイジアンネットワークを用いた遺伝子制御ネットワーク推定の部分問題化による近似解法

    上木怜, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    第 42 回バイオ情報学(BIO)研究会　2015年6月

  80. オプティカルフローを用いた血管中を遊走する白血球の動態の解析手法

    松原周平, 瀬尾茂人, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2015年6月

  81. コンポーネントツリーを用いたグローバルデータアソシエーションによる細胞追跡手法

    藏重昂平, 瀬尾茂人, 間下以大, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    2015年6月

  82. A rendering method based on local maximum intensity projection for in vivo cellular imaging

    Ryo Taguchi, Shigeto Seno, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    Proceedings of Medical and Biological Imaging - JSMBE　2015年3月

  83. イベントヒストリー分析を用いたバイオイメージングデータの解析手法

    瀬尾茂人, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    第37回日本分子生物学会年会　2014年11月

  84. Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information

    Kohei Kurashige, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2014年10月

  85. An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data

    Kojiro Fukuda, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda

    2014年10月

  86. リードの由来階級の既知・未知予測に基づくメタゲノム配列の系統分類手法

    吉田 拓真, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告　2014年9月

  87. 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法

    藏重 昂平, 福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告　2014年9月

  88. A Segmentation Method for Bone Marrow Cavity Image Using Graph-Cuts

    2014年8月

  89. A Graph Cuts Image Segmentation Method for Quantifying Barrier Permeation in Bone Tissue

    1st Workshop on Pattern Recognition Techniques for Indirect Immunofluorescence Images Analysis　2014年8月

  90. Chronological analysis of regulatory strength on gene regulatory networks

    ECCB 2014　2014年7月

  91. ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法 (情報論的学習理論と機械学習)

    津田 絢子, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報　2014年6月25日

  92. ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法

    津田絢子, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2014年6月18日

  93. タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析

    福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    2014年6月

  94. マルチチャンネル蛍光顕微鏡動画のためのパーティクルフィルタを用いた細胞追跡手法

    小森康祐, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄

    第76回情報処理学会全国大会　2014年3月

  95. グラフカットを用いた骨髄腔画像の領域分割

    宇佐見 潤, 繁田 浩功, 間下 以大, 黒田 嘉宏, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 石井 優, 松田 秀雄, 竹村 治雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2014年2月24日

  96. 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法

    瀬尾 茂人, 間下 以大, 前田 栄, 竹中 要一, 石井 優, 松田 秀雄

    情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM）　2013年12月27日

  97. 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法

    渡邉 之人, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM）　2013年12月27日

  98. 時系列発現プロファイルを用いた時期特異的に機能するPPIサブネットワークの探索手法

    荒木 嶺, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    第36回日本分子生物学会年回　2013年12月

  99. 細胞のタイムラプスイメージングデータからの情報処理とデータマイニング

    瀬尾茂人

    定量生物学の会第六回年会　2013年11月

  100. Integrative prediction of miRNA-mRNA interactions from high-throughput sequencing data

    RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics; with DREAM Challenges 2013　2013年11月

  101. Estimating Intravital Concentration Gradient of Chemoattractant Based on Mathematical Models of Osteoclast Precursor Chemotaxis

    Towards comprehensive understanding of immune dynamism　2013年11月

  102. 長いリードを計算機で扱うのに完全線形符号が効果的だと思うのです。

    竹中要一, 瀬尾茂人, 松田秀雄

    NGS現場の会第三回研究会　2013年9月

  103. 多次元尺度構成法によるリード分類結果の視覚化

    吉田拓真, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    NGS現場の会第三回研究会　2013年9月

  104. RNA-seq データを用いたDifferential Alternative Splicing の検出ツールの比較考察

    川田愛明, 大野朋重, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    NGS現場の会第三回研究会　2013年9月

  105. 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法

    福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    第16回画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013　2013年8月

  106. Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法

    尾野貴広, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    第16回画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013　2013年7月

  107. Gene Set Enrichment Analysis for Time-Series Gene Expression Profile

    2013 IEEE EMBC　2013年7月

  108. Multiplication of Motif Occurrence Profiles for Metagenome Fragment Classification

    Naoki Matsushita, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    2013 IEEE EMBC　2013年7月

  109. Reconstruction of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Separation of Time-course Data

    2013年7月

  110. A Method of Sequence Analysis for High-Throughput Sequencer Data Based on Shifted Short Read Clustering

    BIOCOMP'13　2013年7月

  111. Gene Set Enrichment Analysis for a Long Time Series Gene Expression Profile

    2013年7月

  112. グラフカットを用いた生体骨組織における血管透過性の評価手法

    繁田 浩功, 間下 以大, 金子 雄, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 竹村 治雄, 松田 秀雄, 石井 優

