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Fluorescence Microscopy and Immunoblotting for Mitophagy in Budding Yeast
Yuki Nakayama, Koji Okamoto
Methods in Molecular Biology No. 2845 p. 1-14 2024年8月9日 論文集(書籍)内論文
出版者・発行元：
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The nascent polypeptide-associated complex subunit Egd1 is required for efficient selective mitochondrial degradation in budding yeast
Yuan Tian, Koji Okamoto
Scientific Reports Vol. 14 No. 1 2024年1月4日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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A ubiquitin-proteasome pathway degrades the inner nuclear membrane protein Bqt4 to maintain nuclear membrane homeostasis
Toan Khanh Le, Yasuhiro Hirano, Haruhiko Asakawa, Koji Okamoto, Tatsuo Fukagawa, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
Journal of Cell Science Vol. jcs.260930 2023年9月11日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：The Company of Biologists
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The GET pathway serves to activate Atg32-mediated mitophagy by ER targeting of the Ppg1-Far complex
Mashun Onishi, Mitsutaka Kubota, Lan Duan, Yuan Tian, Koji Okamoto
Vol. 6 No. 4 p. e202201640-e202201640 2023年1月25日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：
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An overview of the molecular mechanisms of mitophagy in yeast
Schuster R, Okamoto K
Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 2022年11月 研究論文（学術雑誌）
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The protein N-terminal acetyltransferase A complex contributes to yeast mitophagy via promoting expression and phosphorylation of Atg32.
Kubota M, Okamoto K
J Biochem. Vol. 170 No. 2 p. 175-182 2021年10月
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The GET pathway serves to activate Atg32-mediated mitophagy by ER targeting of the Ppg1-Far complex
Mashun Onishi, Koji Okamoto
2021年9月21日
出版者・発行元：Cold Spring Harbor Laboratory
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Mitochondrial dynamics and degradation in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi
Lan Duan, Koji Okamoto
Genes to Cells Vol. 26 No. 8 p. 627-635 2021年8月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Wiley
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Regulatory mechanisms of mitophagy in yeast
Yang Liu, Koji Okamoto
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Vol. 1865 No. 5 p. 129858-129858 2021年5月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier BV
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Mitochondrial clearance: mechanisms and roles in cellular fitness.
Onishi M, Okamoto K
FEBS Lett. Vol. 595 No. 8 p. 1239-1263 2021年4月 研究論文（学術雑誌）
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Molecular mechanisms and physiological functions of mitophagy
Mashun Onishi, Koji Yamano, Miyuki Sato, Noriyuki Matsuda, Koji Okamoto
The EMBO Journal Vol. 40 No. 3 2021年2月 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：EMBO
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Selective autophagy of intracellular organelles: Recent research advances
Wen Li, Pengcheng He, Yuge Huang, Yi-Fang Li, Jiahong Lu, Min Li, Hiroshi Kurihara, Zhuo Luo, Tian Meng, Mashun Onishi, Changle Ma, Lei Jiang, Yongquan Hu, Qing Gong, Dongxing Zhu, Yiming Xu, Rong Liu, Lei Liu, Cong Yi, Yushan Zhu, Ningfang Ma, Koji Okamoto, Zhiping Xie, Jinbao Liu, Rong-Rong He, Du Feng
Theranostics Vol. 11 No. 1 p. 222-256 2021年 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Ivyspring International Publisher
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Detection of mitophagy in mammalian cells, mice, and yeast.
Calvelli Hannah, Krigman Judith, Onishi Mashun, Narendra Derek P, Sun Nuo, Okamoto Koji
Methods in Cell Biology Vol. 155 p. 557-579 2020年 研究論文（学術雑誌）
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Repression of mitochondrial metabolism for cytosolic pyruvate-derived chemical production in Saccharomyces cerevisiae.
Morita Keisuke, Matsuda Fumio, Okamoto Koji, Ishii Jun, Kondo Akihiko, Shimizu Hiroshi
Microbial Cell Factories Vol. 18 No. 1 p. 177-177 2019年10月15日
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The Paf1 complex transcriptionally regulates the mitochondrial-anchored protein Atg32 leading to activation of mitophagy.
