受賞 1
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令和5年度 大阪大学賞
小澤 潔 大阪大学 2023年11月
令和5年度 大阪大学賞
小澤 潔 大阪大学 2023年11月
Cell-free protein synthesis for NMR structural analysis of large proteins and complexes
Kralicek, A. V, Ozawa, K
Application of NMR Spectroscopy Vol. 4 p. 263-290 2016年 研究論文(学術雑誌)
Preparation of multiple site-specific mutant proteins for NMR studies by PCR-directed cell-free protein synthesis
Kiyoshi Ozawa, Ruhu Qi
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Vol. 1118 p. 169-87 2014年 研究論文(学術雑誌)
Site-specific incorporation of unnatural amino acids into proteins by cell-free protein synthesis
Kiyoshi Ozawa, Choy Theng Loh
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Vol. 1118 p. 189-203 2014年 研究論文(学術雑誌)
A direct proofreader-clamp interaction stabilizes the Pol III replicase in the polymerization mode
Slobodan Jergic, Nicholas P Horan, Mohamed M Elshenawy, Claire E Mason, Thitima Urathamakul, Kiyoshi Ozawa, Andrew Robinson, Joris M H Goudsmits, Yao Wang, Xuefeng Pan, Jennifer L Beck, Antoine M van Oijen, Thomas Huber, Samir M Hamdan, Nicholas E Dixon
The EMBO journal Vol. 32 No. 9 p. 1322-33 2013年5月2日 研究論文(学術雑誌)
Proofreading exonuclease on a tether: the complex between the E-coli DNA polymerase III subunits alpha, epsilon, theta and beta reveals a highly flexible arrangement of the proofreading domain
Kiyoshi Ozawa, Nicholas P. Horan, Andrew Robinson, Hiromasa Yagi, Flynn R. Hill, Slobodan Jergic, Zhi-Qiang Xu, Karin V. Loscha, Nan Li, Moeava Tehei, Aaron J. Oakley, Gottfried Otting, Thomas Huber, Nicholas E. Dixon
NUCLEIC ACIDS RESEARCH Vol. 41 No. 10 p. 5354-5367 2013年5月 研究論文(学術雑誌)
Lanthanide Tags for Site-Specific Ligation to an Unnatural Amino Acid and Generation of Pseudocontact Shifts in Proteins
Choy Theng Loh, Kiyoshi Ozawa, Kellie L. Tuck, Nicholas Barlow, Thomas Huber, Gottfried Otting, Bim Graham
BIOCONJUGATE CHEMISTRY Vol. 24 No. 2 p. 260-268 2013年2月 研究論文(学術雑誌)
High-yield cell-free protein synthesis for site-specific incorporation of unnatural amino acids at two sites
Kiyoshi Ozawa, Karin V. Loscha, Kekini V. Kuppan, Choy Theng Loh, Nicholas E. Dixon, Gottfried Otting
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS Vol. 418 No. 4 p. 652-656 2012年2月 研究論文(学術雑誌)
Multiple-Site Labeling of Proteins with Unnatural Amino Acids
Karin V. Loscha, Anthony J. Herlt, Ruhu Qi, Thomas Huber, Kiyoshi Ozawa, Gottfried Otting
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION Vol. 51 No. 9 p. 2243-2246 2012年 研究論文(学術雑誌)
Binding of low molecular weight inhibitors promotes large conformational changes in the dengue virus NS2B-NS3 protease: fold analysis by pseudocontact shifts.
