keyword 生成AI、深層学習、ビッグデータ
広島大学大学院 先進理工系科学研究科
2016年10月 ～ 2019年9月
広島大学 大学院先進理工系科学研究科
2014年10月 ～ 2016年9月
ADMA 学協会
2024年 ～ 継続中
IJCAI 学協会
2024年1月 ～ 継続中
ICLR 学協会
2024年1月 ～ 継続中
AISTATS
2023年10月 ～ 継続中
IEEE BIBM 学協会
2023年 ～ 継続中
IEEE BigData 学協会
2023年 ～ 継続中
ICML 学協会
2021年1月 ～ 継続中
NeurIPS 学協会
2021年1月 ～ 継続中
AAAI 学協会
2021年1月 ～ 継続中
ECAI
2023年 ～
情報通信 / 知能情報学 / 生成AI、深層学習、ビッグデータ
ADMA Special Session Best Paper Award
2024年12月
AAAI Outstanding Paper Award
2024年2月
Excellent Presentation Award
CBI 2023 2023年10月
IEEE Outstanding Leadership Award
2022年12月
Excellent Presentation Award
CBI 2021 2021年10月
Advanced Global Engineer
Hiroshima University 2019年9月
SSL-VQ: Vector-quantized variational autoencoders for semi-supervised prediction of therapeutic targets across diverse diseases
Satoko Namba, Chen Li, Noriko Otani, Yoshihiro Yamanishi
Bioinformatics 2025年1月28日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)
De novo generation of dual-target compounds using artificial intelligence
Kasumi Yasuda, Francois Berenger, Kazuma Amaike, Ayaka Ueda, Tomoya Nakagomi, Genki Hamasaki, Chen Li, Noriko Yuyama Otani, Kazuma Kaitoh, Koji Tsuda, Kenichiro Itami, Yoshihiro Yamanishi
iScience Vol. 28 No. 1 p. 111526-111526 2025年1月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
AI-driven transcriptome profile-guided hit molecule generation
Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Artificial Intelligence 2025年1月 研究論文（学術雑誌）
Advancing Aspect-Based Sentiment Analysis Through Deep Learning Models
Chen Li, Huidong Tang, Jinli Zhang, Xiujing Guo, Debo Cheng, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science p. 228-242 2024年12月14日 論文集(書籍)内論文
出版者・発行元：Springer Nature Singapore
When Molecular GAN Meets Byte-Pair Encoding
Huidong Tang, Chen Li, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science p. 160-174 2024年12月13日 論文集(書籍)内論文
出版者・発行元：Springer Nature Singapore
Tailored Federated Learning: Leveraging Direction Regulation and Knowledge Distillation
Huidong Tang, Chen Li, Huachong Yu, Sayaka Kamei, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science p. 270-284 2024年12月13日 論文集(書籍)内論文
出版者・発行元：Springer Nature Singapore
Mining area skyline objects from map-based big data using Apache Spark framework
Chen Li, Ye Zhu, Yang Cao, Jinli Zhang, Annisa Annisa, Debo Cheng, Yasuhiko Morimoto
Array 2024年12月 研究論文（学術雑誌）
Eficient docking simulation-based generation of bioactive compounds with deep generative model
Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2024年10月
Predicting Drug-Target Interactions by Measuring Confidence with Consistent Causal Neighborhood Interventions.
Wenting Ye, Chen Li, Wen Zhang, Jiuyong Li, Lin Liu, Debo Cheng, Zaiwen Feng
Methods (San Diego, Calif.) 2024年8月30日 研究論文（学術雑誌）
Transcriptionally Conditional Recurrent Neural Network for De Novo Drug Design.
