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Comparative evaluation of polyhydroxyalkanoates recovery methods for a mixed microbial culture derived from waste activated sludge
Daisuke Inoue, Kohei Miwa, Michihiko Ike
Journal of Material Cycles and Waste Management 2025年5月12日 研究論文（学術雑誌）
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Combined inhibition of anaerobic digestion by sulfate, salinity, and ammonium: potential inhibitory factors in forward osmosis-concentrated municipal wastewater
Luong Van Duc, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Chemosphere Vol. 377 2025年5月 研究論文（学術雑誌）
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Uncovering the causal relationships in plant-microbe ecosystems: A time series analysis of the duckweed cultivation system for biomass production and wastewater treatment
Hidehiro Ishizawa, Yosuke Tashiro, Takashi Okada, Daisuke Inoue, Michihiko Ike, Hiroyuki Futamata
Science of The Total Environment Vol. 957 p. 177717-177717 2024年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Different bioaugmentation regimes that mitigate ammonium/salt inhibition in repeated batch anaerobic digestion: Generic converging trend of microbial communities
Zi-Yan Li, Shintaro Nagao, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Bioresource Technology Vol. 413 p. 131481-131481 2024年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Aerobic biodegradation of chlorinated ethenes by Pseudonocardia sp. D17: Biodegradation ability without auxiliary substrates and concurrent biodegradation with 1,4-dioxane
Daisuke Inoue, Ryugo Nishimine, Shinpei Fujiwara, Kousuke Minamizono, Michihiko Ike
Journal of Hazardous Materials Letters Vol. 5 p. 100106-100106 2024年11月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Applicability of rapid enrichment of polyhydroxyalkanoates-accumulating bacteria by aerobic dynamic discharge process to waste activated sludge from various wastewater treatment plants
Vol. 60 No. 2 p. 25-37 2024年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Potential of activated sludge-derived mixed microbial culture enriched on acetate to produce polyhydroxyalkanoates from various substrates
2024年5月14日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Different inhibition patterns of ammonia and salt revealed by kinetic analysis of their combined inhibitory effect on methanogenesis of hydrogen: A preliminary study
Vol. 205 p. 109263-109263 2024年5月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Complete genome sequences of six duckweed-associated bacterial strains for studying community assembly in synthetic plant microbiome
Hidehiro Ishizawa, Minami Tada, Yosuke Tashiro, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Hideo Dohra, Hiroyuki Futamata, Michihiko Ike
Microbiology Resource Announcements 2024年4月11日 研究論文（学術雑誌）
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Microbial adaptation to high ammonia environment in submerged anaerobic membrane bioreactor under volatile fatty acids and ammonia stresses
Fetra J. Andriamanohiarisoamanana, Gen Yoshida, Daisuke Inoue, Michihiko Ike, Ikko Ihara
Biochemical Engineering Journal 2024年4月 研究論文（学術雑誌）
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Learning beyond-pairwise interactions enables the bottom–up prediction of microbial community structure
Hidehiro Ishizawa, Yosuke Tashiro, Daisuke Inoue, Michihiko Ike, Hiroyuki Futamata
Proceedings of the National Academy of Sciences Vol. 121 No. 7 2024年2月5日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Proceedings of the National Academy of Sciences
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非常時に環境中に残留する化学物質の除去技術：適用技術選択を支援するデータベースの構築及び汎用技術となり得る高機能型植栽浄化ユニットの開発
井上大介
地球環境 Vol. 28 No. 2 p. 241-248 2023年12月 研究論文（学術雑誌）
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Potential of Predatory Bacteria to Colonize the Duckweed Microbiome and Change Its Structure: A Model Study Using the Obligate Predatory Bacterium, Bacteriovorax sp. HI3
Daisuke Inoue, So Nakamura, Tomomi Sugiyama, Michihiko Ike
Microbes and Environments Vol. 38 No. 3 p. ME23040-n/a 2023年9月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japanese Society of Microbial Ecology
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Comparative evaluation of different substrates compiled in column‐type vertical‐flow constructed wetlands to remove heavy metals
Rajani Ghaju Shrestha, Kazuki Nishihata, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Environmental Quality Management Vol. 33 No. 2 p. 397-404 2023年8月16日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
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Enhancement of nutrient removal in an activated sludge process using aerobic granular sludge augmentation strategy with ammonium-based aeration control
Masaki Miyake, Yoshiaki Hasebe, Kazuki Furusawa, Hiroshi Shiomi, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Chemosphere p. 139826-139826 2023年8月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Bioaugmentation with marine sediment-derived microbial consortia in mesophilic anaerobic digestion for enhancing methane production under ammonium or salinity stress
Luong Van Duc, Shintaro Nagao, Mohammad Mojarrad, Yuta Miyagawa, Zi-Yan Li, Daisuke Inoue, Takahisa Tajima, Michihiko Ike
Bioresource Technology Vol. 376 2023年5月 研究論文（学術雑誌）
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Mitigating ammonia-inhibition in anaerobic digestion by bioaugmentation: A review
Zi-Yan Li, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water Process Engineering Vol. 52 2023年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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余剰汚泥をバイオ触媒としたポリヒドロキシアルカン酸の生産～下水処理場のバイオリファイナリーへの転換に向けて～
池道彦, 井上大介
日本水処理生物学会誌 Vol. 59 No. 1 p. 1-8 2023年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Development of a New Polar Organic Chemical Integrative Sampler for 1,4-dioxane Using Silicone Membrane as a Diffusion Barrier
Kazushi Noro, Satoshi Endo, Daisuke Inoue, Natsumi Suzuki, Hiroshi Kameoka, Junko Ono, Satoshi Nakamura, Yoshinori Yabuki
Environmental Toxicology and Chemistry Vol. 42 No. 2 p. 296-302 2023年2月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
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Pilot-scale demonstration of aerobic granular sludge augmentation applied to continuous-flow activated sludge process for the treatment of low-strength municipal wastewater
Masaki Miyake, Yoshiaki Hasebe, Kazuki Furusawa, Hiroshi Shiomi, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water Process Engineering Vol. 51 p. 103392-103392 2023年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Spontaneous cell lysis by Pelomonas saccharophila MRB3 provides plant-available macronutrients in hydroponic growth media and accelerates biomass production of duckweed
Hidehiro Ishizawa, Yukiko Kaji, Yuki Shimizu, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Ayaka Makino, Ryosuke Nakai, Hideyuki Tamaki, Masaaki Morikawa, Michihiko Ike
