keyword 代謝工学，腸内細菌，がん代謝，質量分析，13C代謝フラックス解析
大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報工学専攻
2014年4月 ～ 2017年3月
大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報工学専攻
2012年4月 ～ 2014年3月
大阪大学 工学部 応用自然科学科
2008年4月 ～ 2012年3月
生物工学会関西支部 若手企画委員
2023年12月 ～ 継続中
日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 運営委員 学協会
2019年 ～ 継続中
日本生物工学会 バイオ計測サイエンス研究部会 運営委員 学協会
2018年 ～ 継続中
第17回メタボロームシンポジウム 実行委員 学協会
2023年10月 ～
第71回質量分析総合討論会 実行委員 学協会
2023年5月 ～
第74回 日本生物工学会 100周年記念大会 実行委員 学協会
2022年10月 ～
第16回メタボロームシンポジウム 実行委員 実行委員 学協会
2022年9月 ～
日本生物工学会 2022年度生物工学若手研究者の集い（若手会）オンラインセミナー 実行委員 学協会
2022年5月 ～
第15回メタボロームシンポジウム 実行委員 学協会
2021年10月 ～
新学術領域研究 代謝統合オミクス 2021年若手合宿 運営委員 その他
2021年8月 ～
日本生物工学会 2021年度生物工学若手研究者の集い（若手会）オンラインセミナー 実行委員 学協会
2021年8月 ～
日本生物工学会 2020年度生物工学若手研究者の集い（若手会）第3回オンラインセミナー 実行委員長 学協会
2020年11月 ～
新学術領域研究 代謝統合オミクス 2020年若手合宿 幹事 その他
2020年8月 ～
日本生物工学会 2020年度生物工学若手研究者の集い（若手会）第2回オンラインセミナー 運営委員 学協会
2020年8月 ～
日本生物工学会 2020年度生物工学若手研究者の集い（若手会）第1回オンラインセミナー 運営委員 学協会
2020年7月 ～
日本生物工学会 2019年度生物工学若手研究者の集い（若手会）夏のセミナー 幹事 学協会
2019年11月 ～
新学術領域研究 代謝統合オミクス 2018年若手合宿 運営委員 その他
2018年11月 ～
日本農芸化学会
日本分子生物学会
日本質量分析学会
日本生物工学会
ライフサイエンス / システムゲノム科学 / システムバイオロジー
ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学 / 代謝工学
第81年会本部大会学生賞 最優秀学生賞
岡橋伸幸 化学工学会 2016年3月
第63回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞 ポスター発表部門優秀賞
岡橋伸幸 日本質量分析学会 2015年6月
第80年会本部大会学生賞 特別賞
岡橋伸幸 化学工学会 2015年3月
第3回飛翔賞
岡橋伸幸 日本生物工学会 2014年10月
第62回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞 優秀賞
岡橋伸幸 日本質量分析学会 2014年5月
Metabolic Engineering of the 5‐Aminolevulinate Biosynthetic Pathway in E. coli Improves Efficiency of Hemoprotein‐Based Biocatalysis
Shunsuke Kato, Miteki Abe, Nobuyuki Okahashi, Shinya Ariyasu, Fumio Matsuda, Osami Shoji, Takashi Hayashi
Angewandte Chemie 2025年8月5日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
Metabolic flux and flux balance analyses indicate the relevance of metabolic thermogenesis and aerobic glycolysis in cancer cells
Nobuyuki Okahashi, Tomoki Shima, Yuya Kondo, Chie Araki, Shuma Tsuji, Akane Sawai, Hikaru Uehara, Susumu Kohno, Hiroshi Shimizu, Chiaki Takahashi, Fumio Matsuda
Metabolic Engineering 2025年8月 研究論文（学術雑誌）
RB1 controls differentiation through positive regulation of phosphoglycerate mutases
Susumu Kohno, Nobuyuki Okahashi, Yuansong Wan, Hai Yu, Yujiro Takegami, Paing Linn, Naoko Nagatani, Shunsuke Kitajima, Teruo Kawada, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu, Chiaki Takahashi
Cell Death & Disease Vol. 16 No. 1 2025年7月24日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
ATP Supply from Cytosol to Mitochondria Is an Additional Role of Aerobic Glycolysis to Prevent Programmed Cell Death by Maintenance of Mitochondrial Membrane Potential
Akane Sawai, Takeo Taniguchi, Kohsuke Noguchi, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Masak Takaine, Fumio Matsuda
Metabolites Vol. 15 No. 7 2025年7月7日 研究論文（学術雑誌）
Eubiotic gut microbiota mitigate colitis via colonic Treg expansion.
