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根本　孝裕
Nemoto Takahiro
根本　孝裕
Nemoto Takahiro
ヒューマン・メタバース疾患研究拠点，教授
nemoto.takahiro.prime osaka-u.ac.jp

経歴 9

  1. 2025年7月 ～ 継続中
    大阪大学　ヒューマン・メタバース疾患研究拠点　教授

  2. 2023年3月 ～ 2025年6月
    大阪大学　ヒューマン・メタバース疾患研究拠点　特任准教授（常勤）

  3. 2021年9月 ～ 2023年2月
    京都大学　大学院情報学研究科 システム科学専攻　助教

  4. 2021年1月 ～ 2021年8月
    パリVision研究所　博士研究員

  5. 2019年11月 ～ 2020年12月
    パスツール研究所　感染症の数理モデル化研究室　博士研究員

  6. 2016年11月 ～ 2019年10月
    高等師範学校　物理学研究室　博士研究員

  7. 2015年11月 ～ 2016年10月
    パリ７大学　確率と確率モデル研究室　博士研究員

  8. 2015年4月 ～ 2015年10月
    リヨン高等師範学校　物理学研究室　博士研究員

  9. 2012年4月 ～ 2015年3月
    独立行政法人日本学術振興会　特別研究員 DC1

学歴 3

  1. 京都大学　大学院理学研究科　物理学・宇宙物理学専攻 博士後期課程

    2012年4月 ～ 2015年3月

  2. 東京大学　大学院総合文化研究科　広域科学専攻相関基礎科学系 修士課程

    2010年4月 ～ 2012年3月

  3. 東京工業大学　理学部　物理学科

    2007年4月 ～ 2010年3月

受賞 1

  1. 第９回日本物理学会若手奨励賞（領域１１）

    日本物理学会　2015年3月

論文 28

  1. PAX6-dependent differentiation landscape of ocular surface epithelium via single-cell RNA sequencing in hiPSC-derived ocular developmental organoid

    Rei Kamuro, Masahito Yoshihara, Susumu Hara, Takahiro Nemoto, Laura Howard, Ai Honda, Ayano Yamamoto, Toru Takigawa, Susumu Sakimoto, Koichi Baba, Andrew J. Quantock, Kohji Nishida

    Communications Biology　2025年8月14日　研究論文（学術雑誌）

  2. ACIDES: on-line monitoring of forward genetic screens for protein engineering

    Takahiro Nemoto, Tommaso Ocari, Arthur Planul, Muge Tekinsoy, Emilia A. Zin, Deniz Dalkara, Ulisse Ferrari

    Nature Communications　2023年12月26日　研究論文（学術雑誌）

  3. Uncursing winner’s curse: on-line monitoring of directed evolution convergence

    Takahiro Nemoto, Tommaso Ocari, Arthur Planul, Muge Tekinsoy, Emilia A. Zin, Deniz Dalkara, Ulisse Ferrari

    2023年1月3日

  4. Reconstructing long-term dengue virus immunity in French Polynesia

    Takahiro Nemoto, Maite Aubry, Yoann Teissier, Richard Paul, Van-Mai Cao-Lormeau, Henrik Salje, Simon Cauchemez

    PLOS Neglected Tropical Diseases　Vol. 16　No. 10　p. e0010367-e0010367　2022年10月3日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Public Library of Science (PLoS)

  5. Anomalous fluctuations of renewal-reward processes with heavy-tailed distributions

    Hiroshi Horii, Raphaël Lefevere, Masato Itami, Takahiro Nemoto

    Physical Review E　Vol. 106　No. 3　2022年9月23日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society (APS)

  6. Large Time Asymptotic of Heavy Tailed Renewal Processes

    Hiroshi Horii, Raphaël Lefevere, Takahiro Nemoto

    Journal of Statistical Physics　Vol. 186　No. 1　2021年12月13日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

  7. Quantitative evaluation of the infection dynamics of bovine brucellosis in Tanzania

    Makoto Ukita, Nathanael Hozé, Takahiro Nemoto, Simon Cauchemez, Shingo Asakura, George Makingi, Rudovick Kazwala, Kohei Makita

    Preventive Veterinary Medicine　Vol. 194　p. 105425-105425　2021年9月　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Elsevier {BV}

  8. Do extreme events trigger turbulence decay? – a numerical study of turbulence decay time in pipe flows

    Takahiro Nemoto, Alexandros Alexakis

    Journal of Fluid Mechanics　2021年4月10日　研究論文（学術雑誌）

  9. Dynamical phase coexistence in the Fredrickson–Andersen model

    Robert L Jack, Takahiro Nemoto, Vivien Lecomte

    Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment　Vol. 2020　No. 5　p. 053204-053204　2020年5月28日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：{IOP} Publishing

  10. Extreme events trigger turbulence decay: numerical verification of extreme value theory in pipe flows

    Takahiro Nemoto

    2020年5月7日

  11. Dissipation controls transport and phase transitions in active fluids: mobility, diffusion and biased ensembles

    {\'{E } }tienne Fodor, Takahiro Nemoto, Suriyanarayanan Vaikuntanathan

    New Journal of Physics　Vol. 22　No. 1　p. 013052-013052　2020年1月29日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：{IOP} Publishing

  12. Colloidal transport in bacteria suspensions: from bacteria collision to anomalous and enhanced diffusion

    Antoine Lagarde, No{\'{e } }mie Dag{\`{e } }s, Takahiro Nemoto, Vincent D{\'{e } }mery, Denis Bartolo, Thomas Gibaud

    Soft Matter　Vol. 16　No. 32　p. 7503-7512　2020年　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Royal Society of Chemistry ({RSC})