Vol. 21 No. 1 p. 49-58 2023年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Complete Genome Sequences of Two Predatory Bacterial Strains, Bacteriovorax sp. HI3 and Myxococcus sp. MH1, Isolated from a Freshwater Pond
Daisuke Inoue, Naoto Hiroshima, Hidehiro Ishizawa, Hideo Dohra, Michihiko Ike
Microbiology Resource Announcements Vol. 11 No. 12 2022年12月15日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：American Society for Microbiology
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Effectiveness of Column-Type Two-Stage Constructed Wetlands for Simultaneous Removal of Organic Compounds and Heavy Metals Focusing on the Impact of Feeding Modes and Hydraulic Retention Time
RAJANI GHAJU SHRESTHA, DAISUKE INOUE, MICHIHIKO IKE
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 58 No. 4 p. 137-148 2022年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japanese Society of Water Treatment Biology
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Effectiveness of tetrahydrofuran at enhancing the 1,4-dioxane degradation ability of activated sludge lacking prior exposure to 1,4-dioxane
Daisuke Inoue, Kazuki Hisada, Michihiko Ike
Water Science and Technology 2022年10月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：IWA Publishing
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Characterization of Two Novel Predatory Bacteria, Bacteriovorax stolpii HI3 and Myxococcus sp. MH1, Isolated from a Freshwater Pond: Prey Range, and Predatory Dynamics and Efficiency
Daisuke Inoue, Naoto Hiroshima, So Nakamura, Hidehiro Ishizawa, Michihiko Ike
Microorganisms Vol. 10 No. 9 p. 1816-1816 2022年9月10日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：{MDPI} {AG}
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Identification of key steps and associated microbial populations for efficient anaerobic digestion under high ammonium or salinity conditions
Luong Van Duc, Yuta Miyagawa, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Bioresource Technology 2022年7月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Whole structures, core taxa, and functional properties of duckweed microbiomes
Daisuke Inoue, Naoto Hiroshima, Hidehiro Ishizawa, Michihiko Ike
Bioresource Technology Reports Vol. 18 2022年6月 研究論文（学術雑誌）
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加温原位置バイオレメディエーションによるクロロエチレン類汚染地下水浄化
山崎祐二, 古川靖英, 中島朋宏, 稲葉薫, 清水孝昭, 西垣誠, 田小維, 鈴木市郎, 小林剛, 井上大介, 池道彦
土木学会論文集G (環境) Vol. 78 No. 2 p. 49-60 2022年5月 研究論文（学術雑誌）
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Efficient aerobic granular sludge production in simultaneous feeding and drawing sequencing batch reactors fed with low-strength municipal wastewater under high organic loading rate conditions
Masaki Miyake, Yoshiaki Hasebe, Kazuki Furusawa, Hiroshi Shiomi, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Biochemical Engineering Journal 2022年5月 研究論文（学術雑誌）
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Methods for selenium removal from contaminated waters: a review
Eric Lichtfouse, Nadia Morin-Crini, Corina Bradu, Youssef-Amine Boussouga, Mehran Aliaskari, Andrea Iris Schäfer, Soumya Das, Lee D. Wilson, Michihiko Ike, Daisuke Inoue, Masashi Kuroda, Sébastien Déon, Patrick Fievet, Grégorio Crini
Environmental Chemistry Letters 2022年3月28日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
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Genome-wide identification of bacterial colonization and fitness determinants on the floating macrophyte, duckweed
Hidehiro Ishizawa, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Communications Biology Vol. 5 No. 1 2022年1月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
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Microalgal transformation of food processing byproducts into functional food ingredients
Sunah Kim, Hidehiro Ishizawa, Daisuke Inoue, Tadashi Toyama, Jaecheul Yu, Kazuhiro Mori, Michihiko Ike, Taeho Lee
Bioresource Technology Vol. 344 p. 126324-126324 2022年1月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Temperature dependence of sequential chlorinated ethenes dechlorination and the dynamics of dechlorinating microorganisms
Yuji Yamazaki, Gaku Kitamura, Xiaowei Tian, Ichiro Suzuki, Takeshi Kobayashi, Takaaki Shimizu, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Chemosphere Vol. 287 p. 131989-131989 2022年1月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Effects of selection and compiling strategy of substrates in column-type vertical-flow constructed wetlands on the treatment of synthetic landfill leachate containing bisphenol A
Rajani Ghaju Shrestha, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 84 No. 6 p. 1428-1437 2021年9月15日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：{IWA} Publishing
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Optimization of aerobic dynamic discharge process for very rapid enrichment of polyhydroxyalkanoates-accumulating bacteria from activated sludge
Daisuke Inoue, Atsushi Fukuyama, Yu Ren, Michihiko Ike
Bioresource Technology Vol. 336 p. 125314-125314 2021年9月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier {BV}
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Degradation of N-nitrosamines and 1,4-dioxane using vacuum ultraviolet irradiation (UV254+185 nm or UV172 nm)
Takahiro Fujioka, Hitoshi Kodamatani, Hai Duc Minh Tran, Atsushi Fujioka, Koki Hino, Takumi Yoshikawa, Daisuke Inoue, Keisuke Ikehata
Chemosphere Vol. 278 p. 130326-130326 2021年9月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Coordination of leaf economics traits within the family of the world's fastest growing plants (Lemnaceae)
Hidehiro Ishizawa, Yusuke Onoda, Kaoru Kitajima, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Ecology Vol. 109 No. 8 p. 2950-2962 2021年8月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
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Isolation and Characterization of Euglena gracilis-Associated Bacteria, Enterobacter sp. CA3 and Emticicia sp. CN5, Capable of Promoting the Growth and Paramylon Production of E. gracilis under Mixotrophic Cultivation
Rubiyatno, Kazuhiro Mori, Daisuke Inoue, Sunah Kim, Jaecheul Yu, Taeho Lee, Michihiko Ike, Tadashi Toyama
Microorganisms Vol. 9 No. 7 p. 1496-1496 2021年7月13日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：{MDPI} {AG}
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クロロエチレン類の脱塩素化に用いる水素供与体としてのグルコン酸の汎用性
藤井 雄太, 三塚 和弘, 緒方 浩基, 井上 大介, 池 道彦
Vol. 44 No. 4 p. 69-77 2021年7月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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Treatment of 1,4-dioxane-containing water using carriers immobilized with indigenous microorganisms in landfill leachate treatment sludge: A laboratory-scale reactor study
Daisuke Inoue, Takumi Yoshikawa, Takuya Okumura, Yoshinori Yabuki, Michihiko Ike
Journal of Hazardous Materials Vol. 414 p. 125497-125497 2021年7月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Factors affecting antimonate bioreduction by Dechloromonas sp. AR-2 and Propionivibrio sp. AR-3
Ziran Yang, Takuya Sadakane, Hisaaki Hosokawa, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
