Evaluating the effect of two-dimensional molecular layout on DNA origami-based transporters

Kodai Fukumoto, Yuya Miyazono, Takuya Ueda, Yoshie Harada, Hisashi Tadakuma

Nanoscale Advances　Vol. 5　No. 9　p. 2590-2601　2023年4月19日　研究論文（学術雑誌）

Highly Dispersed 3C Silicon Carbide Nanoparticles with a Polydopamine/Polyglycerol Shell for Versatile Functionalization

Shingo Sotoma, Hiroshi Abe, Yohei Miyanoiri, Takeshi Ohshima, Yoshie Harada

ACS Applied Materials & Interfaces　Vol. 15　p. 21413-21424　2023年4月18日　研究論文（学術雑誌）

Nanaomycin E inhibits NLRP3 inflammasome activation by preventing mitochondrial dysfunction

Yudai Matsui, Naoki Takemura, Yoshitaka Shirasaki, Michihiro Takahama, Yoshihiko Noguchi, Kenta Ikoma, Yixi Pan, Shuhei Nishida, Manabu Taura, Akiyoshi Nakayama, Takashi Funatsu, Takuma Misawa, Yoshie Harada, Toshiaki Sunazuka, Tatsuya Saitoh

International Immunology　Vol. 34　No. 10　p. 505-518　2022年9月9日　研究論文（学術雑誌）

Heat-hypersensitive mutants of ryanodine receptor type 1 revealed by microscopic heating

Kotaro Oyama, Vadim Zeeb, Toshiko Yamazawa, Nagomi Kurebayashi, Fuyu Kobirumaki-Shimozawa, Takashi Murayama, Hideto Oyamada, Satoru Noguchi, Takayoshi Inoue, Yukiko U. Inoue, Ichizo Nishino, Yoshie Harada, Norio Fukuda, Shin’ichi Ishiwata, Madoka Suzuki

Proceedings of the National Academy of Sciences　Vol. 119　No. 32　2022年8月9日　研究論文（学術雑誌）

Modulation of Local Cellular Activities using a Photothermal Dye-Based Subcellular-Sized Heat Spot

Ferdinandus, Madoka Suzuki, Cong Quang Vu, Yoshie Harada, Satya Ranjan Sarker, Shin ichi Ishiwata, Tetsuya Kitaguchi, Satoshi Arai

ACS Nano　Vol. 16　No. 6　p. 9004-9018　2022年6月8日　研究論文（学術雑誌）

Cell-autonomous control of intracellular temperature by unsaturation of phospholipid acyl chains

Akira Murakami, Kohjiro Nagao, Reiko Sakaguchi, Keisuke Kida, Yuji Hara, Yasuo Mori, Kohki Okabe, Yoshie Harada, Masato Umeda

Cell Reports　Vol. 38　No. 11　p. 110487-110487　2022年3月　研究論文（学術雑誌）

Quantum nanodiamonds for sensing of biological quantities: Angle, temperature, and thermal conductivity

Shingo Sotoma, Hirotaka Okita, Shunsuke Chuma, Yoshie Harada

Biophysics and Physicobiology　Vol. 19　p. n/a-n/a　2022年

Photothermal Dye-based Subcellular-sized Heat Spot Enabling the Modulation of Local Cellular Activities

Ferdinandus Ferdinandus, Madoka Suzuki, Yoshie Harada, Satya Ranjan Sarker, Shin ichi Ishiwata, Tetsuya Kitaguchi, Satoshi Arai

bioRxiv　2021年12月21日

Pressure-induced changes on the morphology and gene expression in mammalian cells

Kazuko Okamoto, Tomonobu M. Watanabe, Masanobu Horie, Masayoshi Nishiyama, Yoshie Harada, Hideaki Fujita

Biology Open　Vol. 10　No. 7　2021年7月15日　研究論文（学術雑誌）

細胞の熱伝導率を定量する―量子センサーによるナノバイオセンシング

外間進悟, 鈴木団, 原田慶恵

化学　Vol. 76　No. 5　p. 32-36　2021年5月

Composite Quantum Sensors Based on Fluorescent Nanodiamonds for Intracellular Controlled Heating in Living Cells