Eri Ikeda, Nobuyuki Okahashi, Shigetada Kawabata
Research square 2025年4月22日
Comparative metabolome analysis of sake yeast with enhanced fermentation performance in sake fermentation conditions
Kotaro Mori, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Toshinari Takahashi, Fumio Matsuda
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 140 No. 1 p. 28-35 2025年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Data-independent acquisition-based lipidomics reveals lipidome alterations associated with growth of Saccharomyces cerevisiae at low temperature
Daiki Hara, Nobuyuki Okahashi, Taisuke Seike, Junko Iida, Fumio Matsuda
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 139 No. 6 p. 414-423 2025年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
13C-metabolic flux analysis of Saccharomyces cerevisiae in complex media
Hayato Fujiwara, Nobuyuki Okahashi, Taisuke Seike, Fumio Matsuda
Metabolic Engineering Communications Vol. 20 p. e00260-e00260 2025年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
ΔΔG Method for Elucidating Key Control Reactions from Relative Quantification Metabolome Data: Comparative Analysis of Yeast Glycolysis.
Fumio Matsuda, Ayumu Kamiyama, Kazuki Yamasaki, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi
Analytical chemistry Vol. 97 No. 12 p. 6391-6398 2025年4月1日 研究論文（学術雑誌）
Combinatorial Nonribosomal Peptide Synthetase Libraries Using the SEAM-Combi-OGAB Method.
Varada Jagadeesh, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Kenji Tsuge, Akihiko Kondo
ACS synthetic biology Vol. 14 No. 2 p. 520-530 2025年2月21日 研究論文（学術雑誌）
Commensal consortia decolonize Enterobacteriaceae via ecological control
Munehiro Furuichi, Takaaki Kawaguchi, Marie-Madlen Pust, Keiko Yasuma-Mitobe, Damian R. Plichta, Naomi Hasegawa, Takashi Ohya, Shakti K. Bhattarai, Satoshi Sasajima, Yoshimasa Aoto, Timur Tuganbaev, Mizuki Yaginuma, Masahiro Ueda, Nobuyuki Okahashi, Kimiko Amafuji, Yuko Kiridoshi, Kayoko Sugita, Martin Stražar, Julian Avila-Pacheco, Kerry Pierce, Clary B. Clish, Ashwin N. Skelly, Masahira Hattori, Nobuhiro Nakamoto, Silvia Caballero, Jason M. Norman, Bernat Olle, Takeshi Tanoue, Wataru Suda, Makoto Arita, Vanni Bucci, Koji Atarashi, Ramnik J. Xavier, Kenya Honda
Nature Vol. 633 p. 878-886 2024年9月18日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
13C-metabolic flux analysis reveals metabolic rewiring in HL-60 neutrophil-like cells through differentiation and immune stimulation
Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda
Metabolic Engineering Communications Vol. 18 p. e00239-e00239 2024年5月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin
Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y. Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 137 No. 3 p. 187-194 2024年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Improved 2,3-Butanediol Production Rate of Metabolically Engineered Saccharomyces cerevisiae by Deletion of RIM15 and Activation of Pyruvate Consumption Pathway
Masahiko Sugimura, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Jun Ishii, Fumio Matsuda
International Journal of Molecular Sciences Vol. 24 No. 22 p. 16378-16378 2023年11月15日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：MDPI AG
Lipidome and metabolome analyses reveal metabolic alterations associated with MCF-7 apoptosis upon 4-hydroxytamoxifen treatment
Kazuki Nishimoto, Nobuyuki Okahashi, Masaharu Maruyama, Yoshihiro Izumi, Kohta Nakatani, Yuki Ito, Junko Iida, Takeshi Bamba, Fumio Matsuda
Scientific Reports Vol. 13 No. 1 2023年10月29日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
Rationally-defined microbial consortia suppress multidrug-resistant proinflammatory Enterobacteriaceae via ecological control.