Laura de la Cruz, Thi Hoang Duong Nguyen, Kiyoshi Ozawa, James Shin, Bim Graham, Thomas Huber, Gottfried Otting
Journal of the American Chemical Society Vol. 133 No. 47 p. 19205-15 2011年11月30日 研究論文(学術雑誌)
Using a Genetically Encoded Fluorescent Amino Acid as a Site-Specific Probe to Detect Binding of Low-Molecular-Weight Compounds
Isaac N. Ugwumba, Kiyoshi Ozawa, Laura de la Cruz, Zhi-Qiang Xu, Anthony J. Herlt, Kieran S. Hadler, Chris Coppin, Susan E. Brown, Gerhard Schenk, John G. Oakeshott, Gottfried Otting
ASSAY AND DRUG DEVELOPMENT TECHNOLOGIES Vol. 9 No. 1 p. 50-57 2011年2月 研究論文(学術雑誌)
Improving a natural enzyme activity through incorporation of unnatural amino acids.
Isaac N Ugwumba, Kiyoshi Ozawa, Zhi-Qiang Xu, Fernanda Ely, Jee-Loon Foo, Anthony J Herlt, Chris Coppin, Sue Brown, Matthew C Taylor, David L Ollis, Lewis N Mander, Gerhard Schenk, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting, John G Oakeshott, Colin J Jackson
Journal of the American Chemical Society Vol. 133 No. 2 p. 326-33 2011年1月19日 研究論文(学術雑誌)
Advances in cell-free protein synthesis for NMR sample preparation
Kralicek, A.V, Ozawa, K
Biomolecular NMR Spectroscopy p. 3-19 2011年 研究論文(学術雑誌)
Incorporation of chlorinated analogues of aliphatic amino acids during cell-free protein synthesis
Dannon J. Stigers, Zachary I. Watts, James E. Hennessy, Hye-Kyung Kim, Romeo Martini, Matthew C. Taylor, Kiyoshi Ozawa, Jeffrey W. Keillor, Nicholas E. Dixon, Christopher J. Easton
CHEMICAL COMMUNICATIONS Vol. 47 No. 6 p. 1839-1841 2011年 研究論文(学術雑誌)
Generation of Pseudocontact Shifts in Protein NMR Spectra with a Genetically Encoded Cobalt(II)-Binding Amino Acid
Thi Hoang Duong Nguyen, Kiyoshi Ozawa, Mitchell Stanton-Cook, Russell Barrow, Thomas Huber, Gottfried Otting
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION Vol. 50 No. 3 p. 692-694 2011年 研究論文(学術雑誌)
A fluorescence quenching assay to discriminate between specific and nonspecific inhibitors of dengue virus protease.
Christophe Bodenreider, David Beer, Thomas H Keller, Sebastian Sonntag, Daying Wen, Lijian Yap, Yin Hoe Yau, Susana Geifman Shochat, Danzhi Huang, Ting Zhou, Amedeo Caflisch, Xun-Cheng Su, Kiyoshi Ozawa, Gottfried Otting, Subhash G Vasudevan, Julien Lescar, Siew Pheng Lim
Analytical biochemistry Vol. 395 No. 2 p. 195-204 2009年12月15日 研究論文(学術雑誌)
NMR analysis of the dynamic exchange of the NS2B cofactor between open and closed conformations of the West Nile virus NS2B-NS3 protease.
Xun-Cheng Su, Kiyoshi Ozawa, Ruhu Qi, Subhash G Vasudevan, Siew P Lim, Gottfried Otting
PLoS neglected tropical diseases Vol. 3 No. 12 2009年12月8日 研究論文(学術雑誌)
Cell-free synthesis and combinatorial selective N-15-labeling of the cytotoxic protein amoebapore A from Entamoeba histolytica
Yang Xun, Pierre Tremouilhac, Colm Carraher, Christoph Gelhaus, Kiyoshi Ozawa, Gottfried Ottingd, Nicholas E. Dixon, Matthias Leippe, Joachim Groetzinger, Andrew J. Dingley, Andrew V. Kralicek
PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION Vol. 68 No. 1 p. 22-27 2009年11月 研究論文(学術雑誌)
Flaviviral protease inhibitors identified by fragment-based library docking into a structure generated by molecular dynamics.