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2013年3月14日

  113. Improvement of the Accuracy of Mapping by Composing Alleles

    奥田華代, 竹中要一, 大野朋重, 瀬尾茂人, 松田秀雄

    情報処理学会 第75回全国大会　2013年3月

  114. 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法

    渡邉之人, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2013年2月20日

  115. 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法

    瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2013年2月20日

  116. Measuring Transcript-Type Dependent Expression Levels of ncRNAs in RNA-Seq Analysis

    Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Hiromi Daiyasu, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    第35回日本分子生物学会年会　2012年12月

  117. An automatic cell-tracking method and spatiotemporal analysis for time-lapse multicolor fluorescent images of cell cycle

    第35回日本分子生物学会年会　2012年12月

  118. 多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法

    瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    View2012　2012年12月

  119. Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data

    GIW2012　2012年12月

  120. An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles

    GIW2012　2012年12月

  121. 多色蛍光タイムラプスイメージングによる細胞周期観測データのための細胞自動追跡手法

    瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄

    バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2012　2012年11月

  122. Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis

    Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology　2012年10月

  123. Comparison of Gene Expressions measured by RNA-seq and Microarray for Transcriptome Analysis of Adipose Tissues

    Joint Conference on Informatics is Biolog, Medicine and Pharmacology　2012年10月

  124. Two-stage method to infer gene regulatory network utilizing Link Prediction

    Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology　2012年10月

  125. Estimation of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Splitting Time Course Data

    2012年10月

  126. Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile

    Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology　2012年10月

  127. Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle

    Towards Comprehensive Understanding of Immune Dynamism 2012　2012年10月

  128. A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images

    Bioimage Informatics 2012　2012年9月

  129. Reduced noise in gene expression caused by a replaced foreign promoter

    應ベイ文, 津留三良, 瀬尾茂人, 松田秀雄, 四方哲也

    日本進化学会第14回東京大会　2012年8月

  130. Perfect linear code reduces the solution space of genome mapping from 1+3n to 22.2 + 0.00879n to find one-mismatch for n-mer short reads

    Special Interest Group Meetings of High-Throughput Sequencing at International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012)　2012年7月

  131. All the 1+3n one-mismatch sequences of n-mer DNA are involved in 22.2+0.00879n strings of Perfect Linear Code words on DNA

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2012)　2012年7月

  132. 時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法(一般,機械学習によるバイオデータマインニング,一般)

    大熊 祐太, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング　2012年6月21日

  133. 時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法

    大熊 祐太, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2012年6月21日

  134. A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping

    Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    情報処理学会研究報告　2012年6月

  135. A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping

    Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    情報処理学会論文誌. バイオ情報学　2012年4月19日

  136. SF-090-4 疾患プロテオミクスによる大腸癌新規関連タンパク質マルチマーカーの開発(SF-090 サージカルフォーラム(90)大腸 基礎-3(遺伝子),第112回日本外科学会定期学術集会)

    賀川 義規, 竹政 伊知朗, 松尾 英一, 金子 直樹, 瀬尾 茂人, 渡辺 真, 西村 潤一, 水島 恒和, 池田 正孝, 山本 浩文, 関本 貢嗣, 松田 秀雄, 西村 紀, 土岐 祐一郎, 森 正樹

    日本外科学会雑誌　2012年3月5日

  137. 近隣リードを考慮したショートリードクラスタリングによる塩基配列構造情報の有向非循環グラフ表現

    上田 大介, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2012年2月23日

  138. An Estimation Method for Inference of Gene Regulatory Network Using Bayesian Network with Uniting of Partial Problems

    The Tenth Asia Pacific Bioinformatics Conference　2012年1月

  139. A random forest approach to the detection of a rare disease in the case control studies

    Genome Informatics Workshop 2011　2011年12月

  140. Inference of S-system Models of Gene Regulatory Networks using Immune Algorithm

    Genome Informatics Workshop 2011　2011年12月

  141. Network analysis for time-series expression profile using nested effects models

    The Proceedings of the 2011 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2011年11月

  142. Detect unique gene regulatory networks along dendrogram of cell differentiation

    InCoB/ISCB-Asia Joint Conference 2011　2011年11月

  143. Sequence determination and expression estimation of alleles from RNA-Seq data

    InCoB/ISCB-Asia Joint Conference 2011　2011年11月

  144. Mutation-aware clustering with error correction for short-read genome mapping

    The Proceedings of the 2011 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2011年11月