  13. Rare transitions to thin-layer turbulent condensates

    Adrian van Kan, Takahiro Nemoto, Alex, ros Alexakis

    Journal of Fluid Mechanics　Vol. 878　p. 356-369　2019年11月10日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：Cambridge University Press ({CUP})

  14. How Dissipation Constrains Fluctuations in Nonequilibrium Liquids: Diffusion, Structure, and Biased Interactions

    Laura Tociu, {\'{E } }tienne Fodor, Takahiro Nemoto, Suriyanarayanan Vaikuntanathan

    Physical Review X　Vol. 9　No. 4　2019年11月5日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  15. Imitating nonequilibrium steady states using time-varying equilibrium force in many-body diffusive systems

    Ohad Shpielberg, Takahiro Nemoto

    Physical Review E　Vol. 100　No. 3　2019年9月3日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  16. Soft trapping lasts longer: Dwell time of a Brownian particle varied by potential shape

    Itsuo Hanasaki, Takahiro Nemoto, Yoshito Y. Tanaka

    Physical Review E　Vol. 99　No. 2　2019年2月13日　研究論文（学術雑誌）

  17. Optimizing active work: Dynamical phase transitions, collective motion, and jamming

    Takahiro Nemoto, {\'{E } }tienne Fodor, Michael E. Cates, Robert L. Jack, Julien Tailleur

    Physical Review E　Vol. 99　No. 2　2019年2月8日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  18. Universality in dynamical phase transitions of diffusive systems

    Ohad Shpielberg, Takahiro Nemoto, Jo{\~{a } }o Caetano

    Physical Review E　Vol. 98　No. 5　2018年11月14日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  19. Method to measure efficiently rare fluctuations of turbulence intensity for turbulent-laminar transitions in pipe flows

    Takahiro Nemoto, Alex, ros Alexakis

    Physical Review E　Vol. 97　No. 2　2018年2月7日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  20. Finite-time and finite-size scalings in the evaluation of large-deviation functions: Numerical approach in continuous time

    Esteban Guevara Hidalgo, Takahiro Nemoto, Vivien Lecomte

    Physical Review E　Vol. 95　No. 6　2017年6月28日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  21. Finite-Size Scaling of a First-Order Dynamical Phase Transition: Adaptive Population Dynamics and an Effective Model

    Takahiro Nemoto, Robert L. Jack, Vivien Lecomte

    Physical Review Letters　Vol. 118　No. 11　2017年3月14日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  22. Finite-time and finite-size scalings in the evaluation of large-deviation functions: Analytical study using a birth-death process

    Takahiro Nemoto, Esteban Guevara Hidalgo, Vivien Lecomte

    Physical Review E　Vol. 95　No. 1　2017年1月3日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  23. Population-dynamics method with a multicanonical feedback control

    Takahiro Nemoto, Freddy Bouchet, Robert L. Jack, Vivien Lecomte

    Physical Review E　Vol. 93　No. 6　2016年6月15日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  24. Finite-size effects in a mean-field kinetically constrained model: dynamical glassiness and quantum criticality

    Takahiro Nemoto, Vivien Lecomte, Shin-ichi Sasa, Fr{\'{e } }d{\'{e } }ric van Wijl

    Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment　Vol. 2014　No. 10　2014年10月1日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：{IOP} Publishing

  25. Computation of Large Deviation Statistics via Iterative Measurement-and-Feedback Procedure

    Takahiro Nemoto, Shin-ichi Sasa

    Physical Review Letters　Vol. 112　No. 9　2014年3月6日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  26. Zon-Cohen singularity and negative inverse temperature in a trapped-particle limit

    Takahiro Nemoto

    Physical Review E　Vol. 85　No. 6　2012年6月21日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  27. Thermodynamic formula for the cumulant generating function of time-averaged current

    Takahiro Nemoto, Shin-ichi Sasa

    Physical Review E　Vol. 84　No. 6　2011年12月7日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

  28. Variational formula for experimental determination of high-order correlations of current fluctuations in driven systems

    Takahiro Nemoto, Shin-ichi Sasa

    Physical Review E　Vol. 83　No. 3　2011年3月25日　研究論文（学術雑誌）

    出版者・発行元：American Physical Society ({APS})

MISC 4

  1. 27aBD-7 測定とフィードバックの反復による大偏差関数の計算(27aBD 非平衡定常系1(非平衡基礎論・分子機械含む),領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理))

    根本 孝裕, 佐々 真一

    日本物理学会講演概要集　Vol. 69　No. 1　p. 296-296　2014年3月5日

    出版者・発行元：一般社団法人日本物理学会

  2. 26pTF-11 カレント揺らぎの高次キュムラント(26pTF 非平衡定常系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    根本 孝裕, 佐々 真一

    日本物理学会講演概要集　Vol. 66　No. 1　p. 321-321　2011年3月3日

    出版者・発行元：一般社団法人日本物理学会

  3. カレントゆらぎ母関数の操作的公式(非平衡系の物理-非平衡ゆらぎと集団挙動-,研究会報告)

    根本 孝裕, 佐々 真一

    物性研究　Vol. 96　No. 1　p. 30-35　2011年

    出版者・発行元：物性研究刊行会

  4. 24aTD-5 1次元非平衡ランジュバンモデルにおける大偏差原理を用いた粗視化(24aTD 非平衡定常系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

    根本 孝裕, 佐々 真一

    日本物理学会講演概要集　Vol. 65　No. 2　p. 227-227　2010年8月18日

    出版者・発行元：一般社団法人日本物理学会