Dariusz Ekonomiuk, Xun-Cheng Su, Kiyoshi Ozawa, Christophe Bodenreider, Siew Pheng Lim, Gottfried Otting, Danzhi Huang, Amedeo Caflisch
Journal of medicinal chemistry Vol. 52 No. 15 p. 4860-8 2009年8月13日 研究論文(学術雑誌)
NMR study of complexes between low molecular mass inhibitors and the West Nile virus NS2B-NS3 protease
Xun-Cheng Su, Kiyoshi Ozawa, Hiromasa Yagi, Siew P. Lim, Daying Wen, Dariusz Ekonomiuk, Danzhi Huang, Thomas H. Keller, Sebastian Sonntag, Amedeo Caflisch, Subhash G. Vasudevan, Gottfried Otting
FEBS JOURNAL Vol. 276 No. 15 p. 4244-4255 2009年8月 研究論文(学術雑誌)
Glutarate and N-acetyl-l-glutamate buffers for cell-free synthesis of selectively N-15-labelled proteins
Xinying Jia, Kiyoshi Ozawa, Karin Loscha, Gottfried Otting
JOURNAL OF BIOMOLECULAR NMR Vol. 44 No. 2 p. 59-67 2009年6月 研究論文(学術雑誌)
Discovery of a non-peptidic inhibitor of west nile virus NS3 protease by high-throughput docking.
Dariusz Ekonomiuk, Xun-Cheng Su, Kiyoshi Ozawa, Christophe Bodenreider, Siew Pheng Lim, Zheng Yin, Thomas H Keller, David Beer, Viral Patel, Gottfried Otting, Amedeo Caflisch, Danzhi Huang
PLoS neglected tropical diseases Vol. 3 No. 1 2009年 研究論文(学術雑誌)
Strategic roles of axial histidines in structure formation and redox regulation of tetraheme cytochrome c3.
Yuki Takayama, Nicolas D Werbeck, Hirofumi Komori, Kumiko Morita, Kiyoshi Ozawa, Yoshiki Higuchi, Hideo Akutsu
Biochemistry Vol. 47 No. 36 p. 9405-15 2008年9月9日 研究論文(学術雑誌)
The proofreading exonuclease subunit of Escherichia coli DNA polymerase III is tethered to the polymerase subunit via a flexible linker
Kiyoshi Ozawa, Slobodan Jergic, Ah Young Park, Nicholas E. Dixon, Gottfried Otting
NUCLEIC ACIDS RESEARCH Vol. 36 No. 15 p. 5074-5082 2008年9月 研究論文(学術雑誌)
Cell-free protein synthesis for analysis by NMR spectroscopy.
Margit A Apponyi, Kiyoshi Ozawa, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Vol. 426 p. 257-68 2008年 研究論文(学術雑誌)
Measurement of dissociation constants of high-molecular weight protein-protein complexes by transferred 15N-relaxation.
Xun-Cheng Su, Slobodan Jergic, Kiyoshi Ozawa, Nicolas Dale Burns, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting
Journal of biomolecular NMR Vol. 38 No. 1 p. 65-72 2007年5月 研究論文(学術雑誌)
The unstructured C-terminus of the tau subunit of Escherichia coli DNA polymerase III holoenzyme is the site of interaction with the alpha subunit.
Slobodan Jergic, Kiyoshi Ozawa, Neal K Williams, Xun-Cheng Su, Daniel D Scott, Samir M Hamdan, Jeffrey A Crowther, Gottfried Otting, Nicholas E Dixon
Nucleic acids research Vol. 35 No. 9 p. 2813-24 2007年 研究論文(学術雑誌)
Cell-free transcription/translation from PCR-amplified DNA for high-throughput NMR studies
Peter S. C. Wu, Kiyoshi Ozawa, Siew P. Lim, Subhash G. Vasudevan, Nicholas E. Dixon, Gottfried Otting
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION Vol. 46 No. 18 p. 3356-3358 2007年 研究論文(学術雑誌)
N-15-Labelled proteins by cell-free protein synthesis - Strategies for high-throughput NMR studies of proteins and protein-ligand complexes
Kiyoshi Ozawa, Peter S. C. Wu, Nicholas E. Dixon, Gottfried Otting
FEBS JOURNAL Vol. 273 No. 18 p. 4154-4159 2006年9月 研究論文(学術雑誌)
Redox interaction of cytochrome c3 with [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F.