  145. Perfect Hamming code with a hash table for faster genome mapping

    InCoB/ISCB-Asia Joint Conference 2011　2011年11月

  146. Size evolution with a laboratory Escherichia coli strain

    International Symposium on Synthesizing life and biological systems　2011年10月

  147. Perfect Hamming Code as Hash key for Fast Genome Mapping

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)　2011年7月

  148. Feature selection for specifying experimental conditions that activate gene transcriptions

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)　2011年7月

  149. A method for risk predicition of a serious disease using rule-based analysis

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)　2011年7月

  150. A Method for Inference of Gene Regulatory Network based on Bayesian Network with Uniting of Partial Problems

    Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)　2011年7月

  151. A Directed Graphical Gaussian Model for Inferring Gene Regulatory Networks

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)　2011年7月

  152. 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法(合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般)

    池田 成吾, 木戸 善之, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング　2011年6月16日

  153. 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法

    吉澤 陽志, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2011年2月28日

  154. A Bootstrapping Method of S-system Model for Estimating Timeline Gene Regulatory Networks

    The Proceedings of the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2010年12月

  155. An Improved RNA-Seq Analysis Method for Isoform Prediction by Iterative Mapping

    The 21st International Conference on Genome Informatics　2010年12月

  156. メタデータを利用した生物情報解析ワークフローの作成支援手法の提案

    福本貴紀, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会関西支部　2010年9月

  157. Revealing Regulatory Relationships of Crosstalk with Multiple Time-series Gene Expression Profiles

    The Proceedings of the 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2010年9月

  158. A metadata management system for composing bioinformatics workflows

    9th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)　2010年9月

  159. An algorithm for fast exact search of chemical compounds by clustered data beforehand

    21st International Workshop on Combinatorial Algorithms　2010年7月

  160. A method for detecting structural variants from massive paired end genome sequences by mapping signatures

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2010)　2010年7月

  161. An Estimation Method of S-system Model of Gene Regulatory Networks Using Immune Algorithm

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2010)　2010年7月

  162. 立体構造情報と機能情報によるタンパク質間相互作用予測法の改良

    吉川達也, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会研究報告　2010年3月

  163. Tanimoto係数を用いた類似化合物検索のクラスタリングによる高速化手法

    グエンカムリー, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2010年2月25日

  164. A Method of Estimation of Crosstalk Genes with Multiple Time-Series Gene Expression Profiles

    The 20th International Conference on Genome Informatics　2009年12月

  165. A Method for the Inference of Gene Regulatory Networks based on Dynamic Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences

    The 20th International Conference on Genome Informatics　2009年12月

  166. A Method for Extraction of the Active Compound Groups which Have Strong Relationship between Structure and Activity

    The 20th International Conference on Genome Informatics　2009年12月

  167. A Method for Efficient Execution of Bioinformatics Workflows

    Genome Informatics　2009年12月

  168. A method for analyzing gene expression profiles based on the underlying structures

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2009)　2009年7月

  169. A Method for Inference of Gene Regulatory Networks based on Bayesian Network with Clustering of Time-Series Subsequences

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2009)　2009年7月

  170. Webサービス情報の統合のためのレポジトリ連携手法の提案

    野中 崇史, 瀬尾 淳哉, 木戸 善之, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2009年2月26日

  171. The Validity Evaluation of Gene Regulatory Network Motifs Based on Differential Equation Model

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月

  172. Architecture of an Efficient Data Transfer System and Manager for Genome-wide Analysis Workflows

    The 3rd MEI International Symposium 2008　2008年12月

  173. An Efficient Data Transfer on Workflows for Genome-wide Analysis

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月

  174. A Method for Analysis of Tissue-Specific Transcriptional Control Using Distributions of Transcription Starting Sites

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月

  175. A Method for Reducing Bounds of Compound Search by Dividing Structure Key

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月

  176. A Method for Making a New Reference Set of PDB Entries for Retrieving Protein 3D Structures with Structural Annotations

    The Proceedings of the 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics　2008年12月

  177. 脂肪細胞・骨芽細胞分化における遺伝子制御ネットワークの推定

    松田秀雄, 竹中要一, 水野洋介, 瀬尾茂人, 徳澤佳美, 仲地豊, 坊農秀雅, 岡崎康司

    第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会大会合同大会　2008年12月

  178. 構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法

    清水隆史, 木戸善之, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    情報処理学会バイオ情報学研究会報告　2008年9月

  179. A method for analysis of tissue-specific alternative transcripts using CAGE tags

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2008)　2008年7月

  180. A Data Transmission Method for Web Services in Bioinformatics Workflows

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2008)　2008年7月

  181. A Clustering Method for Expression Patterns of Transcription Starting Sites

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2008)　2008年7月

  182. 化合物フィンガープリントを用いた活性サブクラスの抽出手法

    岸本 貴大, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    日本分子生物学会第8回春季シンポジウム　2008年5月