Kenya Honda, Munehiro Furuichi, Takaaki Kawaguchi, Marie-Madlen Pust, Keiko Yasuma-Mitobe, Damian Plichta, Naomi Hasegawa, Takashi Ohya, Shakti Bhattarai, Satoshi Sasajima, Aoto Yoshimasa, Timur Tuganbaev, Mizuki Yaginuma, Masahiro Ueda, Nobuyuki Okahashi, Kimiko Amafuji, Yuuko Kiridooshi, Kayoko Sugita, Martin Stražar, Ashwin Skelly, Wataru Suda, Masahira Hattori, Nobuhiro Nakamoto, Silvia Caballero, Jason Norman, Bernat Olle, Takeshi Tanoue, Makoto Arita, Vanni Bucci, Koji Atarashi, Ramnik Xavier
Research square 2023年10月23日
Improvement of ethanol and 2,3-butanediol production in Saccharomyces cerevisiae by ATP wasting
Futa Yatabe, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Jun Ishii, Fumio Matsuda
Microbial Cell Factories Vol. 22 No. 1 2023年10月8日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
Comprehensive analysis of the composition of the major phospholipids during the asexual life cycle of the filamentous fungus Aspergillus nidulans
Ryo Iwama, Nobuyuki Okahashi, Tetsuki Suzawa, Chuner Yang, Fumio Matsuda, Hiroyuki Horiuchi
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids Vol. 1868 No. 10 p. 159379-159379 2023年8月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Simple and Rapid Non-ribosomal Peptide Synthetase Gene Assembly Using the SEAM–OGAB Method
Varada Jagadeesh, Takanobu Yoshida, Misugi Uraji, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Christopher J. Vavricka, Kenji Tsuge, Akihiko Kondo
ACS Synthetic Biology Vol. 12 No. 1 p. 305-318 2022年12月23日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：American Chemical Society (ACS)
Data Processing of Product Ion Spectra: Quality Improvement by Averaging Multiple Similar Spectra of Small Molecules
Fumio Matsuda, Shuka Komori, Yuki Yamada, Daiki Hara, Nobuyuki Okahashi
Mass Spectrometry Vol. 11 No. 1 p. A0106-A0106 2022年12月15日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：The Mass Spectrometry Society of Japan
Lipidome variation of industrial Saccharomyces cerevisiae strains analyzed by LC-QTOF/MS-based untargeted lipidomics
Shuka Komori, Nobuyuki Okahashi, Junko Iida, Fumio Matsuda
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 135 No. 2 p. 102-108 2022年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Isotope Calculation Gadgets: A Series of Software for Isotope-Tracing Experiments in Garuda Platform
Nobuyuki Okahashi, Yuki Yamada, Junko Iida, Fumio Matsuda
Metabolites Vol. 12 No. 7 p. 646-646 2022年7月14日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：MDPI AG
Structures and functions of the gut microbial lipidome
Satoshi Morozumi, Masahiro Ueda, Nobuyuki Okahashi, Makoto Arita
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids Vol. 1867 No. 3 p. 159110-159110 2022年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Comparative Evaluation of Plasma Metabolomic Data from Multiple Laboratories
Shin Nishiumi, Yoshihiro Izumi, Akiyoshi Hirayama, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Kosuke Hata, Daisuke Saigusa, Eiji Hishinuma, Naomi Matsukawa, Suzumi M. Tokuoka, Yoshihiro Kita, Fumie Hamano, Nobuyuki Okahashi, Kazutaka Ikeda, Hiroki Nakanishi, Kosuke Saito, Masami Yokota Hirai, Masaru Yoshida, Yoshiya Oda, Fumio Matsuda, Takeshi Bamba
Metabolites Vol. 12 No. 2 p. 135-135 2022年2月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：MDPI AG
mfapy: An open-source Python package for 13C-based metabolic flux analysis
Fumio Matsuda, Kousuke Maeda, Takeo Taniguchi, Yuya Kondo, Futa Yatabe, Nobuyuki Okahashi, Hiroshi Shimizu
Metabolic Engineering Communications Vol. 13 p. e00177-e00177 2021年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Metabolic flux and flux balance analyses indicate the relevance of metabolic thermogenesis and aerobic glycolysis in cancer cells
Nobuyuki Okahashi, Tomoki Shima, Yuya Kondo, Chie Araki, Shuma Tsuji, Akane Sawai, Hikaru Uehara, Susumu Kohno, Hiroshi Shimizu, Chiaki Takahashi, Fumio Matsuda
2021年11月19日