3 Biotech Vol. 11 No. 4 2021年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC
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Microbial antimonate reduction and removal potentials in river sediments
Ziran Yang, Hisaaki Hosokawa, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Chemosphere Vol. 266 p. 129192-129192 2021年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Potential for Enhanced Degradation and Removal of Various Bisphenols by Interaction between Common Reed (Phragmites australis) and Microorganisms
Rajani Ghaju Shrestha, Miki Nakai, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water and Environment Technology Vol. 19 No. 1 p. 13-23 2021年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society on Water Environment
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クロロエチレン類による地下水汚染サイトのグルコン酸を用いた生物学的浄化
藤井雄太, 三塚和弘, 佐藤祐輔, 緒方浩基, 井上大介, 池道彦
土木学会論文集G（環境） Vol. 76 No. 7 p. III_269-III_276 2020年12月 研究論文（学術雑誌）
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Synthetic Bacterial Community of Duckweed: A Simple and Stable System to Study Plant-microbe Interactions
Hidehiro Ishizawa, Minami Tada, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Hiroyuki Futamata, Michihiko Ike
Microbes and Environments Vol. 35 No. 4 p. n/a-n/a 2020年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japanese Society of Microbial Ecology
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Assessment of 265-nm UV-LED for direct photolysis and advanced oxidation of N-nitrosamines and 1,4-dioxane
Takahiro Fujioka, Hitoshi Kodamatani, Takumi Yoshikawa, Daisuke Inoue, Keisuke Ikehata
Environmental Technology & Innovation Vol. 20 p. 101147-101147 2020年11月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Isolation and Characterization of Facultative-Anaerobic Antimonate-Reducing Bacteria
Ziran Yang, Hisaaki Hosokawa, Takuya Sadakane, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Hiroshi Nishikawa, Michihiko Ike
Microorganisms Vol. 8 No. 9 p. 1435-1435 2020年9月18日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：MDPI AG
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Development and characterization of a chloroethenes-dechlorinating consortium using gluconate as a hydrogen donor
Yuta Fujii, Kazuhiro Mitsuka, Hiroki Ogata, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water and Environment Technology Vol. 18 No. 4 p. 212-225 2020年8月 研究論文（学術雑誌）
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DNA-based evaluation of biological mercury methylation potential in waste landfill
Daisuke Inoue, Jing Yang, Masaki Takaoka, Kazunari Sei, Tomonori Ishigaki
Global Environmental Research Vol. 24 No. 1 p. 19-25 2020年7月 研究論文（学術雑誌）
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Community dynamics of duckweed-associated bacteria upon inoculation of plant growth-promoting bacteria
Hidehiro Ishizawa, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Masaaki Morikawa, Michihiko Ike
FEMS Microbiology Ecology 2020年7月 研究論文（学術雑誌）
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Effect of elevated temperature on cis-1,2-dichloroethene dechlorination and microbial community structure in contaminated soils – a biostimulation approach
Yuji Yamazaki, Ai Hasegawa, Xiaowei Tian, Ichiro Suzuki, Takeshi Kobayashi, Takaaki Shimizu, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Environmental Chemical Engineering Vol. 8 No. 2 2020年4月 研究論文（学術雑誌）
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Carbon sources that enable enrichment of 1,4-dioxane-degrading bacteria in landfill leachate
Daisuke Inoue, Kazuki Hisada, Takuya Okumura, Yoshinori Yabuki, Gen Yoshida, Masashi Kuroda, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 31 No. 1-2 p. 23-34 2020年4月 研究論文（学術雑誌）
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Draft genome sequence of Rhodococcus aetherivorans JCM 14343T, a bacterium capable of degrading recalcitrant non-cyclic and cyclic ethers
Daisuke Inoue, Masatoshi Nakazawa, Norifumi Yamamoto, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Microbiology Resource Announcements Vol. 9 No. 3 2020年1月 研究論文（学術雑誌）
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Enhanced biomass production and nutrient removal capacity of duckweed via two-step cultivation process with a plant growth-promoting bacterium, Acinetobacter calcoaceticus P23
Hidehiro Ishizawa, Yuka Ogata, Yoshiyuki Hachiya, Ko-ichiro Tokura, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Tadashi Toyama, Yasuhiro Tanaka, Kazuhiro Mori, Masaaki Morikawa, Michihiko Ike
Chemosphere Vol. 238 2020年1月 研究論文（学術雑誌）
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Stimulatory and inhibitory effects of metals on 1,4-dioxane degradation by four different 1,4-dioxane-degrading bacteria
Daisuke Inoue, Tsubasa Tsunoda, Kazuko Sawada, Norifumi Yamamoto, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Chemosphere Vol. 238 2020年1月 研究論文（学術雑誌）
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Potential of waste activated sludge to accumulate polyhydroxyalkanoates and glycogen using industrial wastewater/liquid wastes as substrates
Michihiko Ike, Yukihiro Okada, Takaaki Narui, Kosuke Sakai, Masashi Kuroda, Satoshi Soda, Daisuke Inoue
Water Science and Technology Vol. 80 No. 12 p. 2372-2380 2019年12月 研究論文（学術雑誌）
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Biological removal of selenate in saline wastewater by activated sludge under alternating anoxic/oxic conditions
Yuanyuan Zhang, Masashi Kuroda, Shunsuke Arai, Fumitaka Kato, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Frontiers of Environmental Science and Engineering Vol. 13 No. 5 2019年10月 研究論文（学術雑誌）
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Rapid enrichment of polyhydroxyalkanoate-accumulating bacteria by the aerobic dynamic discharge process: Enrichment effectiveness, polyhydroxyalkanoate accumulation ability, and bacterial community characteristics in comparison with the aerobic dynamic feeding process
Daisuke Inoue, Atsushi Fukuyama, Yu Ren, Michihiko Ike
Bioresource Technology Reports Vol. 7 2019年9月 研究論文（学術雑誌）
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Colonization and competition dynamics of plant growth-promoting/inhibiting bacteria in the phytosphere of the duckweed of Lemna minor
Hidehiro Ishizawa, Masashi Kuroda, Kanako Inoue, Daisuke Inoue, Masaaki Morikawa, Michihiko Ike
Microbial Ecology Vol. 77 No. 2 p. 440-450 2019年8月 研究論文（学術雑誌）
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Comparison of pathogenic bacteria in water and fecal-source samples in the Kathmandu Valley, Nepal, using high-throughput DNA microarray
Rajani Ghaju Shrestha, Kazuko Sawada, Daisuke Inoue, Hayato Yoshinaga, Bikash Malla, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Yasuhiro Tanaka, Kazunari Sei, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Biomedical Journal of Scientific and Technical Research 2019年5月 研究論文（学術雑誌）
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Performance of plant growth-promoting bacterium of duckweed under different kinds of abiotic stress factors