Yuki Matsukiyo, Atsushi Tengeiji, Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Journal of chemical information and modeling Vol. 64 No. 15 p. 5844-5852 2024年8月12日 研究論文（学術雑誌）
Quantitative evaluation of molecular generation performance of graph-based GANs
Jinli Zhang, Zhenbo Wang, Zongli Jiang, Man Wu, Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Software Quality Journal Vol. 32 No. 2 p. 791-819 2024年6月 研究論文（学術雑誌）
Ripple Knowledge Graph Convolutional Networks for Recommendation Systems
Chen Li, Yang Cao, Ye Zhu, Debo Cheng, Chengyuan Li, Yasuhiko Morimoto
Machine Intelligence Research Vol. 21 No. 3 p. 481-494 2024年6月 研究論文（学術雑誌）
Two-way Recommendation System for Supervisor Selection using Historical Data and Skyband-view Queries
Annisa Annisa, Muhammad Rayhan Adyatma, Global Ilham Sampurno, Chen Li
Journal of Advanced Research in Applied Sciences and Engineering Technology Vol. 34 No. 2 p. 305-314 2024年4月 研究論文（学術雑誌）
GxVAEs: Two Joint VAEs Generate Hit Molecules from Gene Expression Profiles
Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence Vol. 38 No. 12 p. 13455-13463 2024年3月25日 研究論文（国際会議プロシーディングス）
Molecular Generative Adversarial Network with Multi-Property Optimization
Chen Li
ArXiv 2024年 研究論文（学術雑誌）
機械学習による治療標的分子の予測と希 少疾患への応用
第10回CBI学会個別化医療研究会 2024年
TenGAN: Pure Transformer Encoders Make an Efficient Discrete GAN for De Novo Molecular Generation
Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Proceedings of Machine Learning Research Vol. 238 p. 361-369 2024年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
MacGAN: A Moment-Actor-Critic Reinforcement Learning-Based Generative Adversarial Network for Molecular Generation
Huidong Tang, Chen Li, Shuai Jiang, Huachong Yu, Sayaka Kamei, Yoshihiro Yamanishi, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14331 LNCS p. 127-141 2024年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
EarlGAN: An enhanced actor–critic reinforcement learning agent-driven GAN for de novo drug design
Huidong Tang, Chen Li, Shuai Jiang, Huachong Yu, Sayaka Kamei, Yoshihiro Yamanishi, Yasuhiko Morimoto
Pattern Recognition Letters Vol. 175 p. 45-51 2023年11月 研究論文（学術雑誌）
FedMCC: Federated multi-center clustering algorithm to improve privacy healthcare.
Zhiwei An, Jinli Zhang, Zongli Jiang, Jinlian Du, Zhiyi Yin, Chen Li
Methods (San Diego, Calif.) Vol. 218 p. 94-100 2023年10月 研究論文（学術雑誌）
Convolutional autoencoder based on latent subspace projection for anomaly detection.
Qien Yu, Chen Li, Ye Zhu, Takio Kurita
Methods (San Diego, Calif.) Vol. 214 p. 48-59 2023年6月 研究論文（学術雑誌）
CPU使用率データを用いたクラウドデータセンターの性能評価に関する考察
LI Chen, ZHENG Junjun, OKAMURA Hiroyuki, DOHI Tadashi
電子情報通信学会技術研究報告(Web) Vol. 121 No. 276(R2021 34-38) 2023年1月18日
A note on Markovian arrival process parameter estimation of quasi-birth-death queueing systems with utilization data
2023年
Saffold-retained transformer GAN for molecular generation with chemical property optimization
2023年
複数の治療標的分子にデュアルで作用す る医薬品化合物を構造生成するAI開発
2023年
A Session Recommendation Model Based on Heterogeneous Graph Neural Network
Zhiwei An, Yirui Tan, Jinli Zhang, Zongli Jiang, Chen Li
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14119 LNAI p. 160-171 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
An Enhanced Distributed Algorithm for Area Skyline Computation Based on Apache Spark
Chen Li, Yang Cao, Ye Zhu, Jinli Zhang, Annisa Annisa, Debo Cheng, Huidong Tang, Shuai Jiang, Kenta Maruyama, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14120 LNAI p. 35-43 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
A Visual Interpretation-Based Self-improved Classification System Using Virtual Adversarial Training