Global profiling of gut microbiota-associated lipid metabolites in antibiotic-treated mice by LC-MS/MS-based analyses
Nobuyuki Okahashi, Masahiro Ueda, Shu Yasuda, Hiroshi Tsugawa, Makoto Arita
STAR Protocols Vol. 2 No. 2 p. 100492-100492 2021年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier {BV}
Comparative 13 C‐metabolic flux analysis indicate elevation of ATP regeneration, carbon dioxide, and heat production in industrial Saccharomyces cerevisiae strains
Futa Yatabe, Nobuyuki Okahashi, Taisuke Seike, Fumio Matsuda
Biotechnology Journal p. 2000438-2000438 2021年5月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
Staphylococcus cohnii is a potentially biotherapeutic skin commensal alleviating skin inflammation
Yoshihiro Ito, Takashi Sasaki, Youxian Li, Takeshi Tanoue, Yuki Sugiura, Ashwin N. Skelly, Wataru Suda, Yusuke Kawashima, Nobuyuki Okahashi, Eiichiro Watanabe, Hiroto Horikawa, Aiko Shiohama, Rina Kurokawa, Eiryo Kawakami, Hachiro Iseki, Hiroshi Kawasaki, Yoichiro Iwakura, Atsushi Shiota, Liansheng Yu, Junzo Hisatsune, Haruhiko Koseki, Motoyuki Sugai, Makoto Arita, Osamu Ohara, Takeshi Matsui, Makoto Suematsu, Masahira Hattori, Koji Atarashi, Masayuki Amagai, Kenya Honda
Cell Reports Vol. 35 No. 4 p. 109052-109052 2021年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier {BV}
Treatment of RB1‐intact hepatocellular carcinoma with CDK4/6 inhibitor combination therapy
Jindan Sheng, Susumu Kohno, Nobuhiro Okada, Nobuyuki Okahashi, Kana Teranishi, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu, Paing Linn, Naoko Nagatani, Minako Yamamura, Kenichi Harada, Shin‐ichi Horike, Hiroshi Inoue, Seiji Yano, Sharad Kumar, Shunsuke Kitajima, Itsuki Ajioka, Chiaki Takahashi
Hepatology Vol. 74 No. 4 p. 1971-1993 2021年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
Analyses of Lipid A Diversity in Gram-Negative Intestinal Bacteria Using Liquid Chromatography–Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry
Nobuyuki Okahashi, Masahiro Ueda, Fumio Matsuda, Makoto Arita
Metabolites Vol. 11 No. 4 p. 197-197 2021年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：{MDPI} {AG}
Synthetic production of prenylated naringenins in yeast using promiscuous microbial prenyltransferases
Shota Isogai, Nobuyuki Okahashi, Ririka Asama, Tomomi Nakamura, Tomohisa Hasunuma, Fumio Matsuda, Jun Ishii, Akihiko Kondo
Metabolic Engineering Communications Vol. 12 p. e00169-e00169 2021年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
Senolysis by glutaminolysis inhibition ameliorates various age-associated disorders.
Yoshikazu Johmura, Takehiro Yamanaka, Satotaka Omori, Teh-Wei Wang, Yuki Sugiura, Masaki Matsumoto, Narumi Suzuki, Soichiro Kumamoto, Kiyoshi Yamaguchi, Seira Hatakeyama, Tomoyo Takami, Rui Yamaguchi, Eigo Shimizu, Kazutaka Ikeda, Nobuyuki Okahashi, Ryuta Mikawa, Makoto Suematsu, Makoto Arita, Masataka Sugimoto, Keiichi I Nakayama, Yoichi Furukawa, Seiya Imoto, Makoto Nakanishi
Science (New York, N.Y.) Vol. 371 No. 6526 p. 265-270 2021年1月15日 研究論文（学術雑誌）
Helicobacter pylori metabolites exacerbate gastritis through C-type lectin receptors
Masahiro Nagata, Kenji Toyonaga, Eri Ishikawa, Shojiro Haji, Nobuyuki Okahashi, Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Akihiro Imamura, Koichi Takato, Hideharu Ishida, Shigenori Nagai, Petr Illarionov, Bridget L. Stocker, Mattie S.M. Timmer, Dylan G.M. Smith, Spencer J. Williams, Takeshi Bamba, Tomofumi Miyamoto, Makoto Arita, Ben J. Appelmelk, Sho Yamasaki
Journal of Experimental Medicine Vol. 218 No. 1 2021年1月4日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Rockefeller University Press
Elucidation of Gut Microbiota-Associated Lipids Using LC-MS/MS and 16S rRNA Sequence Analyses
Shu Yasuda, Nobuyuki Okahashi, Hiroshi Tsugawa, Yusuke Ogata, Kazutaka Ikeda, Wataru Suda, Hiroyuki Arai, Masahira Hattori, Makoto Arita
iScience Vol. 23 No. 12 p. 101841-101841 2020年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
A lipidome atlas in MS-DIAL 4.