Shingo Sotoma, Yoshie Harada

ACS Applied Nano Materials　Vol. 4　No. 4　p. 3969-3976　2021年4月23日　研究論文（学術雑誌）

In situ measurements of intracellular thermal conductivity using heater-thermometer hybrid diamond nanosensors

Shingo Sotoma, Chongxia Zhong, James Chen Yong Kah, Hayato Yamashita, Taras Plakhotnik, Yoshie Harada, Madoka Suzuki

Science Advances　Vol. 7　No. 3　p. eabd7888-eabd7888　2021年1月　研究論文（学術雑誌）

Viral RNA recognition by LGP2 and MDA5, and activation of signaling through step-by-step conformational changes

Ivana Duic, Hisashi Tadakuma, Yoshie Harada, Ryo Yamaue, Deguchi Katashi, Yuki Suzuki, Shige Yoshimura, Hiroki Kato, Kunio Takeyasu, Takashi Fujita

Nucleic acids research　Vol. 48　No. 20　p. 11664-11674　2020年11月　研究論文（学術雑誌）

Heat hypersensitivity of ryanodine receptor type 1 mutants implicated in malignant hyperthermia

Kotaro Oyama, Vadim Zeeb, Toshiko Yamazawa, Takashi Murayama, Hideto Oyamada, Yoshie Harada, Norio Fukuda, Shin’ichi Ishiwata, Madoka Suzuki

bioRxiv　2020年10月29日　研究論文（学術雑誌）

量子センサーを用いた生細胞観察

外間進悟, 原田慶恵

光学　Vol. 49　No. 8　p. 311-316　2020年8月　研究論文（学術雑誌）

In situ measurement of intracellular thermal conductivity using heater-thermometer hybrid diamond nanosensor

Shingo Sotoma, Chongxia Zhong, James Chen Yong Kah, Hayato Yamashita, Taras Plakhotnik, Yoshie Harada, Madoka Suzuki

bioRxiv　2020年6月4日　研究論文（学術雑誌）

Tracking the 3D Rotational Dynamics in Nanoscopic Biological Systems

Ryuji Igarashi, Takuma Sugi, Shingo Sotoma, Takuya Genjo, Yuta Kumiya, Erik Walinda, Hiroshi Ueno, Kazuhiro Ikeda, Hitoshi Sumiya, Hidehito Tochio, Yohsuke Yoshinari, Yoshie Harada, Masahiro Shirakawa

Journal of the American Chemical Society　Vol. 142　No. 16　p. 7542-7554　2020年4月22日　研究論文（学術雑誌）

蛍光ダイヤモンド粒子を用いた生体イメージング

原田慶恵

ATI News　No. 27　p. 2-7　2019年10月

Formation of perfectly aligned high-density NV centers in (111) CVD-grown diamonds for magnetic field imaging of magnetic particles

Hayato Ozawa, Yuji Hatano, Takayuki Iwasaki, Yoshie Harada, Mutsuko Hatano

Japanese Journal of Applied Physics　Vol. 58　No. SI　p. SIIB26-SIIB26　2019年7月17日　研究論文（学術雑誌）

Introduction to the Biophysical Society of Japan (BSJ).

Hideki Kandori, Yoshie Harada, Hiroyuki Noji

Biophysical reviews　Vol. 11　No. 3　p. 265-266　2019年6月

Polydopamine Coating as a Scaffold for Ring-Opening Chemistry To Functionalize Gold Nanoparticles

Shingo Sotoma, Yoshie Harada

Langmuir　Vol. 35　No. 25　p. 8357-8362　2019年6月　研究論文（学術雑誌）

HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome

Takeshi Yokoyama, Kodai Machida, Wakana Iwasaki, Tomoaki Shigeta, Madoka Nishimoto, Mari Takahashi, Ayako Sakamoto, Mayumi Yonemochi, Yoshie Harada, Hideki Shigematsu, Mikako Shirouzu, Hisashi Tadakuma, Hiroaki Imataka, Takuhiro Ito

Molecular Cell　Vol. 74　No. 6　p. 1205-1214.e8　2019年6月　研究論文（学術雑誌）

Multifunctional temozolomide-loaded lipid superparamagnetic nanovectors: dual targeting and disintegration of glioblastoma spheroids by synergic chemotherapy and hyperthermia treatment