Hidehiro Ishizawa, Minami Tada, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Biocatalysis and Agricultural Biotechnology Vol. 19 2019年5月 研究論文（学術雑誌）
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Biological treatment of selenate-containing saline wastewater by activated sludge under oxygen-limiting conditions
Yuanyuan Zhang, Masashi Kuroda, Shunsuke Arai, Fumitaka Kato, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Water Research Vol. 154 p. 327-335 2019年5月 研究論文（学術雑誌）
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Nitrogen-cycling functional genes in brackish and freshwater sediments in Yodo River in Japan
Junqin Pang, Mei Yamato, Satoshi Soda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water and Environment Technology Vol. 17 No. 2 p. 109-116 2019年4月 研究論文（学術雑誌）
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1,4-ジオキサン含有排水処理における従来技術の課題と生物学的処理適用の可能性
山本哲史, 井上大介, 斎藤祐二, 池道彦
日本水処理生物学会誌 Vol. 55 No. 1 p. 1-13 2019年3月 研究論文（学術雑誌）
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Identification of Human and Animal Fecal Contamination in Drinking Water Sources in the Kathmandu Valley, Nepal, Using Host-Associated Bacteroidales Quantitative PCR Assays
Bikash Malla, Rajani Ghaju Shrestha, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Daisuke Inoue, Kazunari SEI, Yasuhiro Tanaka, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Water 2018年12月 研究論文（学術雑誌）
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Identification of human and animal fecal contamination in drinking water sources in the Kathmandu Valley, Nepal, using host-associated Bacteroidales quantitative PCR assays
Bikash Malla, Rajani Ghaju Shrestha, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Yasuhiro Tanaka, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Water 2018年12月 研究論文（学術雑誌）
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Biomass production and nutrient removal through cultivation of Euglena gracilis in domestic wastewater
Masashi Kuroda, Taro Horino, Daisuke Inoue, Masaaki Morikawa, Michihiko Ike
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 54 No. 4 p. 105-113 2018年12月 研究論文（学術雑誌）
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Field test of on-site treatment of 1,4-dioxane-contaminated groundwater using Pseudonocardia sp. D17
Norifumi Yamamoto, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Yuji Saito, Michihiko Ike
Journal of Water and Environment Technology Vol. 16 No. 6 p. 256-268 2018年12月 研究論文（学術雑誌）
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Complete genome sequences of two plant growth-inhibiting bacteria, Acinetobacter ursingii M3 and Asticcacaulis excentricus M6, isolated from duckweed, Lemna minor
Hidehiro Ishizawa, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Microbiology Resource Announcements Vol. 7 No. 12 2018年9月 研究論文（学術雑誌）
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Development of a quantitative PCR assay for Arcobacter spp. and its application to environmental water samples
Rajani Ghaju Shrestha, Yasuhiro Tanaka, Bikash Malla, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Microbes and Environments Vol. 33 No. 3 p. 309-316 2018年9月 研究論文（学術雑誌）
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Validation of host‐specific Bacteroidales quantitative PCR assays and their application to microbial source tracking of drinking water sources in the Kathmandu Valley, Nepal
B. Malla, R. Ghaju Shrestha, S. Tandukar, D. Bhandari, D. Inoue, K. Sei, Y. Tanaka, J.B. Sherchand, E. Haramoto
Journal of Applied Microbiology Vol. 125 No. 2 p. 609-619 2018年8月23日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
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Validation of host-specific Bacteroidales quantitative PCR assays and their application to microbial source tracking of drinking water sources in the Kathmandu Valley, Nepal
Bikash Malla, Rajani Ghaju Shrestha, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Yasuhiro Tanaka, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Journal of Applied Microbiology Vol. 125 No. 2 p. 609-619 2018年8月 研究論文（学術雑誌）
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Cake layer bacterial communities during different biofouling stages in full-scale membrane bioreactors
Kazuki Takada, Toshihiko Shiba, Takako Yamaguchi, Yui Akane, Yoshinari Nakayama, Satoshi Soda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Bioresource Technology Vol. 259 p. 259-267 2018年7月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier Ltd
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Growth promotion of three microalgae, Chlamydomonas reinhardtii, Chlorella vulgaris and Euglena gracilis, by in situ indigenous bacteria in wastewater effluent
Tadashi Toyama, Mari Kasuya, Tsubasa Hanaoka, Naoto Kobayashi, Yasuhiro Tanaka, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Masaaki Morikawa, Kazuhiro Mori
Biotechnology for Biofuels Vol. 11 2018年6月 研究論文（学術雑誌）
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Comprehensive detection of pathogenic bacteria in jar water, community well groundwater, and environmental water in the Kathmandu Valley, Nepal
Daisuke Inoue, Hayato Yoshinaga, Bikash Malla, Rajani Ghaju Shrestha, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Yasuhiro Tanaka, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto, Kazunari Sei
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 54 No. 2 p. 65-72 2018年6月 研究論文（学術雑誌）
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1,4-Dioxane degradation characteristics of Rhodococcus aetherivorans JCM 14343
Daisuke Inoue, Tsubasa Tsunoda, Norifumi Yamamoto, Michihiko Ike, Kazunari Sei
Biodegradation Vol. 29 No. 3 p. 301-310 2018年6月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Netherlands
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Characterization of newly isolated Pseudonocardia sp. N23 with high 1,4-dioxane-degrading ability
Norifumi Yamamoto, Yuji Saito, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 125 No. 5 p. 552-558 2018年5月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier B.V.
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カスケード利用とユーザー視点導入による下水処理場の価値向上～消化汚泥の肥料利用を例として～
藤原拓, 井上大介, 前田守弘, 山根信三, 野村洋平, Jia Sijing, Kai Cao
Vol. 41 No. 5 p. 50-54 2018年4月
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LAMP法によるDehalococcoidesの定量検出法の開発と地下水バイオスティミュレーションへの適用
山崎祐二, 古川靖英, 田邉康太, 奥田信康, 井上大介, 清和成
土木学会論文集G (環境) 2018年4月 研究論文（学術雑誌）
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1,4-ジオキサン汚染地下水の生物浄化技術
池道彦, 井上大介, 黒田真史, 山本哲史
科学と工業 Vol. 92 No. 3 p. 57-64 2018年3月
出版者・発行元：大阪工研協会
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Polyhydroxyalkanoate accumulation ability and associated microbial community in activated sludge-derived acetate-fed microbial cultures enriched under different temperature and pH conditions
Daisuke Inoue, Yuta Suzuki, Kazuko Sawada, Kazunari Sei
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 125 No. 3 p. 346-352 2018年3月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier B.V.