Hiroshi Tsugawa, Kazutaka Ikeda, Mikiko Takahashi, Aya Satoh, Yoshifumi Mori, Haruki Uchino, Nobuyuki Okahashi, Yutaka Yamada, Ipputa Tada, Paolo Bonini, Yasuhiro Higashi, Yozo Okazaki, Zhiwei Zhou, Zheng-Jiang Zhu, Jeremy Koelmel, Tomas Cajka, Oliver Fiehn, Kazuki Saito, Masanori Arita, Makoto Arita
Nature biotechnology Vol. 38 No. 10 p. 1159-1163 2020年6月15日 研究論文（学術雑誌）
Computational data mining method for isotopomer analysis in the quantitative assessment of metabolic reprogramming
Fumio Matsuda, Kousuke Maeda, Nobuyuki Okahashi
Scientific Reports Vol. 10 No. 1 2020年1月14日 研究論文（学術雑誌）
Inter-laboratory comparison of metabolite measurements for metabolomics data integration
Yoshihiro Izumi, Fumio Matsuda, Akiyoshi Hirayama, Kazutaka Ikeda, Yoshihiro Kita, Kanta Horie, Daisuke Saigusa, Kosuke Saito, Yuji Sawada, Hiroki Nakanishi, Nobuyuki Okahashi, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Kosuke Hata, Yutaro Hoshi, Motohiko Morihara, Kazuhiro Tanabe, Takeshi Bamba, Yoshiya Oda
Metabolites Vol. 9 No. 11 2019年10月31日 研究論文（学術雑誌）
Time-resolved analysis of short term metabolic adaptation at dark transition in Synechocystis sp. PCC 6803
Masaharu Maruyama, Hiroki Nishiguchi, Masakazu Toyoshima, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 128 No. 4 p. 424-428 2019年10月 研究論文（学術雑誌）
Fragmentation of Dicarboxylic and Tricarboxylic Acids in the Krebs Cycle Using GC-EI-MS and GC-EI-MS/MS.
Nobuyuki Okahashi, Shuichi Kawana, Junko Iida, Hiroshi Shimizu, Fumio Matsuda
Mass spectrometry (Tokyo, Japan) Vol. 8 No. 1 2019年8月 研究論文（学術雑誌）
Sugar phosphate analysis with baseline separation and soft ionization by gas chromatography-negative chemical ionization-mass spectrometry improves flux estimation of bidirectional reactions in cancer cells
Nobuyuki Okahashi, Kousuke Maeda, Shuichi Kawana, Junko Iida, Hiroshi Shimizu, Fumio Matsuda
Metabolic Engineering Vol. 51 p. 43-49 2019年1月 研究論文（学術雑誌）
Mass Spectrometry-Based Method to Study Inhibitor-Induced Metabolic Redirection in the Central Metabolism of Cancer Cells.