Naoki Yahata, Takashi Saitoh, Yuki Takayama, Kiyoshi Ozawa, Hideaki Ogata, Yoshiki Higuchi, Hideo Akutsu
Biochemistry Vol. 45 No. 6 p. 1653-62 2006年2月14日 研究論文(学術雑誌)
Amino-acid type identification in 15N-HSQC spectra by combinatorial selective 15N-labelling.
Peter S C Wu, Kiyoshi Ozawa, Slobodan Jergic, Xun-Cheng Su, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting
Journal of biomolecular NMR Vol. 34 No. 1 p. 13-21 2006年1月 研究論文(学術雑誌)
Roles of charged residues in pH-dependent redox properties of cytochrome c3 from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F.
Naoki Yahata, Kiyoshi Ozawa, Yusuke Tomimoto, Kumiko Morita, Hirofumi Komori, Hideaki Ogata, Yoshiki Higuchi, Hideo Akutsu
Biophysics (Nagoya-shi, Japan) Vol. 2 p. 45-56 2006年 研究論文(学術雑誌)
Cell-free synthesis of 15N-labeled proteins for NMR studies.
Kiyoshi Ozawa, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting
IUBMB life Vol. 57 No. 9 p. 615-22 2005年9月 研究論文(学術雑誌)
Cell-free protein synthesis in an autoinduction system for NMR studies of protein-protein interactions.
Kiyoshi Ozawa, Slobodan Jergic, Jeffrey A Crowther, Phillip R Thompson, Gene Wijffels, Gottfried Otting, Nicholas A Dixon
Journal of biomolecular NMR Vol. 32 No. 3 p. 235-41 2005年7月 研究論文(学術雑誌)
Translational incorporation of L-3,4-dihydroxyphenylalanine into proteins.
Kiyoshi Ozawa, Madeleine J Headlam, Dmitri Mouradov, Stephen J Watt, Jennifer L Beck, Kenneth J Rodgers, Roger T Dean, Thomas Huber, Gottfried Otting, Nicholas E Dixon
The FEBS journal Vol. 272 No. 12 p. 3162-71 2005年6月 研究論文(学術雑誌)
Optimization of an Escherichia coli system for cell-free synthesis of selectively N-labelled proteins for rapid analysis by NMR spectroscopy.
Kiyoshi Ozawa, Madeleine J Headlam, Patrick M Schaeffer, Blair R Henderson, Nicholas E Dixon, Gottfried Otting
European journal of biochemistry Vol. 271 No. 20 p. 4084-93 2004年10月 研究論文(学術雑誌)
Roles of noncoordinated aromatic residues in redox regulation of cytochrome c3 from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F.
Yuki Takayama, Erisa Harada, Rie Kobayashi, Kiyoshi Ozawa, Hideo Akutsu
Biochemistry Vol. 43 No. 34 p. 10859-66 2004年8月31日 研究論文(学術雑誌)
2P085 顕微分光で観測した高分子量チトクロム分子のX線照射による還元反応(ヘム蛋白質)
佐藤 翠, 森本 幸生, 柴田 直樹, 小森 博文, 高山 裕生, 小澤 潔, 阿久津 秀雄, 樋口 芳樹
生物物理 Vol. 44 2004年
出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会X-ray induced reduction of the crystal of high-molecular-weight cytochrome c revealed by microspectrophotometry.