Attilio Marino, Alice Camponovo, Andrea Degl'Innocenti, Martina Bartolucci, Christos Tapeinos, Chiara Martinelli, Daniele De Pasquale, Francesca Santoro, Valentina Mollo, Satoshi Arai, Madoka Suzuki, Yoshie Harada, Andrea Petretto, Gianni Ciofani

Nanoscale　Vol. 11　No. 44　p. 21227-21248　2019年　研究論文（学術雑誌）

ダイヤモンドセンサーデバイスとシステム構築

波多野雄治, 小澤勇斗, 岩崎孝之, 波多野睦子, 安田晋, 大島武, 原田慶恵

NEW DIAMOND　Vol. 35　No. 1　p. 7-13　2019年1月

ダイヤモンド

原田慶恵

実験医学 増刷　Vol. 36　No. 20　p. 171-173　2018年12月

Enrichment of ODMR-active nitrogen-vacancy centres in five-nanometre-sized detonation-synthesized nanodiamonds: Nanoprobes for temperature, angle and position

Shingo Sotoma, Daiki Terada, Takuya F. Segawa, Ryuji Igarashi, Yoshie Harada, Masahiro Shirakawa

Scientific Reports　Vol. 8　No. 1　2018年12月1日　研究論文（学術雑誌）

Magnetic field imaging of super-paramagnetic particles using high-density, perfectly oriented NV centres in diamond CVD film.

Yuji Hatano, Takeharu Sekiguchi, Takayuki Iwasaki, Mutsuko Hatano, Yoshie Harada

Phys. Status Solidi A　Vol. 215　No. 22　p. 1800254-1800254　2018年11月　研究論文（学術雑誌）

Fluorescent Nanodiamonds as a Robust Temperature Sensor inside a Single Cell

Takeharu Sekiguchi, Shingo Sotoma, Yoshie Harada

Biophysics and Physicobiology　Vol. 15　p. 229-234　2018年10月　研究論文（学術雑誌）

Construction of integrated gene logic-chip

Takeya Masubuchi, Masayuki Endo, Ryo Iizuka, Ayaka Iguchi, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Hao Qi, Ryosuke Iinuma, Yuya Miyazono, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada, Takuya Ueda, Hisashi Tadakuma

Nature Nanotechnology　Vol. 13　No. 10　p. 933-940　2018年10月1日　研究論文（学術雑誌）

One-Pot Synthesis of Highly Dispersible Fluorescent Nanodiamonds for Bioconjugation.

Daiki Terada, Shingo Sotoma, Yoshie Harada, Ryuji Igarashi, Masahiro Shirakawa

Bioconjug. Chem.　Vol. 29　No. 8　p. 2786-2792　2018年8月　研究論文（学術雑誌）

Commonly stabilized cytochromes c from deep-sea Shewanella and Pseudomonas.

Sotaro Fujii, Misa Masanari-Fujii, Shinya Kobayashi, Chiaki Kato, Masayoshi Nishiyama, Yoshie Harada, Satoshi Wakai, Yoshihiro Sambongi

Bioscience, biotechnology, and biochemistry　p. 1-8　2018年3月14日　研究論文（学術雑誌）

褐色脂肪細胞の温度変化をイメージングしたいのはなぜ？

鈴木団, 原田慶恵

生物物理　Vol. 58　No. 2　p. 97-99　2018年3月

Pressure-Ineduced Activation of the Swimming Motility of Magnetotactic Bacterium

Masayoshi Nishiyama, Ruan Juanfang, Takayuki Kato, Toru Minamino, Keiichi Namba, Akitoshi Seiyama, Long-Fei Wu, Yoshie Harada

Biophysical Journal　Vol. 114　No. 3　p. 324a-324a　2018年2月　研究論文（学術雑誌）

Morphological Control of Microtubule-Encapsulating Giant Vesicles by Changing Hydrostatic Pressure.