Chie Araki, Nobuyuki Okahashi, Kousuke Maeda, Hiroshi Shimizu, Fumio Matsuda
Mass spectrometry (Tokyo, Japan) Vol. 7 No. 1 2018年4月
Metabolic engineering of isopropyl alcohol-producing Escherichia coli strains with 13C-metabolic flux analysis
Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Katsunori Yoshikawa, Tomokazu Shirai, Yoshiko Matsumoto, Mitsufumi Wada, Hiroshi Shimizu
Biotechnology and Bioengineering Vol. 114 No. 12 p. 2782-2793 2017年12月 研究論文（学術雑誌）
The RB-IL-6 axis controls self-renewal and endocrine therapy resistance by fine-tuning mitochondrial activity
S. Kitajima, A. Yoshida, S. Kohno, F. Li, S. Suzuki, N. Nagatani, Y. Nishimoto, N. Sasaki, H. Muranaka, Y. Wan, T. C. Thai, N. Okahashi, F. Matsuda, H. Shimizu, T. Nishiuchi, Y. Suzuki, K. Tominaga, N. Gotoh, M. Suzuki, M. E. Ewen, D. A. Barbie, O. Hirose, T. Tanaka, C. Takahashi
Oncogene Vol. 36 No. 36 p. 5145-5157 2017年9月7日 研究論文（学術雑誌）
Investigation of useful carbon tracers for 13C-metabolic flux analysis of Escherichia coli by considering five experimentally determined flux distributions
Kousuke Maeda, Nobuyuki Okahashi, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
Metabolic Engineering Communications Vol. 3 p. 187-195 2016年12月1日 研究論文（学術雑誌）
GC-MS/MS survey of collision-induced dissociation of tert-butyldimethylsilyl-derivatized amino acids and its application to 13C-metabolic flux analysis of Escherichia coli central metabolism
Nobuyuki Okahashi, Shuichi Kawana, Junko Iida, Hiroshi Shimizu, Fumio Matsuda
Analytical and Bioanalytical Chemistry Vol. 408 No. 22 p. 6133-6140 2016年9月1日 研究論文（学術雑誌）
Metabolic characterization of cultured mammalian cells by mass balance analysis, tracer labeling experiments and computer-aided simulations
Nobuyuki Okahashi, Susumu Kohno, Shunsuke Kitajima, Fumio Matsuda, Chiaki Takahashi, Hiroshi Shimizu
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 120 No. 6 p. 725-731 2015年12月 研究論文（学術雑誌）
Absolute quantitation of glycolytic intermediates reveals thermodynamic shifts in Saccharomyces cerevisiae strains lacking PFK1 or ZWF1 genes
Shunsuke Nishino, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 120 No. 3 p. 280-286 2015年9月1日 研究論文（学術雑誌）
Reliable Metabolic Flux Estimation in Escherichia coli Central Carbon Metabolism Using Intracellular Free Amino Acids.
Nobuyuki Okahashi, Shuichi Kajihata, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
Metabolites Vol. 4 No. 2 p. 408-20 2014年5月30日
腸内細菌代謝物のノンターゲットメタボロミクス
岡橋伸幸
ファルマシア Vol. 60 No. 7 p. 658-662 2024年7月 記事・総説・解説・論説等（その他）
Development of 13C-Metabolic Flux Analysis for HL-60 Neutrophil-like Cell Using GC-MS
Takeo Taniguchi, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda
Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan Vol. 71 No. 4 p. 155-159 2023年12月1日 研究発表ペーパー・要旨（全国大会，その他学術会議）
出版者・発行元：The Mass Spectrometry Society of Japan
宿主受容体に作用する腸内細菌代謝物
岡橋伸幸
生物工学会誌 Vol. 101 No. 11 p. 597-597 2023年11月 記事・総説・解説・論説等（その他）
腸内細菌が産生する脂質代謝物の構造と機能