Midori Sato, Naoki Shibata, Yukio Morimoto, Yuki Takayama, Kiyoshi Ozawa, Hideo Akutsu, Yoshiki Higuchi, Noritake Yasuoka
Journal of synchrotron radiation Vol. 11 No. Pt 1 p. 113-6 2004年1月1日 研究論文(学術雑誌)
Role of the aromatic ring of Tyr43 in tetraheme cytochrome c(3) from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F.
Kiyoshi Ozawa, Yuki Takayama, Fumiko Yasukawa, Tomoaki Ohmura, Michael A Cusanovich, Yusuke Tomimoto, Hideaki Ogata, Yoshiki Higuchi, Hideo Akutsu
Biophysical journal Vol. 85 No. 5 p. 3367-74 2003年11月 研究論文(学術雑誌)
A directional electron transfer regulator based on heme-chain architecture in the small tetraheme cytochrome c from Shewanella oneidensis.
Erisa Harada, Jiro Kumagai, Kiyoshi Ozawa, Shinichiro Imabayashi, Alexandre S Tsapin, Kenneth H Nealson, Terrance E Meyer, Michael A Cusanovich, Hideo Akutsu
FEBS letters Vol. 532 No. 3 p. 333-7 2002年12月18日 研究論文(学術雑誌)
NMR analysis of in vitro-synthesized proteins without purification: a high-throughput approach.
Laurent Guignard, Kiyoshi Ozawa, Sharon E Pursglove, Gottfried Otting, Nicholas E Dixon
FEBS letters Vol. 524 No. 1-3 p. 159-62 2002年7月31日 研究論文(学術雑誌)
A Simple, Rapid, and Highly Efficient Gene Expression System for Multiheme Cytochromes c
Ozawa Kiyoshi, Yasukawa Fumiko, Fujiwara Yumiko, AKUTSU Hideo
Bioscience, biotechnology, and biochemistry Vol. 65 No. 1 p. 185-189 2001年 研究論文(学術雑誌)
出版者・発行元:社団法人日本農芸化学会Purification and Characterization of Homo- and Hetero-Dimeric Acetate Kinases from the Sulfate-Reducing Bacterium Desulfovibrio vulgaris.
Yu Ling, Ishida Tetsuo, Ozawa Kiyoshi, Akutsu Hideo, Horiike Kihachiro
The Journal of Biochemistry Vol. 129 No. 3 p. 411-422 2001年 研究論文(学術雑誌)
出版者・発行元:The Japanese Biochemical SocietyFunctions and ATP-Binding Responses of the Twelve Histidine Residues in the TF1-ATPase .BETA. Subunit.
Tozawa Kaeko, Yagi Hiromasa, Hisamatsu Kumiko, Ozawa Kiyoshi, Yoshida Masasuke, Akutsu Hideo
The Journal of Biochemistry Vol. 130 No. 4 p. 527-533 2001年 研究論文(学術雑誌)
出版者・発行元:The Japanese Biochemical Society1D1500 F_1-ATPaseβサブユニット構造変化のメカニズム
八木 宏昌, 岩淵 友幸, 小澤 潔, 吉田 賢右, 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 40 2000年
出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会1F1615 硫酸還元菌Y43Lチトクロムc_3のキャラクタリゼーション
小澤 潔, 熊谷 次郎, 安川 文美子, Cusanovich MA, 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 40 2000年
出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会Evidence for the presence of F-type ATP synthase involved in sulfate-respiration in Desulfovibrio vulgaris.
Ozawa, K, Meikari, T, Motohashi, K, Yoshida, M, Akutsu, H
J. Bacteriol. Vol. 182 p. 2200-2206 2000年 研究論文(学術雑誌)
Expression of a tetraheme protein, Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F cytochrome c3, in Shewanella oneidensis MR-1.