Zheng Liangde, Shu Wen-Jie, Li Yu-Min, Mari Muriel, Yan Chaojun, Wang Dehe, Yin Zhao-Hong, Jiang Wei, Zhou Yu, Okamoto Koji, Reggiori Fulvio, Klionsky Daniel J, Song Zhiyin, Du Hai-Ning
Autophagy p. 1-14 2019年9月19日
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A Mammalian Mitophagy Receptor, Bcl2-L-13, Recruits the ULK1 Complex to Induce Mitophagy.
Murakawa Tomokazu, Okamoto Koji, Omiya Shigemiki, Taneike Manabu, Yamaguchi Osamu, Otsu Kinya
Cell Reports Vol. 26 No. 2 p. 338-345 2019年1月 研究論文（学術雑誌）
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Mitochondrial stasis reveals p62-mediated ubiquitination in Parkin-independent mitophagy.
Yamada Tatsuya, Murata Daisuke, Adachi Yoshihiro, Itoh Kie, Kameoka Shoichiro, Igarashi Atsushi, Kato Takashi, Araki Yoichi, Huganir Richard L, Dawson Ted M, Yanagawa Toru, Okamoto Koji, Iijima Mlho, Sesaki Hiromi
Cell Metabolism Vol. 28 No. 4 p. 588-604 2018年10月 研究論文（学術雑誌）
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The TORC1 signaling pathway regulates respiration-induced mitophagy in yeast
Yang Liu, Koji Okamoto
Biochemical and Biophysical Research Communications Vol. 502 No. 1 p. 76-83 2018年7月7日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier B.V.
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The Nem1-Spo7 protein phosphatase complex is required for efficient mitophagy in yeast
Xueyan Xu, Koji Okamoto
Biochemical and Biophysical Research Communications Vol. 496 No. 1 p. 51-57 2018年1月29日 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier B.V.
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The ER membrane insertase Get1/2 is required for efficient mitophagy in yeast
Mashun Onishi, Sachiyo Nagumo, Shohei Iwashita, Koji Okamoto
Biochemical and Biophysical Research Communications Vol. 503 No. 1 p. 14-20 2018年 研究論文（学術雑誌）
出版者・発行元：Elsevier B.V.
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Investigation of Yeast Mitophagy with Fluorescence Microscopy and Western Blotting.
Nagumo Sachiyo, Okamoto Koji
Methods in Molecular Biology Vol. 1759 2017年3月 研究論文（学術雑誌）
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Assays for mitophagy in yeast
Akinori Eiyama, Koji Okamoto
Methods in Molecular Biology Vol. 1567 p. 337-347 2017年 論文集(書籍)内論文
出版者・発行元：Humana Press Inc.
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Phospholipid methylation controls Atg32-mediated mitophagy and Atg8 recycling
EMBO Journal Vol. 34 No. 21 p. 2703-2719 2015年11月 研究論文（学術雑誌）
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Protein N-terminal Acetylation by the NatA Complex Is Critical for Selective Mitochondrial Degradation
Journal of Biological Chemistry Vol. 290 No. 41 p. 25034-25044 2015年10月 研究論文（学術雑誌）
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Bcl-2-like protein 13 is a mammalian Atg32 homologue that mediates mitophagy and mitochondrial fragmentation.