Shuai Jiang, Sayaka Kamei, Chen Li, Shengzhe Hou, Yasuhiko Morimoto
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14179 LNAI p. 548-562 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
Semi-supervised Classification Based on Graph Convolution Encoder Representations from BERT
Jinli Zhang, Zongli Jiang, Chen Li, Zhenbo Wang
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14178 LNAI p. 199-213 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
Senti-EGCN: An Aspect-Based Sentiment Analysis System Using Edge-Enhanced Graph Convolutional Networks
Chen Li, Junjun Zheng, Peng Ju, Yasuhiko Morimoto
Proceedings - 2023 10th International Conference on Dependable Systems and Their Applications, DSA 2023 p. 722-729 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
Mode Collapse Alleviation of Reinforcement Learning-based GANs in Drug Design
Zongli Jiang, Zhenbo Wang, Jinli Zhang, Man Wub, Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Proceedings - 2023 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2023 p. 3045-3052 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Causal Intervention for Measuring Confidence in Drug-Target Interaction Prediction
Wenting Ye, Chen Li, Yang Xie, Wen Zhang, Hong Yu Zhang, Bowen Wang, Debo Cheng, Zaiwen Feng
Proceedings - 2023 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2023 p. 395-400 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
SpotGAN: A Reverse-Transformer GAN Generates Scaffold-Constrained Molecules with Property Optimization
Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) Vol. 14169 LNAI p. 323-338 2023年 研究論文（国際会議プロシーディングス）
Performance Evaluation of a Cloud Datacenter Using CPU Utilization Data
CHEN LI, Junjun Zheng, Hiroyuki Okamura, Tadashi Dohi
Mathematics Vol. 11 No. 3 2023年1月 研究論文（学術雑誌）
Hierarchical Categorical Generative Modeling for Multi-omics Cancer Subtyping
Ziwei Yang, Lingwei Zhu, Chen Li, Zheng Chen, Naoki Ono, Md Altaf-Ul-Amin, Shigehiko Kanaya
2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) p. 1350-1355 2022年12月6日 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Automatic Sleep Staging via Frequency-Wise Spiking Neural Networks
Haohui Jia, Ziwei Yang, Pei Gao, Man Wu, Chen Li, Yirong Kan, Renyuan Zhang
2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) p. 1028-1033 2022年12月6日 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Exploring the Feasibility of Transformer Based Models on Question Relatedness
Honglin Shu, Pei Gao, Ziwei Yang, Chen Li, Man Wu
2022 IEEE 24th Int Conf on High Performance Computing & Communications; 8th Int Conf on Data Science & Systems; 20th Int Conf on Smart City; 8th Int Conf on Dependability in Sensor, Cloud & Big Data Systems & Application (HPCC/DSS/SmartCity/DependSys) 2022年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Matching Using Sufficient Dimension Reduction for Heterogeneity Causal Effect Estimation
Haoran Zhao, Yinghao Zhang, Debo Cheng, Chen Li, Zaiwen Feng
2022 IEEE 24th Int Conf on High Performance Computing & Communications; 8th Int Conf on Data Science & Systems; 20th Int Conf on Smart City; 8th Int Conf on Dependability in Sensor, Cloud & Big Data Systems & Application (HPCC/DSS/SmartCity/DependSys) 2022年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
An Efficient Transformer Encoder-Based Classification of Malware Using API Calls
Chen Li, Zheng Chen, Junjun Zheng