Ozawa, K, Tsapin, A. I, Nealson, K. H, Cusanovich, M. A, Akutsu, H
Appl. Environ. Microbiol. Vol. 66 p. 4168-4171 2000年 研究論文(学術雑誌)
Functional conformation changes in the TF<inf>1</inf>-ATPase β subunit probed by 12 tyrosine residues
Yagi H, Tozawa K, Sekino N, Iwabuchi T, Yoshida M, Akutsu H
Biophysical Journal Vol. 77 No. 4 p. 2175-2183 1999年10月 研究論文(学術雑誌)
2PA086 Shewanellaチトクロムc_3の酸化還元電位と軸配位子
海津 肇子, 熊谷 次郎, 原田 英里砂, 小澤 潔, 今林 慎一郎, Tsapin A., Nealson K. H., 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 39 1999年
出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会2PA084 S. putrefaciens cytochrome c_3の巨視的酸化還元電位の解析
熊谷 次郎, 海津 肇子, 小澤 潔, 今林 慎一郎, Tsapin A.I., Nealson K.H., 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 39 1999年
出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会A primitive pathway of porphyrin biosynthesis and enzymology in Desulfovibrio vulgaris.
Ishida, T, Yu, L, Akutsu, H, Ozawa, K, Kawanishi, S, Seto, A, Inubushi, T, Sano, S
Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol. 95 p. 4853-4858 1998年 研究論文(学術雑誌)
Cloning and expression of the gene encoding flavodoxin from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F).
Kitamura, M, Sagara, T, Taniguchi, M, Ashida, M, Ezoe, K, Kohno, K, Kojima, S, Ozawa, K, Akutsu, H, Kumagai, I, Nakaya, T
J. Biochem. Vol. 123 p. 891-898 1998年 研究論文(学術雑誌)
Membrane-bound cytochromes in a sulfate-reducing strict anaerobe Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F.
Ozawa, K, Mogi, T, Suzuki, M, Kitamura, M, Nakaya, T, Anraku, Y, Akutsu, H
Anaerobe Vol. 3 p. 339-346 1997年 研究論文(学術雑誌)
Anaerobic porphyrin biosynthesis.
Akutsu, H, Ozawa, K, Sano, S
J. Syn. Org. Chem. JAPAN Vol. 54 No. 3 p. 176-187 1996年 研究論文(学術雑誌)
Substrate Specificity of tRNA (Adenine-1-)-methyltransferase from Thermus thermophilus HB27
Yamazaki Norihiko, Hori Hiroyuki, Ozawa Kiyoshi, Nakanishi Shigeko, Ueda Takuya, Kumagai Izumi, Watanabe Kimitsuna, Nishikawa Kazuya
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry Vol. 58 No. 6 p. 1128-1133 1994年 研究論文(学術雑誌)
出版者・発行元:社団法人日本農芸化学会The primary structure of pre-cytochrome C3 from Desulfovibrio vulgaris (Miyazaki F) as determined by nucleotide sequencing of its gene and partial amino acid sequencing.
Kitamura, M, Ozawa, K, Kojima, S, Kumagai, I, Akutsu, H, Miura, K
Protein Seq. Data Anal. Vol. 5 p. 193-196 1993年 研究論文(学術雑誌)
2P087 硫酸還元菌シトクロムc_3と[NiFe]ヒドロゲナーゼとの相互作用の解析(ヘム蛋白質)
八幡 直樹, 高山 裕生, 斉藤 貴士, 小澤 潔, 中原 明香, 緒方 英明, 樋口 芳樹, 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 44 No. 1 2004年11月10日
出版者・発行元:日本生物物理学会Shewanella putrefaciensにおけるチトクロムC_3発現プラスミドの検討
藤原 由美子, 小澤 潔, TSAPIN A. I., NEALSON K. H., CUSANOVICH M. A., 阿久津 秀雄
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 Vol. 21 p. 327-327 1998年12月1日
ShewanellaチトクロムC_3の酸化還元挙動
海津 肇子, 原田 英里砂, 小澤 潔, Tsapin A.I., Nealson K.H., 阿久津 秀雄
生物物理 Vol. 37 1997年10月
出版者・発行元:一般社団法人日本生物物理学会