Tomokazu Murakawa, Osamu Yamaguchi, Ayako Hashimoto, Shungo Hikoso, Toshihiro Takeda, Takafumi Oka, Hiroki Yasui, Hiromichi Ueda, Yasuhiro Akazawa, Hiroyuki Nakayama, Manabu Taneike, Tomofumi Misaka, Shigemiki Omiya, Ajay M Shah, Akitsugu Yamamoto, Kazuhiko Nishida, Yoshinori Ohsumi, Koji Okamoto, Yasushi Sakata, Kinya Otsu
Nature communications Vol. 6 p. 7527-7527 2015年7月6日 研究論文（学術雑誌）
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Enhancement of Ethanol Fermentation in Saccharomyces cerevisiae Sake Yeast by Disrupting Mitophagy Function
Applied and Environmental Microbiology Vol. 80 No. 3 p. 1002-1012 2014年2月 研究論文（学術雑誌）
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2SAA-04 オートファジーが駆動するミトコンドリア分解の仕組み(2SAA 膜動態から探るミトコンドリア・ネオバイオロジー,シンポジウム,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))
岡本 浩二
生物物理 Vol. 54 No. 1 2014年
出版者・発行元：一般社団法人 日本生物物理学会
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Mitochondrial degradation during starvation is selective and temporally distinct from bulk autophagy in yeast
Akinori Eiyama, Noriko Kondo-Okamoto, Koji Okamoto
FEBS Letters Vol. 587 No. 12 p. 1787-1792 2013年6月19日 研究論文（学術雑誌）
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Autophagy-related Protein 32 Acts as Autophagic Degron and Directly Initiates Mitophagy
Journal of Biological Chemistry Vol. 287 No. 13 p. 10631-10638 2012年3月 研究論文（学術雑誌）
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Structure-Function Analysis of the Yeast Mitochondrial Rho GTPase, Gem1p
Journal of Biological Chemistry Vol. 286 No. 1 p. 354-362 2011年1月 研究論文（学術雑誌）
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Mitochondria-Anchored Receptor Atg32 Mediates Degradation of Mitochondria via Selective Autophagy
Developmental Cell Vol. 17 No. 1 p. 87-97 2009年7月 研究論文（学術雑誌）
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Multiple pathways influence mitochondrial inheritance in budding yeast
Frederick Rebecca L, Okamoto Koji, Shaw Janet M
Genetics Vol. 178 No. 2 p. 825-837 2008年2月 研究論文（学術雑誌）
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2P-043 ミトコンドリアGTPase蛋白質Gem1pの生化学的解析(蛋白質・構造機能相関(2),第46回日本生物物理学会年会)
Yasukawa Kai, Kubara Kenji, Kawabata Shun-ichiro, Okamoto Koji, Koshiba Takumi
生物物理 Vol. 48 2008年
出版者・発行元：一般社団法人 日本生物物理学会
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Tetratricopeptide repeat proteins Tom70 and Tom71 mediate yeast mitochondrial morphogenesis
Kondo-Okamoto Noriko, Shaw Janet M, Okamoto Koji
EMBO Reports Vol. 9 No. 1 p. 63-69 2008年1月 研究論文（学術雑誌）
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The novel F-box protein Mfb1p regulates mitochondrial connectivity and exhibits asymmetric localization in yeast.
Kondo-Okamoto Noriko, Ohkuni Kentaro, Kitagawa Katsumi, McCaffery J.Micahel, Shaw Janet M, Okamoto Koji
Molecular Biology of the Cell Vol. 17 No. 9 p. 3757-3767 2006年6月 研究論文（学術雑誌）
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Up-to-dating of complete sequenced DNA data of Hansenula wingei yeast mitochondria.
Sekito Takayuki, Okamoto Koji, Kitano Hiromichi, Yoshida Kazuo
Nucleic Acids Symposium Series Vol. 48 p. 179-180 2004年11月 研究論文（学術雑誌）
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Yeast Miro GTPase, Gem1p, regulates mitochondrial morphology via a novel pathway
Frederick Rebecca L, McCaffery John Michael, Cunningham Kyle W, Okamoto Koji, Shaw Janet M
Journal of Cell Biology Vol. 167 No. 1 p. 87-98 2004年10月 研究論文（学術雑誌）
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Levels of human Fis1 at the mitochondrial outer membrane regulate mitochondrial morphology
Ryan Stojanovski Diana, Koutsopoulos Olga S, Okamoto Koji, Ryan Michael T
Journal of Cell Science Vol. 117 No. 7 p. 1201-1210 2004年3月 研究論文（学術雑誌）
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Mmm1p spans both the outer and inner mitochondrial membranes and contains distinct domains for targeting and foci formation
Kondo-Okamoto Noriko, Shaw Janet M, Okamoto Koji
Journal of Biological Chemistry Vol. 278 No. 49 p. 48997-49005 2003年12月 研究論文（学術雑誌）
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The protein import motor of mitochondria: a targeted molecular ratchet driving unfolding and translocation