  183. CAGE発現プロファイルを用いた転写開始点の発現パターンのクラスタリング手法

    寺家谷満, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田 秀雄

    日本分子生物学会第8回春季シンポジウム　2008年5月

  184. 5ZK-10 大規模な化合物データベースからの類似化合物探索手法(情報爆発時代におけるマルチメディアデータと位置依存情報処理,学生セッション,「情報爆発」時代に向けた新しいIT基盤技術)

    河村 元, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    全国大会講演論文集　2008年3月13日

  185. Tanimoto係数の性質に基づく化合物の類似度検索の高速化手法

    清水 隆史, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2008年3月3日

  186. 化合物活性予測のためのTanimoto係数とRandom ForestのProximity Measureの組合せ手法

    河村 元, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2008年3月3日

  187. TF-IDFフィルタリングによる機能的に類似した生物情報解析ワークフローの検索手法

    瀬尾 淳哉, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告　2007年12月20日

  188. グラフ構造を用いた組織特異的な選択的スプライシングの解析手法

    瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    日本分子生物学会第30回大会　2007年12月

  189. A Method for Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows

    Proceedings of 2007 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics　2007年12月

  190. 情報解析ワークフローにおけるデータ転送経路の効率化

    瀬尾淳哉, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    日本ソフトウェア科学会第２４回大会　2007年9月

  191. 反応分類番号によるパスウェイアライメントの提案

    新免 剛, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄

    情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学　2007年3月5日

  192. CAGEタグを用いたゲノム領域上の共通発現パターン探索手法

    瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    分子生物学会2006フォーラム　2006年12月

  193. 構造記述子の情報量に基づく類似活性化合物の探索手法

    木村浩章, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄

    第34回構造活性相関シンポジウム　2006年11月

  194. Extraction of Functionally Similar Bioinformatics Workflows

    6th International Workshop on Distibuted Applications; Web Services; Tools and GRID Infrastructures for Bioinformatics (NETTAB 2006)　2006年7月

  195. CAGEデータに基づく組織特異的な代謝反応パスウェイの抽出(D-7.MEとバイオサイバネティックスA(バイオサイバネティックス),一般講演)

    迫岡 洋輔, 瀬尾 茂人, 瀧 浩平, 竹中 要一, 松田 秀雄

    電子情報通信学会総合大会講演論文集　2006年3月8日

  196. A method for clustering gene expression data based on graph structure

    Genome Informatics　2004年12月

  197. 遺伝子発現プロファイル間の局所的な類似性を考慮したクラスタリング手法

    瀬尾茂人, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄

    第27回日本分子生物学会年会　2004年12月

  198. 相対エントロピーとグラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法

    瀬尾茂人, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄

    第26回日本分子生物学会年会　2003年12月

  199. P-Quasi complete linkage clustering method for gene-expression profiles based on distribution analysis

    International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology　2003年7月

  200. P-Quasi Complete Linkage Analysis for Gene-Expression Data

    Proceedings of 1st IEEE Computer Society Bioinformatics Conference (CSB2002)　2002年12月

  201. グラフ構造に基づく遺伝子発現プロファイルのクラスタリング手法

    瀬尾茂人, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄

    第25回日本分子生物学会年

  202. 準完全グラフ構造に基づく発現プロファイルのクラスタリング手法

    瀬尾茂人, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄

    第2回情報科学技術フォーラム

特許・実用新案・意匠 2

  1. マルチプレックス大腸がんマーカーパネル

    渡辺真, 松尾英一, 金子直樹, 森正樹, 西村紀, 竹政伊知朗, 松田秀雄, 瀬尾茂人, 松原稔哉

    特許5805518

    出願日:2011/12/21

    登録日:2015/09/11

  2. 評価方法、評価装置およびプログラム

    石井優, 菊田順一, 松田秀雄, 瀬尾茂人

    出願日:2018/01/19

機関リポジトリ 11

大阪大学の学術機関リポジトリ（OUKA）に掲載されているコンテンツ

  1. IRSN-23 gene diagnosis enhances breast cancer subtype classification and predicts response to neoadjuvant chemotherapy: new validation analyses

    Sota Yoshiaki, Seno Shigeto, Naoi Yasuto, Honma Keiichiro, Shimoda Masafumi, Tanei Tomonori, Matsuda Hideo, Shimazu Kenzo