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Bioaugmenting a lab-scale membrane bioreactor with 4-tert-butylphenol-degrading bacterium, Sphingobium fuliginis OMI
Kazuki Takada, Toshihiko Shiba, Satoshi Soda, Daisuke Inoue, Masaki Miyake, Masahiro Eguchi, Michihiko Ike
日本水処理生物学会誌 Vol. 54 No. 1 p. 1-12 2018年3月 研究論文（学術雑誌）
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1,4-ジオキサン分解菌Pseudonocardia sp. N23を用いた化成品製造工業排水処理システムの開発
山本哲史, 井上大介, 黒田真史, 瀧寛則, 清和成, 斎藤祐二, 池道彦
用水と廃水 Vol. 60 No. 2 p. 139-150 2018年1月 研究論文（学術雑誌）
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Identification of microbial populations contributing to nitrification-associated nitrous oxide emission during cattle manure composting process with forced aeration
Daisuke Inoue, Kazuko Sawada, Hirofumi Tsutsui, Taku Fujiwara
Journal of Material Cycles and Waste Management Vol. 20 No. 1 p. 353-360 2018年1月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Springer Tokyo
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農産業に関わる水・バイオマス循環利用に関する最新研究動向
藤原拓, 永禮英明, 山田正人, 和木美代子, 前田守弘, 日髙平, 今井剛, 井原一高, 井上大介
水環境学会誌 Vol. 40 No. 12 p. 416-423 2017年12月
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Next-generation sequencing identification of pathogenic bacterial genes and its relationship with fecal indicator bacteria in different water sources in the Kathmandu Valley, Nepal
Rajani Ghaju Shrestha, Yasuhiro Tanaka, Bikash Malla, Dinesh Bhandari, Sarmila Tandukar, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Science of the Total Environment Vol. 601-602 p. 278-284 2017年12月 研究論文（学術雑誌）
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1,4-Dioxane degradation characteristics of Rhodococcus aetherivorans JCM 14343
Daisuke Inoue, Tsubasa Tsunoda, Norifumi Yamamoto, Michihiko Ike, Kazunari Sei
Abstract book of CESE2017, the 10th Annual Conference of the Challenges in Environmental Science and Engineering p. 20-20 2017年11月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Nitrification potential and relevant microbial populations in agricultural soil in coastal areas of Central Vietnam
Daisuke Inoue, Kazuko sawada, Nguyern Duc Huy, Hidetaka Chikamori, Morihiro Maeda
Proceedings of Okayama University - Hue University Joint Symposium on Education and Research Programs for Environmental and Agricultural Sciences p. 14-15 2017年11月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Draft genome sequence of Sphingobium fuliginis OMI, a bacterium that degrades alkylphenols and bisphenols
Masashi Kuroda, Yuka Ogata, Tatsuya Yahara, Takashi Yokoyama, Hidehiro Ishizawa, Kazuki Takada, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Genome Announcements Vol. 5 No. 47 p. e01323-17 2017年11月 研究論文（学術雑誌）
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Draft genome sequence of Pseudonocardia sp. strain N23, a 1,4-dioxane-degrading bacterium
Norifumi Yamamoto, Daisuke Inoue, Masashi Kuroda, Michihiko Ike
Genome Announcements Vol. 5 No. 44 2017年11月1日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：American Society for Microbiology
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Quantitative PCR detection of 16S rRNA and ciaB genes of Arcobacter spp. in human and animal fecal source samples in the Kathmandu Valley, Nepal
Rajani Ghaju Shrestha, Yasuhiro Tanaka, Bikash Malla, Sarmila Tandukar, Dinesh Bhandari, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Extended Abstracts of the 5th International Young Researchers Workshop on River Basin Environment and Management p. 81-81 2017年10月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Analysis of nitrogen contamination mechanism of groundwater in coastal areas of Central Vietnam by using stable isotopes
Morihiro Maeda, Haruka Kiba, Fujio Hyodo, Hidetaka Chikamori, Daisuke Inoue
Proceedings of the International Conference of Nitrogen Cycling and Its Environmental Impacts in East Asia (NCEIEA) 2017年10月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Development of bioreactor using Pseudonocardia sp. D17 for treatment of wastewater containing 1,4-dioxane
Kuroda, M, Fukugasako, K, Nakazawa, M, Hisada, K, Koike, K, Yamamoto, N, Inoue, D, Ike, M
2017年9月
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Pseudonocardia属：知名度は低いが以外に有用な微生物
井上大介
生物工学会誌 Vol. 95 No. 9 p. 547-547 2017年9月
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Polyhydroxybutyrate accumulation ability and relevant microbial populations in acetate-fed mixed microbial cultures enriched from activated sludge under different temperature conditions
Daisuke Inoue, Yuta Suzuki, Jota Morohoshi, Kazunari Sei
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 53 No. 2 p. 57-67 2017年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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1,4-Dioxane degradation potential of members of the genera Pseudonocardia and Rhodococcus
Daisuke Inoue, Tsubasa Tsunoda, Kazuko Sawada, Norifumi Yamamoto, Yuji Saito, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 27 No. 4-6 p. 277-286 2016年11月 研究論文（学術雑誌）
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Detection of retinoic acid receptor antagonist contamination in the aquatic environment of the Kinki region of Japan
Daisuke Inoue, Kazuko Sawada, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Water Research Vol. 103 p. 58-65 2016年10月 研究論文（学術雑誌）
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Characterization of the genes involved in nitrogen cycling in wastewater treatment plants using DNA microarray and most probable number-PCR
Junqin Pang, Masami Matsuda, Masashi Kuroda, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Kei Nishida, Michihiko Ike
Frontiers of Environmental Science and Engineering Vol. 10 No. 4 2016年8月 研究論文（学術雑誌）
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Changes in bacterial community structure in a full-scale membrane bioreactor for municipal wastewater treatment
Kurumi Hashimoto, Hirofumi Tsutsui, Kazuki Takada, Hiroshi Hamada, Kousuke Sakai, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Kyoko Yamashita, Koji Tsuji, Toshikazu Hashimoto, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 122 No. 1 p. 97-104 2016年7月 研究論文（学術雑誌）
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1-1-4 土壌還元消毒時の亜酸化窒素発生に関連する脱窒微生物挙動の分子生物学的解析（1-1 物質循環・動態，2016年度佐賀大会）
前田 守弘, 嶋田 翔子, 井上 大介
日本土壌肥料学会講演要旨集 Vol. 62 p. 2-2 2016年
出版者・発行元：一般社団法人 日本土壌肥料学会
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Polyhydroxyalkanoate production potential of heterotrophic bacteria in activated sludge
Daisuke Inoue, Yuta Suzuki, Takahiro Uchida, Jota Morohoshi, Kazunari Sei
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 121 No. 1 p. 47-51 2016年1月 研究論文（学術雑誌）
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Detection of Cryptosporidium, Giardia, fecal indicator bacteria, and total bacteria in commercial jar water in the Kathmandu Valley, Nepal
Bikash Malla, Rajani Ghaju Shrestha, Dinesh Bhandari, Sarmila Tandukar, Sadhana Shrestha, Hayato Yoshinaga, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Kei Nishida, Yasuhiro Tanaka, Jeevan B. Sherchand, Eiji Haramoto
Journal of Institute of Medicine Vol. 37 No. 2 p. 10-15 2015年8月 研究論文（学術雑誌）
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Relationship between respiratory quotient, nitrification, and nitrous oxide emissions in a forced aerated composting process
Hirofumi Tsutsui, Taku Fujiwara, Daisuke Inoue, Ryusei Ito, Kazutsugu Matsukawa, Naoyuki Funamizu
Waste Management Vol. 42 p. 10-16 2015年8月 研究論文（学術雑誌）
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RNA recovery method suitable for analysis of microbial communities in cattle manure composting samples