両角 諭, 岡橋 伸幸, 有田 誠
Vol. 95 No. 4 p. 428-435 2023年8月 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
LC-QTOF/MSを用いたリン脂質の13Cトレーサー解析
山田侑季, 村上慶多, 岡橋伸幸, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生
Vol. 70 No. 4 p. 241-244 2022年12月1日 研究発表ペーパー・要旨（全国大会，その他学術会議）
出版者・発行元：The Mass Spectrometry Society of Japan
腸内細菌が生成する脂質代謝物の構造と機能
岡橋伸幸, 有田誠
肥満研究 Vol. 28 No. 1 p. 10-15 2022年7月 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
質量分析を用いた細菌のリピドミクス
上田政宏, 岡橋伸幸, 有田誠
JSBMS Letters Vol. 46 No. 3 p. 38-42 2021年11月 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
微生物資源の活用に向けたノンターゲットメタボロミクス
岡橋伸幸
酵素工学ニュース Vol. 86 p. 13-16 2021年10月 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
質量分析法を使った未知代謝物の計測と同定
岡橋伸幸, 松田史生, 有田誠
生物工学会誌 Vol. 99 No. 5 p. 233-236 2021年5月 記事・総説・解説・論説等（その他）
時系列メタボローム解析を用いたがん細胞薬剤応答の解明
Vol. 68 No. 6 p. 90-92 2020年12月1日 記事・総説・解説・論説等（その他）
出版者・発行元：The Mass Spectrometry Society of Japan
腸内細菌のリポクオリティと生体制御
安田柊, 岡橋伸幸, 上田政宏, 有田誠
Vol. 30 No. 4 p. 51-57 2019年10月 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
糖リン酸の精密計測が明らかにする中心代謝フラックス
岡橋 伸幸, 松田 史生
バイオサイエンスとインダストリー Vol. 77 No. 2 p. 116-118 2019年
出版者・発行元：バイオインダストリー協会
Metabolic rewiring in Rb deficient cells during cancer progression
Susumu Kohno, Nobuyuki Okahashi, Shunsuke Kitajima, Sawako Suzuki, Tomoaki Tanaka, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu, Chiaki Takahashi
CANCER RESEARCH Vol. 76 2016年7月 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
決定版質量分析活用スタンダード : 代謝物からタンパク質、食品・環境の分析まで質量分析のポテンシャルを活かしきる戦略とプロトコール
岡橋伸幸
羊土社 2023年7月 学術書
ISBN: 9784758122641
Mass Spectrometry for Lipidomics: Methods and Applications
Masahiro Ueda, Nobuyuki Okahashi, Makoto Arita
Wiley-VCH 2023年2月13日 学術書
ISBN: 3527350152
メタボロミクス実践ガイド
岡橋, 伸幸, 津川, 裕司
羊土社 2021年4月 学術書
ISBN: 9784758122511
メタボロミクス実践ガイド
岡橋, 伸幸, 松田, 史生
羊土社 2021年4月 学術書
ISBN: 9784758122511
ヒトマイクロバイオーム Vol.2 解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線
岡橋伸幸, 上田政宏, 有田誠
NTS(エヌ・ティー・エス) 2020年6月 学術書
ISBN: 9784860436599
代謝センシング : 健康, 食, 美容, 薬, そして脳の代謝を知る
岡橋伸幸, 松田史生, 清水浩
シーエムシー出版 2018年
ISBN: 9784781313504
Comprehensive analysis of microbial lipidome using untargeted mass spectrometry
Tohoku Forum for Creativity, Designing Foods for the Future 2024年9月19日
低温ストレス応答下のSaccharomyces cerevisiaeの包括的脂質解析
岡橋伸幸, 原大樹, 飯田順子, 松田史生
第76回日本生物工学会大会 2024年9月9日
13C-metabolic flux analysis of glycerolipid metabolism in Saccharomyces cerevisiae
Nobuyuki Okahashi, Yuki Yamada, Daiki Hara, Atsuhiko Toyama, Junko Iida, Fumio Matsuda
Metabolomics 2024 2024年6月19日
Data-independent acquisitionリピドミクスを用いたグリセロ脂質代謝経路の13C代謝フラックス解析法の開発
岡橋伸幸, 山田侑季, 原大樹, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生
第72回質量分析総合討論会 2024年6月12日
微生物代謝物の網羅計測とゲノムデータとの統合
岡橋伸幸
日本微生物生態学会第36回浜松大会 2023年12月6日
シーケンシングデータを取った後の解析 ～オミクスデータの統合解析事例～
岡橋伸幸
NGS expo 2023 2023年11月16日
DIAリピドミクスを用いた低温ストレス下の出芽酵母の脂質解析
岡橋伸幸, 原大樹, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生
第17回メタボロームシンポジウム 2023年10月19日