2022 IEEE 24th Int Conf on High Performance Computing & Communications; 8th Int Conf on Data Science & Systems; 20th Int Conf on Smart City; 8th Int Conf on Dependability in Sensor, Cloud & Big Data Systems & Application (HPCC/DSS/SmartCity/DependSys) 2022年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Transformer-based Objective-reinforced Generative Adversarial Network to Generate Desired Molecules
Chen Li, Chikashige Yamanaka, Kazuma Kaitoh, Yoshihiro Yamanishi
Proceedings of the Thirty-First International Joint Conference on Artificial Intelligence p. 3884-3890 2022年7月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：International Joint Conferences on Artificial Intelligence Organization
Software Reliability Prediction through Encoder-Decoder Recurrent Neural Networks
Chen Li, Junjun Zheng, Hiroyuki Okamura, Tadashi Dohi
International Journal of Mathematical, Engineering and Management Sciences Vol. 7 No. 3 p. 325-340 2022年5月8日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Ram Arti Publishers
Molecular generation using sequence-based transformer generative adversarial network
2022年
Parameter Estimation of Markovian Arrivals with Utilization Data
Chen LI, Junjun ZHENG, Hiroyuki OKAMURA, Tadashi DOHI
IEICE Transactions on Communications Vol. E105.B No. 1 p. 1-10 2022年1月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Institute of Electronics, Information and Communications Engineers ({IEICE})
Hierarchical Bayesian Parameter Estimation of Queueing Systems using Utilization Data
Li Chen, Zheng Junjun, Okamura Hiroyuki, Dohi Tadashi
International Journal of Performability Engineering Vol. 18 No. 5 p. 307-307 2022年 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Totem Publisher, Inc.
API Call-Based Malware Classification Using Recurrent Neural Networks
Chen Li, Junjun Zheng
Journal of Cyber Security and Mobility Vol. 10 No. 3 p. 617-640 2021年5月27日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：River Publishers
Privacy-preserving Top-k Dominating Queries in Distributed Multi-party Databases
Mahboob Qaosar, Kazi Md. Rokibul Alam, Chen Li, Yasuhiko Morimoto
2019 IEEE International Conference on Big Data (Big Data) 2019年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Secure k-Skyband Computation Framework in Distributed Multi-party Databases
CHEN LI
Information Sciences 2019年12月 研究論文（学術雑誌）
A Multi-factor Approach for Stock Price Prediction by using Recurrent Neural Networks
Xu Zhang, Chen Li, Yasuhiko Morimoto
Bulletin of Networking, Computing, Systems, and Software Vol. 8 No. 1 p. 9-13 2019年10月
Multi-factor Based Stock Price Prediction Using Hybrid Neural Networks with Attention Mechanism
Chen Li, Xu Zhang, Mahboob Qaosar, Saleh Ahmed, Kazi Md. Rokibul Alam, Yasuhiko Morimoto
2019 IEEE Intl Conf on Dependable, Autonomic and Secure Computing, Intl Conf on Pervasive Intelligence and Computing, Intl Conf on Cloud and Big Data Computing, Intl Conf on Cyber Science and Technology Congress (DASC/PiCom/CBDCom/CyberSciTech) p. 961-966 2019年8月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
Privacy-Aware MapReduce Based Multi-Party Secure Skyline Computation
Saleh Ahmed, Mahboob Qaosar, Asif Zaman, Md. Anisuzzaman Siddique, Chen Li, Kazi Md. Rokibul Alam, Yasuhiko Morimoto
Information Vol. 10 No. 6 p. 207-207 2019年6月8日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：MDPI AG
A Framework for Privacy-Preserving Multi-Party Skyline Query Based on Homomorphic Encryption
Qaosar, M., Alam, K.M.R., Zaman, A., Li, C., Ahmed, S., Siddique, M.A., Morimoto, Y.
IEEE Access Vol. 7 p. 167481-167496 2019年 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Institute of Electrical and Electronics Engineers ({IEEE})
Parameter Estimation of M-{t}/M/1/K Queueing Systems with Utilization Data
Li, C., Okamura, H., Dohi, T.