Daisuke Inoue, Kazuko Sawada, Satoshi Shikama, Kazunari Sei, Taku Fujiwara
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 51 No. 1 p. 1-9 2015年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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High-throughput DNA microarray detection of pathogenic bacteria in shallow well groundwater in the Kathmandu Valley, Nepal
Daisuke Inoue, Takuji Hinoura, Noriko Suzuki, Junqin Pang, Rabin Malla, Sadhana Shrestha, Saroj Kumar Chapagain, Hiroaki Matsuzawa, Takashi Nakamura, Yasuhiro Tanaka, Michihiko Ike, Kei Nishida, Kazunari Sei
Current Microbiology Vol. 70 No. 1 p. 43-50 2015年1月 研究論文（学術雑誌）
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Polyhydroxyalkanoate (PHA) accumulation potential and PHA-accumulating microbial communities in various activated sludge processes of municipal wastewater treatment plants
Kousuke Sakai, Sawa Miyake, Koichi Iwama, Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Journal of Applied Microbiology Vol. 118 No. 1 p. 255-266 2015年1月 研究論文（学術雑誌）
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Development of a whole community genome amplification-assisted DNA microarray method to detect functional genes involved in the nitrogen cycle
Daisuke Inoue, Junqin Pang, Masami Matsuda, Kazunari Sei, Kei Nishida, Michihiko Ike
World Journal of Microbiology and Biotechnology Vol. 30 No. 11 p. 2907-2915 2014年11月 研究論文（学術雑誌）
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Bacterial community dynamics in a full-scale municipal wastewater treatment plant employing conventional activated sludge process
Kurumi Hashimoto, Masami Matsuda, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 118 No. 1 p. 64-71 2014年7月 研究論文（学術雑誌）
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Isolation and characterization of bacterial strains that have high ability to degrade 1,4-dioxane as a sole carbon and energy source
Kazunari Sei, Keiko Miyagaki, Takashi Kakinoki, Kunihiro Fukugasako, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 24 No. 5 p. 665-674 2013年9月 研究論文（学術雑誌）
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石油汚染土壌の浄化過程における微生物群集の炭素源資化能の変化
惣田訓, 井上大介, 清和成, 池道彦, 藤田正憲, 岡村和夫
環境技術 Vol. 42 No. 8 p. 479-488 2013年8月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Society of Environmental Conservation Engineering
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Removal characteristics of retinoic acids and 4-oxo-retinoic acids in wastewater by activated sludge treatment
Daisuke Inoue, Kazuko Sawada, Yuichiro Wada, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 67 No. 12 p. 2868-2874 2013年6月 研究論文（学術雑誌）
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都市下水処理場におけるレチノイン酸類および4-oxo-レチノイン酸類の挙動の解析
澤田和子, 井上大介, 清和成, 池道彦
水環境学会誌 Vol. 36 No. 2 p. 57-65 2013年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society on Water Environment
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Isolation and characterization of tetrahydrofuran-degrading bacteria for 1,4-dioxane-containing wastewater treatment by co-metabolic degradation
Kazunari Sei, Masao Oyama, Takashi Kakinoki, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Journal of Water and Environment Technology Vol. 11 No. 1 p. 11-19 2013年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society on Water Environment
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A co-beneficial system using aquatic plants: Bioethanol production from free-floating aquatic plants used for water purification
S. Soda, D. Mishima, D. Inoue, M. Ike
Water Science and Technology Vol. 67 No. 11 p. 2637-2644 2013年 研究論文（学術雑誌）
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Plasmid-mediated bioaugmentation of sequencing batch reactors for enhancement of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid removal in wastewater using plasmid pJP4
Hirofumi Tsutsui, Yasutaka Anami, Masami Matsuda, Kurumi Hashimoto, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 24 No. 3 p. 343-352 2013年 研究論文（学術雑誌）
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Statistical analysis of global warming potential, eutrophication potential, and sludge production of wastewater treatment plants in Japan
Satoshi Soda, Takashi Arai, Daisuke Inoue, Tomonori Ishigaki, Michihiko Ike, Masato Yamada
Journal of Sustainable Energy and Environment Vol. 4 No. 1 p. 33-40 2013年1月 研究論文（学術雑誌）
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Bacterial community succession during the enrichment of chemolithoautotrophic arsenite oxidizing bacteria at high arsenic concentrations
Nguyen Ai Le, Akiko Sato, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Journal of Environmental Sciences Vol. 24 No. 12 p. 2133-2140 2012年12月 研究論文（学術雑誌）
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Arsenic adsorption characteristics of biogenic iron oxides in comparison to chemogenic iron oxides
Nguyen Ai Le, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Vol. 48 No. 4 p. 145-156 2012年12月 研究論文（学術雑誌）
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ジーンバイオオーグメンテーションによる活性汚泥リアクターの2,4-ジクロロフェノキシ酢酸の除去能の向上
惣田訓, 穴見泰崇, 筒井裕文, 橋本くるみ, 松田真佐美, 井上大介, 清和成, 池道彦
土木学会論文集G Vol. 68 No. 7 p. III_369-III_377 2012年11月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society of Civil Engineers
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Erratum: Detection of retinoic acid receptor agonistic activity and identification of causative compounds in municipal wastewater treatment plants in Japan
Kazuko Sawada, Daisuke Inoue, Yuichiro Wada, Kazunari Sei, Tsuyoshi Nakanishi, Michihiko Ike
Environmental Toxicology and Chemistry Vol. 31 No. 9 p. 2189-2190 2012年9月 研究論文（学術雑誌）
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Enrichment of arsenite oxidizing bacteria under autotrophic conditions and the isolation and characterization of facultative chemolithoautotrophic arsenite oxidizing bacteria for removal of arsenic from groundwater
Le Nguyen Ai, Akiko Sato, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Water Science and Technology: Water Supply Vol. 12 No. 5 p. 707-714 2012年8月 研究論文（学術雑誌）
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活性汚泥内の抗生物質耐性細菌および重金属耐性細菌の保有するプラスミドの特徴づけ
橋本くるみ, 井上大介, 惣田訓, 池道彦
下水道協会誌（論文集） Vol. 49 No. 594 p. 104-111 2012年4月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本下水道協会
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Impacts of gene bioaugmentation with pJP4-harboring bacteria of 2,4-D-contaminated soil slurry on the indigenous microbial community
Daisuke Inoue, Yuji Yamazaki, Hirofumi Tsutsui, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 23 No. 2 p. 263-276 2012年4月 研究論文（学術雑誌）
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Characterization of microbial communities distributed in the groundwater pumped from deep tube wells in the Kathmandu Valley of Nepal
Yasuhiro Tanaka, Kei Nishida, Takashi Nakamura, Saroj Kumar Chapagain, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Kazuhiro Mori, Yasushi Sakamoto, Futaba Kazama
Vol. 10 No. 1 p. 170-180 2012年3月 研究論文（学術雑誌）
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Detection of retinoic acid receptor agonistic activity and identification of causative compounds in municipal wastewater treatment plants in Japan
Kazuko Sawada, Daisuke Inoue, Yuichiro Wada, Kazunari Sei, Tsuyoshi Nakanishi, Michihiko Ike
Environmental Toxicology and Chemistry Vol. 31 No. 2 p. 307-315 2012年2月 研究論文（学術雑誌）
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Accelerated biodegradation of pyrene and benzo[a]pyrene in Phragmites australis rhizosphere by rhizosphere bacteria-root exudates interactions