Untargeted analysis of microbial metabolites using mass spectrometry
Nobuyuki Okahashi
3rd International BMS Symposium 2023 in Kyoto 2023年10月7日
グラム陰性腸内細菌のLipid Aの構造解析
岡橋伸幸, 上田政宏, 松田史生, 有田誠
第75回日本生物工学会大会 2023年9月3日
Comprehensive analysis and data integration for identification of unique bacterial metabolites and enzyme genes
Nobuyuki Okahashi
YABEC2023 2023年7月13日
Analysis of yeast lipids exposed to low temperature stress using data-independent acquisition-based lipidomics
Daiki Hara, Nobuyuki Okahashi, Atsuhiko Toyama, Junko Iida, Fumio Matsuda
71st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2023年6月5日
代謝の流れを測る～がん細胞がコスパの悪い代謝を好む“アツい”理由～
岡橋伸幸
The 145th Scienc-ome 2023年5月24日
ヒト乳がん細胞株のマルチオミクス解析
岡橋伸幸, 近藤佑哉, 高橋遼, 松田史生
第71回質量分析総合討論会 2023年5月15日
ゲノムとメタボロームの統合解析による微生物の酵素遺伝子と代謝産物の推定法の開発
岡橋伸幸, 松田史生
日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日
ゲノムとメタボロームを組み合わせた酵素遺伝子と代謝産物の推定法の開発
岡橋伸幸, 松田史生
第17回日本ゲノム微生物学会 2023年3月8日
統合オミクス解析を用いた微生物の酵素遺伝子と代謝産物の推定法の開発
岡橋伸幸, 松田史生
第45回日本分子生物学会年会 2022年12月1日
微生物の新規代謝物－酵素遺伝子の統合オミクス推定法の開発
岡橋伸幸, 松田史生
第74回日本生物工学会大会 2022年10月20日
多階層データを用いたヒト乳がん由来細胞株のサブタイプ間代謝解析
岡橋伸幸, 西本和生, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生
第16回メタボロームシンポジウム 2022年9月15日
時系列メタボロミクスを用いた タモキシフェン処理後の乳がん細胞株MCF-7における代謝応答解析
岡橋伸幸
第70回質量分析総合討論会 2022年6月24日
代謝の“流れ”を観る
岡橋伸幸
AgTechセミナー 2022年4月22日
食品産業酵母の形質に関与する脂質分子の網羅解析
小森柊花, 岡橋伸幸, 遠山 敦彦, 飯田順子, 松田史生
日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月16日
代謝フラックス解析から見えてきた好気的解糖のメリット
岡橋伸幸
令和3年度金沢大学がん進展制御研究所 共同利用・共同研究拠点研究成果報告会 2022年2月17日
同位体標識を用いた代謝トレーシング解析のためのソフトウェア開発
岡橋伸幸, 松田史生
第44回日本分子生物学会年会 2021年12月2日
ノンターゲットリピドミクスを用いた腸内細菌脂質の計測と同定
岡橋伸幸, 安田柊, 津川裕司, 池田和貴, 有田誠
第73回日本生物工学会大会 2021年10月29日
13C代謝フラックス解析法を用いた好中球の中心炭素代謝の解析
岡橋伸幸, 谷口赳夫, 松田史生
第15回メタボロームシンポジウム 2021年10月15日
OT-2を用いたHPLCサンプル調製の自動化
岡橋伸幸
Laboratory Automation月例勉強会/2021.08 2021年8月20日
LC-QTOF/MSを用いたグラム陰性腸内細菌のLipid Aの解析
岡橋伸幸, 上田政宏, 松田史生, 有田誠
第69回質量分析総合討論会 2021年5月19日
Development of a data processing platform for isotope tracing experiments in Garuda
Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda
Metabolomics2020 2020年10月28日
未知代謝物の計測と同定
岡橋伸幸
バイオ計測サイエンス研究部会2020シンポジウム 2020年8月24日
Metabolic adaptation analysis of the inhibition of oxidative phosphorylation using time-series metabolomics and lipidomics
Nobuyuki Okahashi, Shuma Tsuji, Junko Iida, Tairo Ogura, Fumio Matsuda
68th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2020年6月1日
質量分析で中心炭素代謝の流れを見る
岡橋伸幸 松田史生
日本農芸化学会2020年度福岡大会 2020年3月
腸内細菌叢の網羅的代謝物解析
岡橋伸幸
バイオインフォマティクス相談部会 第三回講演会～大規模計測技術とインフォマティクスと自動化 2019年11月20日
代謝フラックス解析
岡橋伸幸
日本プロテオーム学会2019年大会 第70回日本電気泳動学会総会 2019年7月
Isotope Calculation Gadgets
2021年7月 ～
同位体分布データ作成方法
岡橋伸幸, 松田史生, 岡本真美, 山田洋平
特許7640058
出願日:2021/07/19
登録日:2025/02/25
情報処理方法、情報処理装置、及びプログラム
岡橋伸幸
出願日:2023/09/14
糸状菌（カビ）の包括的な生体膜変化の解明（大阪大学プレスリリース）
大阪大学
2023年8月
腸内細菌叢の複雑な脂質多様性を解明する手法を開発（理化学研究所プレスリリース）
理化学研究所
2021年4月
生命の脂質多様性を解明（理化学研究所プレスリリース）
理化学研究所
2020年6月
世界初！代謝を正確に計測する新技術を開発（大阪大学プレスリリース）
大阪大学
2018年9月
がん細胞代謝物 感度10倍で解析
2018年9月
遊離代謝物質に基づく物質生産大腸菌およびがん細胞の13C代謝フラックス解析に関する研究
岡橋 伸幸