IEEE Access Vol. 7 p. 42664-42671 2019年 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Institute of Electrical and Electronics Engineers ({IEEE})
Capturing Temporal Dynamics of Users’ Preferences from Purchase History Big Data for Recommendation System
Chen Li, Minjia He, Mahboob Qaosar, Saleh Ahmed, Yasuhiko Morimoto
2018 IEEE International Conference on Big Data (Big Data) 2018年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
MapReduce Algorithm for Location Recommendation by Using Area Skyline Query
CHEN LI
Algorithms 2018年11月25日 研究論文（学術雑誌）
Positional Isomers of Chromophore-Peptide Conjugates Self-Assemble into Different Morphologies.
Urszula Lewandowska, Stefano Corra, Wojciech Zajaczkowski, Nellie A K Ochs, Michal S Shoshan, Junki Tanabe, Sebastian Stappert, Chen Li, Eiji Yashima, Wojciech Pisula, Klaus Müllen, Helma Wennemers
Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) Vol. 24 No. 48 p. 12623-12629 2018年8月27日 研究論文（学術雑誌）
Hybrid sensing and wearable smart device for health monitoring and medication: opportunities and challenges
M. Qaosar, S. Ahmed, Chen Li, Y. Morimoto
2018年3月
MapReduce-based computation of area skyline query for selecting good locations in a map
Chen Li, Annisa, Asif Zaman, Yasuhiko Morimoto
2017 IEEE International Conference on Big Data (Big Data) 2017年12月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：IEEE
深層学習のソフトウェア信頼性とサイバーセキュリティへの応用
李晨, 鄭俊俊
オペレーションズ・リサーチ Vol. 68 No. 5 p. 250-258 2023年5月
APIコールを用いたTransformer Encoderベースマルウェア分類に関する考察
LI Chen, ZHENG Junjun
電子情報通信学会技術研究報告(Web) Vol. 122 No. 203(R2022 32-39) 2022年
深層学習による遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的分子の予測と希少疾患への応用
難波里子, 李晨, 大谷則子, 山西芳裕
日本薬学会第145回 2025年3月26日
Transformer GANを用いた化学特性の最適化を目指した分子生成 [in Japanese] (Transformer GAN-based molecular generation with property optimization
Chen Li
the 455th Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2024年5月
Transformer GANを用いた化学特性の最適化を目指した分子生成
Chen Li
The 455th Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2024年
Gene Expression Data-Driven Scaffold-Constrained Molecular Structure Generation by Deep Neural Network
Matsukiyo, Y., Yamanaka, C., Li, C., Yamanishi, Y.
The 8th Autumn School of Chemoinformatics in Nara 2023 (HP) 2023年11月28日
Transformer Encoder-based Generative Adversarial Network for Design of Polypharmacological Drugs
安田花純, 李晨, 海東和麻, 山西芳裕
情報計算化学生物学会（CBI学会） 2023年10月23日
Scaffold-retained transformer GAN for molecular generation with chemical property optimizatio
2023年10月
Moving beyond traditional anomaly detection
Chen Li
the 27th Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD 2023) 2023年
Molecular generation using sequence-based transformer generative adversarial network
Chen Li, Yoshihiro Yamanishi
2022年10月
Transformer-based generative adversarial networks for generating molecules with desired properties
Chen Li, Kazuma Kaitoh, Yoshihiro Yamanishi
Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2021年10月
AI model development and its application in drug discover
Chen Li
Beijing Institute of Technology 2020年
遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた半教師あり深層学習による治療標的分子の予測と希少疾患への応用
難波里子, 李晨, 大谷則子, 山西芳裕
第130回 日本解剖学会／第102回 日本生理学会／第98回 日本薬理学会合同大会 2025年3月17日
細胞応答情報を考慮した再帰型ニューラルネットワークによる標的タンパク質に対するリガンド生成
松清優樹, 天花寺厚, 李晨, 山西芳裕
第47回ケモインフォマティクス討論会