Kingo Takiguchi, Masahito Hayashi, Yuki Kazayama, Taro Toyota, Yoshie Harada, Masayoshi Nishiyama

Biological & pharmaceutical bulletin　Vol. 41　No. 3　p. 288-293　2018年　研究論文（学術雑誌）

DNAオリガミを用いた直行性を有する転写デバイスの合理的設計

増渕 岳也, 遠藤 政幸, 飯塚 怜, 井口 彩香, Yoon Dong, 関口 哲志, Qi Hao, 飯沼 良介, 宮薗 侑也, 庄子 習一, 船津 高志, 杉山 弘, 原田 慶恵, 上田 卓也, 多田隈 尚史

生命科学系学会合同年次大会　Vol. 2017年度　p. [2P-1323]　2017年12月

Live Cell Imaging Using Photoswitchable Diarylethene-Doped Fluorescent Polymer Dots

Yasuko Osakada, Tuyoshi Fukaminato, Yuma Ichinose, Mamoru Fujitsuka, Yoshie Harada, Tetsuro Majima

CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL　Vol. 12　No. 20　p. 2660-2665　2017年10月　研究論文（学術雑誌）

科学を愛するあなたのための研究費があります。基礎研究を追求する日本発の国際グラントHFSP フェローシップ獲得編

原田慶恵

実験医学　Vol. 35　No. 11　p. 1892-1897　2017年7月

ダイヤモンド磁気センサの高感度化技術

波多野睦子, 岩崎孝之, 田原康佐, 牧野俊, 水落憲和, 波多野雄治, 原田慶恵, 安田晋

NEW DIAMOND　Vol. 33　No. 2　p. 7-13　2017年4月

Preferential 5-Methylcytosine Oxidation in the Linker Region of Reconstituted Positioned Nucleosomes by Tet1 Protein

Seiichiro Kizaki, Tingting Zou, Yue Li, Yong-Woon Han, Yuki Suzuki, Yoshie Harada, Hiroshi Sugiyama

CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL　Vol. 22　No. 46　p. 16598-16601　2016年11月　研究論文（学術雑誌）

温度生物学の創成(展開を目指して) 細胞内温度の計測と操作による温度生物学

岡部 弘基, シ・ベイニ, 船津 高志, 原田 慶恵

日本細胞生物学会大会講演要旨集　Vol. 68回　p. 12-12　2016年5月

Reversible Morphological Control of Tubulin-Encapsulating Giant Liposomes by Hydrostatic Pressure

Masahito Hayashi, Masayoshi Nishiyama, Yuki Kazayama, Taro Toyota, Yoshie Harada, Kingo Takiguchi

LANGMUIR　Vol. 32　No. 15　p. 3794-3802　2016年4月　研究論文（学術雑誌）

The application of fluorescence-conjugated pyrrole/imidazole polyamides in the characterization of protein-DNA complex formation

Yong-Woon Han, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada

BIOMATERIALS SCIENCE　Vol. 4　No. 3　p. 391-399　2016年　研究論文（学術雑誌）

DNA折り紙上の異なった方式による遺伝子転写ナノデバイスの理論的な設計(Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami)

増渕 岳也, 多田隈 向史, 飯塚 怜, 遠藤 政幸, 船津 高志, 杉山 弘, 原田 慶恵, 上田 卓也

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集　Vol. 88回・38回　p. [3LBA089]-[3LBA089]　2015年12月

Synergistic effect of ATP for RuvA–RuvB–Holliday junction DNA complex formation.

Takuma Iwasa, Yong-Woon Han, Ryo Hiramatsu, Hiroaki Yokota, Kimiko Nakao, Ryuji Yokokawa, Teruo Ono, Yoshie Harada

Scientific Reports　Vol. 5　2015年12月　研究論文（学術雑誌）

ECHO-liveFISH: in vivo RNA labeling reveals dynamic regulation of nuclear RNA foci in living tissues

Ikumi Oomoto, Asuka Suzuki-Hirano, Hiroki Umeshima, Yong-Woon Han, Hiroyuki Yanagisawa, Peter Carlton, Yoshie Harada, Mineko Kengaku, Akimitsu Okamoto, Tomomi Shimogori, Dan Ohtan Wang

NUCLEIC ACIDS RESEARCH　Vol. 43　No. 19　2015年10月　研究論文（学術雑誌）

科学を愛するあなたのための研究費があります。基礎研究を追求する日本発の国際グラントHFSP フェローシップ申請編

原田慶恵

実験医学　Vol. 33　No. 11　p. 1817-1823　2015年7月

Suppression of Nonspecific Protein–Nanodiamond Adsorption Enabling Specific Targeting of Nanodiamonds to Biomolecules of Interest.