Tadashi Toyama, Tetsuya Furukawa, Noritaka Maeda, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Kazuhiro Mori, Shintaro Kikuchi, Michihiko Ike
Water Research, 45(4), 1629-1638 Vol. 45 No. 4 p. 1629-1638 2011年2月 研究論文（学術雑誌）
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Screening of agonistic activities against four nuclear receptors in wastewater treatment plants in Japan using a yeast two-hybrid assay
Daisuke Inoue, Koki Nakama, Kazuko Sawada, Taro Watanabe, Hisae Matsui, Kazunari Sei, Tsuyoshi Nakanishi, Michihiko Ike
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCES Vol. 23 No. 1 p. 125-132 2011年 研究論文（学術雑誌）
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Transfer of plasmid pJP4 from Escherichia coli and Pseudomonas putida to bacteria in activated sludge developed under different sludge retention time
Hirofumi Tsutsui, Yasutaka Anami, Masami Matsuda, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 110 No. 6 p. 684-689 2010年12月 研究論文（学術雑誌）
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Isolation and characterization of 4-tert-butylphenol-utilizing Sphingobium fuliginis strains from Phragmites australis rhizosphere sediment
Tadashi Toyama, Naonori Momotani, Yuka Ogata, Yuji Miyamori, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Kazuhiro Mori, Shintaro Kikuchi, Michihiko Ike
Applied and Environmental Microbiology Vol. 76 No. 20 p. 6733-6740 2010年10月 研究論文（学術雑誌）
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海水中におけるビスフェノールAおよびビスフェノールFの生分解ポテンシャルの評価
井上大介, 野本直樹, 清和成, 惣田訓, 池道彦
日本水処理生物学会誌 Vol. 46 No. 3 p. 137-144 2010年9月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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Evaluation of biodegradation potential of 1,4-dioxane by river, soil and activated sludge samples
Kazunari Sei, Takashi Kakinoki, Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Biodegradation Vol. 21 No. 4 p. 585-591 2010年7月 研究論文（学術雑誌）
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８か所のコミュニティ・プラントの温室効果ガス排出量の調査
濱田武志, 古田祐介, 井上大介, 石垣智基, 惣田訓, 池道彦, 山田正人
用水と廃水 Vol. 52 No. 6 p. 490-497 2010年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：産業用水調査会
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Disruption of retinoic acid receptor signaling by environmental pollutants
Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Journal of Health Science Vol. 56 No. 3 p. 221-230 2010年6月 研究論文（学術雑誌）
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Microbial population dynamics during startup of a full-scale anaerobic digester treating industrial food waste in Kyoto eco-energy project
Michihiko Ike, Daisuke Inoue, Tomoki Miyano, Tong Tong Liu, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Shiro Kadoshin
Bioresource Technology Vol. 101 No. 11 p. 3952-3957 2010年6月 研究論文（学術雑誌）
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Contamination with retinoic acid receptor agonists in two river basin in the Kinki district of Japan
Daisuke Inoue, Koki Nakama, Kazuko Sawada, Taro Watanabe, Mai Takagi, Kazunari Sei, Min Yang, Junji Hirotsuji, Jianying Hu, Jun-ichi Nishikawa, Tsuyoshi Nakanishi, Michihiko Ike
Water Research Vol. 44 No. 8 p. 2409-2418 2010年4月 研究論文（学術雑誌）
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Accelerated degradation of a variety of aromatic compounds by Spirodela polyrrhiza-bacterial associations and contribution of root exudates released from S. polyrrhiza
Hoang Hai, Ning Yu, Tadashi Toyama, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Journal of Environmental Sciences Vol. 22 No. 4 p. 494-499 2010年4月 研究論文（学術雑誌）
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水生生物を対象としたレチノイド様化学物質による生体影響評価のためのin vivoアッセイ系の構築
廣森 洋平, 佐藤 祥曉, 山口 雄士, 澤田 和子, 井上 大介, 清 和成, 池 道彦, 中西 剛, 永瀬 久光
日本トキシコロジー学会学術年会 Vol. 37 No. 0 p. 396-396 2010年
出版者・発行元：日本毒性学会
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Comparative analysis of DNA-based microbial community composition and substrate utilisation patterns of activated sludge microorganisms from wastewater treatment plants operated under different conditions
M. Matsuda, D. Inoue, Y. Anami, H. Tsutsui, K. Sei, S. Soda, M. Ike
WATER SCIENCE AND TECHNOLOGY Vol. 61 No. 11 p. 2843-2851 2010年 研究論文（学術雑誌）
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Transfer plasmid pJP4 from Escherichia coli to activated sludge bacteria by filter mating
Hirofumi Tsutsui, Satoshi Soda, Satoshi Takeda, Hidetaka Ohtsuki, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 45 No. 4 p. 185-191 2009年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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Characterization of tetrahydrofuran degrading bacteria for the treatment of wastewater containing 1,4-dioxane by co-metabolic degradation
Kazunari Sei, Masao Oyama, Takashi Kakinoki, Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Proceedings of IWA 2nd Asia Pacific Regional Young Water Professionals Conference, (In Press) 2009年11月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Screening of multiple nuclear receptor agonistic activities in wastewater treatment plants in Japan using yeast two-hybrid assay
Daisuke Inoue, Koki Nakama, Taro Watanabe, Kazuko Sawada, Hisae Matsui, Kazunari Sei, Tsuyoshi Nakanishi, Michihiko Ike
Proceedings of IWA 2nd Asia Pacific Regional Young Water Professionals Conference, (In Press) Vol. 23 No. 1 p. 125-132 2009年11月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Enhancement of biodegradation potential of various aromatic compounds by sequencing batch experiments using Spirodela polyrrhiza-bacterial associations
Kazunari Sei, Ning Yu, Tadashi Toyama, Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Proceedings of IWA Specialist Conference Chemical Industries (Water & Industry 2009), (In Press) 2009年11月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Comparative analysis of DNA-based microbial community composition and substrate utilization patterns of activated sludge microorganisms from wastewater treatment plants operated under different conditions
Masami Matsuda, Daisuke Inoue, Yasutaka Anami, Hirofumi Tsutsui, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Proceedings of the 3rd IWA-Aspire Conference & Exhibition, pp. 64-65(STD2-0-2, full paper in USB flush memory) Vol. 61 No. 11 p. 2843-2851 2009年10月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Occurrence of 4-tert-butylphenol degradation in aquatic samples caused by the presence of Spirodela polyrrhiza
Yuka Ogata, Naonori Momotani, Tadashi Toyama, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Proc. of the 3rd IWA-Aspire Conference & Exhibition, pp. 63-64 (STD2-0-1, full paper in USB flush memory). 2009年10月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
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Effects of intermittent and continuous aeration on accelerative stabilization and microbial population dynamics in landfill bioreactors
Nguyen Nhu Sang, Satoshi Soda, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 108 No. 4 p. 336-343 2009年10月 研究論文（学術雑誌）
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ウキクサ根圏におけるノニルフェノールの微生物分解―分解菌の分離とその特徴―
池道彦, 井上大介, 遠山忠, 松永祐紀, 桃谷尚憲, Hoang Hai, 清和成, 惣田訓
環境技術 Vol. 38 No. 9 p. 633-641 2009年9月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Society of Environmental Conservation Engineering
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Occurrence and persistence of indigenous transconjugants carrying conjugative plasmids in soil
Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Hirofumi Tsutsui, Yuji Yamazaki, Katsushi Murashige, Kazunari Sei, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 108 No. 3 p. 231-234 2009年9月 研究論文（学術雑誌）