    Breast Cancer　2025年3月24日

  2. Plasma proteomics profile-based comparison of torso versus brain injury: A prospective cohort study

    Tachino Jotaro, Togami Yuki, Matsumoto Hisatake, Matsubara Tsunehiro, Seno Shigeto, Ogura Hiroshi, Oda Jun

    Journal of Trauma and Acute Care Surgery　Vol. 97　No. 4　p. 557-565　2024年10月1日

  3. Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation

    Miyamoto Yu, Kikuta Junichi, Matsui Takahiro, Hasegawa Tetsuo, Fujii Kentaro, Okuzaki Daisuke, Liu Yu Chen, Yoshioka Takuya, Seno Shigeto, Motooka Daisuke, Uchida Yutaka, Yamashita Erika, Kobayashi Shogo, Eguchi Hidetoshi, Morii Eiichi, Tryggvason Karl, Shichita Takashi, Kayama Hisako, Atarashi Koji, Kunisawa Jun, Honda Kenya, Takeda Kiyoshi, Ishii Masaru

    Nature　Vol. 629　p. 901-909　2024年5月23日

  4. Association between tranexamic acid administration and mortality based on the trauma phenotype: a retrospective analysis of a nationwide trauma registry in Japan

    Tachino Jotaro, Senoo Shigeto, Matsumoto Hisatake, Kitamura Tetsuhisa, Hirayama Atsushi, Nakao Shunichiro, Katayama Yusuke, Ogura Hiroshi, Oda Jun

    Critical Care　Vol. 28　2024年3月19日

  5. Osteoclasts adapt to physioxia perturbation through DNA demethylation

    Nishikawa Keizo, Seno Shigeto, Yoshihara Toshitada, Narazaki Ayako, Sugiura Yuki, Shimizu Reito, Kikuta Junichi, Sakaguchi Reiko, Suzuki Norio, Takeda Norihiko, Semba Hiroaki, Yamamoto Masamichi, Okuzaki Daisuke, Motooka Daisuke, Kobayashi Yasuhiro, Suematsu Makoto, Koseki Haruhiko, Matsuda Hideo, Yamamoto Masayuki, Tobita Seiji, Mori Yasuo, Ishii Masaru

    EMBO Reports　Vol. 22　No. 12　2021年12月6日

  6. SLPI is a critical mediator that controls PTH-induced bone formation

    Morimoto Akito, Kikuta Junichi, Nishikawa Keizo, Sudo Takao, Uenaka Maki, Furuya Masayuki, Hasegawa Tetsuo, Hashimoto Kunihiko, Tsukazaki Hiroyuki, Seno Shigeto, Nakamura Akira, Okuzaki Daisuke, Sugihara Fuminori, Ninomiya Akinori, Yoshimura Takeshi, Takao-Kawabata Ryoko, Matsuda Hideo, Ishii Masaru

    Nature Communications　Vol. 12　No. 1　2021年4月9日

  7. Migration arrest of chemoresistant leukemia cells mediated by MRTF-SRF pathway

    Morimatsu Maho, Yamashita Erika, Seno Shigeto, Sudo Takao, Kikuta Junichi, Mizuno Hiroki, Okuzaki Daisuke, Motooka Daisuke, Ishii Masaru

    Inflammation and Regeneration　Vol. 40　No. 1　2020年12月1日

  8. Development of an intravital imaging system for the synovial tissue reveals the dynamics of CTLA-4 Ig in vivo

    Hasegawa Tetsuo, Kikuta Junichi, Sudo Takao, Yamashita Erika, Seno Shigeto, Takeuchi Tsutomu, Ishii Masaru

    Scientific Reports　Vol. 10　No. 1　2020年8月10日

  9. Thrombomodulin induces anti-inflammatory effects by inhibiting the rolling adhesion of leukocytes in vivo

    Nishizawa Shino, Kikuta Junichi, Seno Shigeto, Kajiki Masahiro, Tsujita Ryuichi, Mizuno Hiroki, Sudo Takao, Ao Tomoka, Matsuda Hideo, Ishii Masaru

    Journal of Pharmacological Sciences　Vol. 143　No. 1　p. 17-22　2020年5月1日

  10. In vivo dynamic analysis of BMP-2-induced ectopic bone formation

    Hashimoto Kunihiko, Kaito Takashi, Furuya Masayuki, Seno Shigeto, Okuzaki Daisuke, Kikuta Junichi, Tsukazaki Hiroyuki, Matsuda Hideo, Yoshikawa Hideki, Ishii Masaru

    Scientific Reports　Vol. 10　No. 1　2020年3月16日

  11. トランスクリプトーム解析のための遺伝子発現プロファイルの分類手法および類似構造探索に関する研究

    瀬尾 茂人