Shingo Sotoma, Ryuji Igarashi†, Jun Iimura, Yuta Kumiya, Hidehito Tochio, Yoshie Harada, Masahiro Shirakawa

Chemistry Letters　Vol. 44　No. 3　p. 354-356　2015年3月　研究論文（学術雑誌）

“Optically Detected Magnetic Resonance of Nanodiamonds in Vivo; Implementation of Selective Imaging and Fast Sampling.

Yosuke Yoshinari, Shigeyuki Mori, Ryuji Igarashi, Takuma Sugi, Hiroaki Yokota, Kazuhiro Ikeda, Hitoshi Sumiya, Ikue Mori, Hidehito Tochio, Yoshie Harada, Masahiro Shirakawa

Journal of Nanoscience and Nanotechnology　Vol. 15　No. 2　p. 1014-1021　2015年2月　研究論文（学術雑誌）

Application of fluorescent diamond nanoparticles to bio-imaging

Ryuji Igarashi, Shingo Sotoma, Masahiro Shirakawa, Yoshie Harada

Optics InfoBase Conference Papers　Vol. 2019　2015年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

Comprehensive and quantitative analysis for controlling the physical/chemical states and particle properties of nanodiamonds for biological applications

S. Sotoma, K. Akagi, S. Hosokawa, R. Igarashi, H. Tochio, Y. Harada, M. Shirakawa

RSC ADVANCES　Vol. 5　No. 18　p. 13818-13827　2015年　研究論文（学術雑誌）

蛍光ダイヤモンド粒子を用いた生体イメージング技術の開発

原田慶恵

応用物理　Vol. 84　No. 1　p. 56-60　2015年1月

Effective production of fluorescent nanodiamonds containing negatively-charged nitrogen-vacancy centers by ion irradiation

Shingo Sotoma, Yohsuke Yoshinari, Ryuji Igarashi, Akiyoshi Yamazaki, Shige H. Yoshimura, Hidehito Tochio, Masahiro Shirakawa, Yoshie Harada

DIAMOND AND RELATED MATERIALS　Vol. 49　p. 33-38　2014年10月　研究論文（学術雑誌）

Quantitative In Vivo Fluorescence Cross-Correlation Analyses Highlight the Importance of Competitive Effects in the Regulation of Protein-Protein Interactions

Wakako Sadaie, Yoshie Harada, Michiyuki Matsuda, Kazuhiro Aoki

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY　Vol. 34　No. 17　p. 3272-3290　2014年9月　研究論文（学術雑誌）

蛍光標識したSRAを用いた半メチル化CpGメチル化過程の特性分析

Cui Yubing, Han Yong-Woon, Ariyoshi Mariko, Arita Kyohei, Suetake Isao, Tajima Shoji, Harada Yoshie

Vol. 54　No. Suppl.1-2　p. S268-S268　2014年8月

ナノ開口基板を用いたDNAメチル化パターン維持機構に関与する生体分子の機能解析

韓 龍雲, 原田 慶恵

生体の科学　Vol. 65　No. 6　p. 553-558　2014年6月

ナノダイヤモンドNVCを使った新しい生体・細胞計測

杤尾豪人, 外間進悟, 原田慶恵

生化学　Vol. 86　No. 2　p. 145-153　2014年4月

Real-time single-cell imaging of protein secretion

Yoshitaka Shirasaki, Mai Yamagishi, Nobutake Suzuki, Kazushi Izawa, Asahi Nakahara, Jun Mizuno, Shuichi Shoji, Toshio Heike, Yoshie Harada, Ryuta Nishikomori, Osamu Ohara

SCIENTIFIC REPORTS　Vol. 4　No. 4　2014年4月　研究論文（学術雑誌）

1P316 Rational design of orthogonal gene transcription nano device on DNA origami(28. Bioengineering,Poster,The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(BSJ2014))