Okamoto Koji, Brinker Achim, Paschen Stefan A, Moarefi Ismail, Hayer-Hartl Manajit, Neupert Walter, Brunner Michael
EMBO Journal Vol. 21 No. 14 p. 3659-3671 2002年7月 研究論文（学術雑誌）
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Mitochondrial protein import: Molecular basis of the ATP-dependent interaction of MtHsp70 with Tim44
Moro Fernando, Okamoto Koji, Donzeau Mariel, Neupert Walter, Brunner Michael
Journal of Biological Chemistry Vol. 277 No. 9 p. 6874-6880 2002年3月 研究論文（学術雑誌）
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Replication and preferential inheritance of hypersuppressive petite mitochondrial DNA
MacAlpine David M, Kolesar Jill, Okamoto Koji, Butow Ronald A, Perlman Philip S
EMBO Journal Vol. 20 No. 7 p. 1807-1817 2001年4月 研究論文（学術雑誌）
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The sorting of mitochondrial DNA and mitochondrial proteins in zygotes: Preferential transmission of mitochondrial DNA to the medial bud
Okamoto Koji, Perlman Philip S, Butow Ronald A
Journal of Cell Biology Vol. 142 No. 3 p. 613-623 1998年8月 研究論文（学術雑誌）
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Functions of the high mobility group protein, Abf2p, in mitochondrial DNA segregation, recombination and copy number in Saccharomyces cerevisiae
Zelenaya-Troitskaya Olga, Newman Scott M, Okamoto Koji, Perlman Philip S, Butow Ronald A
Genetics Vol. 148 No. 4 p. 1763-1776 1998年4月 研究論文（学術雑誌）
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The secondary structure and phylogenetic relationship deduced from complete nucleotide sequence of mitochondrial small subunit rRNA in yeast Hansenula wingei
Okamoto Koji, Sekito Takayuki, Yoshida Kazuo
Genes & Genetic Systems Vol. 71 No. 2 p. 69-74 1996年4月 研究論文（学術雑誌）
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ミトコンドリアの起源進化(1) 酵母ミトコンドリアゲノムの進化
北野 広道, 関藤 孝之, 岡本 浩二, 石富 仁志, 吉田 和夫
Viva origino Vol. 24 No. 1 p. 92-93 1996年3月13日
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Is the evolution of mitochondrial genes independent from that of the corresponding nuclear genes in fungi? Construction of molecular phylogenetic trees based on mitochondrial small rRNA.
Yoshida Kazuo, Okamoto Koji, Sekito Takayuki
Nucleic Acids Symposium Series Vol. 35 p. 275-276 1996年 研究論文（学術雑誌）
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Clone Bank of the Mitochondrial Genome of Yeast Hansenula Wingei
Sekito Takayuki, Okamoto Koji, Kitano Hiromichi, Yoshida Kazuo
Yeast Vol. 11 No. 13 p. 1317-1321 1995年10月 研究論文（学術雑誌）
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The Complete Mitochondrial DNA Sequence of Hansenula Wingei Reveals New Characteristics of Yeast Mitochondria
Sekito Takayuki, Okamoto Koji, Kitano Hiromichi, Yoshida Kazuo
Current Genetics Vol. 28 No. 1 p. 39-53 1995年6月 研究論文（学術雑誌）
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The Mitochondrial Genome of Yeast Hansenula Wingei Encodes NADH Dehydrogenase Subunit Genes ND4L and ND5
Okamoto Koji, Sekito Takayuki, Yoshida Kazuo
Molecular Genetics and Genomics Vol. 243 No. 4 p. 473-476 1994年5月 研究論文（学術雑誌）
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Yeast Hansenula wingei mitochondrial genome's complete DNA sequence demonstrated unique characteristics.
Sekito Takayuki, Okamoto Koji, Kitano Hiromichi, Yoshida Kazuo
Nucleic Acids Symposium Series Vol. 31 p. 233-234 1994年 研究論文（学術雑誌）
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Nucleotide Sequences and Secondary Structures of Four tRNA Genes in Mitochondrial DNA of Hansenula Wingei Yeast
Sekito Takayuki, Okamoto Koji, Suzuki Katsunori, Yoshida Kazuo
Nucleic Acids Symposium Series Vol. 21 No. 15 p. 3589-3589 1993年7月 研究論文（学術雑誌）
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Nucleotide sequences of ten mitochondrial tRNA genes in yeast Hansenula wingei
Okamoto Koji, Suzuki Katsunori, Yoshida Kazuo
Nucleic Acids Research Vol. 20 No. 9 p. 2373-2373 1992年5月 研究論文（学術雑誌）
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Physical mapping and RFLP analysis of mtDNAs from the ascosporogenous yeasts: Saccharomyces exiguus, S. kluyveri and Hansenula wingei
Kozi Okamoto, Katsunori Suzuki, Kazuo Yoshida
The Japanese Journal of Genetics Vol. 66 No. 6 p. 709-718 1991年 研究論文（学術雑誌）