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Enrichment of bacteria possessing catechol dioxygenase genes in the rhizosphere of Spirodela polyrrhiza: a mechanism of accelerated biodegradation of phenol
Tadashi Toyama, Kazunari Sei, Ning Yu, Hirohide Kumada, Daisuke Inoue, Hai Hoang, Satoshi Soda, Young-Cheol Chang, Shintaro Kikuchi, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Water Research Vol. 43 No. 15 p. 3765-3776 2009年8月 研究論文（学術雑誌）
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Biodegradation of bisphenol A and bisphenol F in rhizosphere sediment of Phragmites australis
Tadashi Toyama, Yusuke Sato, Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Young-Cheol Chang, Shintaro Kikuchi, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 108 No. 2 p. 147-150 2009年8月 研究論文（学術雑誌）
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Evaluation of effectiveness of chemical and physical sewage treatment technologies for removal of retinoic acid receptor agonistic activity detected in sewage effluent
Daisuke Inoue, Hisae Matsui, Kazunari Sei, Jianying Hu, Min Yang, Jun Aragane, Junji Hirotsuji, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 59 No. 12 p. 2447-2453 2009年6月 研究論文（学術雑誌）
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Characterization of novel 4-n-butylphenol degrading Pseudomonas veronii strains isolated from rhizosphere of giant duckweed, Spirodela polyrrhiza
Hoang Hai, Daisuke Inoue, Naonori Momotani, Ning Yu, Tadashi Toyama, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 45 No. 2 p. 83-92 2009年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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酵母Two-hybrid法を用いた河川水中の各種核内受容体アゴニスト活性の評価－レチノイン酸受容体アゴニストによる汚染に焦点をあてて－
井上大介, 中間公規, 清和成, 池道彦
用水と廃水 Vol. 51 No. 5 p. 405-413 2009年5月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：産業用水調査会
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Detection of agonistic activities against five human nuclear receptors in river environments of Japan using a yeast two-hybrid assay
Daisuke Inoue, Koki Nakama, Hisae Matsui, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology Vol. 82 No. 4 p. 399-404 2009年4月 研究論文（学術雑誌）
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Multiple detection of occurrence of bacterial pathogens in two rivers in the Kinki district of Japan with a DNA microarray
Daisuke Inoue, Masaki Inaba, Rahul R. Upadhye, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 45 No. 1 p. 31-43 2009年3月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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Evaluation of wastewater reclamation technologies based on in vitro and in vivo bioassays
Nan Cao, Min Yang, Yu Zhang, Jianying Hu, Michihiko Ike, Junji Hirotsuji, Hisae Matsui, Daisuke Inoue, Kazunari Sei
Science of the Total Environment Vol. 407 No. 5 p. 1588-1597 2009年2月 研究論文（学術雑誌）
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Evaluation of biodegradation potential of organic compounds by river water microorganisms
Daisuke Inoue, Masaki Inaba, Ning Yu, Yuto Shima, Takao Ueno, Kazunari Sei, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 59 No. 2 p. 317-322 2009年2月 研究論文（学術雑誌）
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Development of DNA microarray for the evaluation of environmental functions
Kazunari Sei, Masaki Inaba, Rahul R. Upadhye, Daisuke Inoue, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 59 No. 1 p. 97-107 2009年1月 研究論文（学術雑誌）
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Microarray analysis of eubacterial community and bacterial pathogens in leachate from three different landfills of Japan
Rahul R. Upadhye, Daisuke Inoue, Tomonori Ishigaki, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Environmental Engineering Research Vol. 45 p. 195-202 2008年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society of Civil Engineers
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Biodegradation of bisphenol A, bisphenol F and bisphenol S in seawater
Erica Danzl, Kazunari Sei, Daisuke Inoue, Satoshi Soda, Michihiko Ike
Proceedings of IWA World Water Congress 2008, in CD-ROM Vol. 46 No. 3 p. 137-144 2008年9月 研究論文（国際会議プロシーディングス）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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Application of real-time polymerase chain reaction (PCR)coupled with ethidium monoazide treatment for selectivequantification of viable bacteria in aquatic environment
Daisuke Inoue, Hirofumi Tsutsui, Yuji Yamazaki, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Water Science and Technology Vol. 58 No. 5 p. 1107-1112 2008年9月 研究論文（学術雑誌）
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Transfer of antibiotic multiresistant plasmid RP4 from Escherichia coli to activated sludge bacteria
Satoshi Soda, Hidetaka Ohtsuki, Daisuke Inoue, Hirofumi Tsutsui, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 106 No. 3 p. 292-296 2008年9月 研究論文（学術雑誌）
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プラスミドオーグメンテーションによる廃水処理プロセスの性能向上の可能性
惣田訓, 筒井裕文, 井上大介, 清和成, 池道彦
月刊水 Vol. 50 No. 11 p. 14-21 2008年9月
出版者・発行元：月刊「水」発行所
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DNA microarray analysis of temporal and spatial variation of bacterial communities in Japanese rivers
Rahul R. Upadhye, Daisuke Inoue, Masaki Inaba, Kazunari Sei, Michihiko Ike
Japanese Journal of Water Treatment Biology Vol. 44 No. 2 p. 109-120 2008年6月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水処理生物学会
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Degradation of bis(4-hydroxyphenyl)methane (bisphenol F) by Sphingobium yanoikuyae FM-2 isolated from river water
Daisuke Inoue, Shoji Hara, Mari Kashihara, Yusaku Murai, Erica Danzl, Kazunari Sei, Shinji Tsunoi, Masanori Fujita, Michihiko Ike
Applied and Environmental Microbiology Vol. 74 No. 2 p. 352-358 2008年2月 研究論文（学術雑誌）
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プラスミド保持細菌の導入による土壌微生物群集の構造と機能の変化
井上大介, 筒井裕文, 山崎祐二, 村重勝士, 清和成, 惣田訓, 藤田正憲, 池道彦
環境工学研究論文集 Vol. 44 p. 613-623 2007年12月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Japan Society of Civil Engineers
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PRTR化学物質の各種核内受容体に対する結合性
井上大介, 松井久恵, 清和成, 楊敏, 胡建英, 荒金淳, 廣辻淳二, 西川淳一, 池道彦
水環境学会誌 Vol. 30 No. 2 p. 89-94 2007年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：日本水環境学会
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Distribution and characteristics of plasmid mobilizers in aquatic and soil environments and activated sludge
Daisuke Inoue, Katsushi Murashige, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike, Masanori Fujita
Journal of General and Applied Microbiology Vol. 53 No. 1 p. 67-70 2007年 研究論文（学術雑誌）
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Potential of predominant activated sludge bacteria as recipients in conjugative plasmid transfer
Daisuke Inoue, Kazunari Sei, Satoshi Soda, Michihiko Ike, Masanori Fujita
Journal of Bioscience and Bioengineering Vol. 100 No. 6 p. 600-605 2005年12月 研究論文（学術雑誌）
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Comparative evaluation of quantitative PCR methods for routine enumeration of specific bacterial DNA in aquatic samples
Daisuke Inoue, Katsushi Wada, Kazunari Sei, Michihiko Ike, Masanori Fujita
World Journal of Microbiology and Biotechnology Vol. 21 No. 6-7 p. 1029-1035 2005年10月 研究論文（学術雑誌）
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Monitoring behaviour of catabolic genes and change of microbial community structures in seawater microcosms during aromatic compound degradation
Kazunari Sei, Daisuke Inoue, Katsushi Wada, Kazuhiro Mori, Michihiko Ike, Tetsuro Kohno, Masanori Fujita
Water Research Vol. 38 No. 20 p. 4405-4414 2004年12月 研究論文（学術雑誌）