Masubuchi Takeya, Tadakuma Hisashi, Endo Masayuki, Sugiyama Hiroshi, Harada Yoshie, Ueda Takuya

生物物理　Vol. 54　No. 1　2014年

1P306 1細胞分泌実時間測定によるIL-1β非古典的分泌機序の解明(27. バイオイメージング,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Shirasaki Yoshitaka, Liu Ting, Yamaguchi Yoshifumi, Yamaguchi Mai, Suzuki Nobutake, Izawa Kazushi, Mizuno Jun, Shoji Shuichi, Harada Yoshie, Nishikomori Ryuta, Heike Toshio, Miura Masayuki, Ohara Osamu

生物物理　Vol. 54　No. 1　2014年

3P272 Observing the rotational diffusion of nanodiamonds with arbitrary nitrogen vacancy center configurations(24. Mathematical biology,Poster,The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(BSJ2014))

Kalay Ziya, Yoshinari Yohsuke, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 54　No. 1　2014年

2P118 哺乳類ヌクレオチド除去修復タンパク質XPCのDNA結合モードの1分子イメージング(04. 核酸結合蛋白質,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Yokota Hiroaki, Tone Daisuke, Han Yong-Woon, Harada Yoshie, Sugasawa Kaoru

生物物理　Vol. 54　No. 1　2014年

Optically detected magnetic resonance of nanodiamonds in vivo.

Yoshie Harada

Lecture Notes on Cell Biology and Materials Science　2014年1月

Construction and characterization of Cy3-or Cy5-conjugated hairpin pyrrole-imidazole polyamides binding to DNA in the nucleosome

Yong-Woon Han, Yasuo Tsunaka, Hiroaki Yokota, Tomoko Matsumoto, Gengo Kashiwazaki, Hironobu Morinaga, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Hiroshi Sugiyama, Yoshie Harada

BIOMATERIALS SCIENCE　Vol. 2　No. 3　p. 297-307　2014年　研究論文（学術雑誌）

Hard X-ray-induced optical luminescence via biomolecule-directed metal clusters

Yasuko Osakada, Guillem Pratx, Conroy Sun, Masanori Sakamoto, Moiz Ahmad, Olga Volotskova, Qunxiang Ong, Toshiharu Teranishi, Yoshie Harada, Lei Xing, Bianxiao Cui

CHEMICAL COMMUNICATIONS　Vol. 50　No. 27　p. 3549-3551　2014年　研究論文（学術雑誌）

Observing the rotational diffusion of nanodiamonds with arbitrary nitrogen vacancy center configurations

Yohsuke Yoshinari, Ziya Kalay, Yoshie Harada

PHYSICAL REVIEW B　Vol. 88　No. 23　2013年12月　研究論文（学術雑誌）

統合バイオイメージング公開シンポジウム「医学・生命科学の革新的発属に資する締合バイオイメージングの展望」報告

曽我部 正博, 永山 國昭, 難波 啓一, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 53　No. 6　p. 329-333　2013年11月25日

Effect of single pyrrole replacement with β-alanine on DNA binding affinity and sequence specificity of hairpin pyrrole/imidazole polyamides targeting 5'-GCGC-3'.

Yong-Woon Han, Gengo Kashiwazaki, Hironobu Morinaga, Tomoko Matsumoto, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Yoshie Harada, Hiroshi Sugiyama

Bioorganic & medicinal chemistry　Vol. 21　No. 17　p. 5436-5441　2013年9月1日　研究論文（学術雑誌）

ダイヤモンドナノ粒子を使った新しい生体分子蛍光イメージング法の開発

原田 慶恵

現代化学 東京化学同人　Vol. 511　p. 42-46　2013年9月

In Vivo Fluorescent Adenosine 5'-Triphosphate (ATP) Imaging of Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans by Using a Genetically Encoded Fluorescent ATP Biosensor Optimized for Low Temperatures

Taiichi Tsuyama, Jun-ichi Kishikawa, Yong-Woon Han, Yoshie Harada, Asako Tsubouchi, Hiroyuki Noji, Akira Kakizuka, Ken Yokoyama, Tadashi Uemura, Hiromi Imamura

ANALYTICAL CHEMISTRY　Vol. 85　No. 16　p. 7889-7896　2013年8月　研究論文（学術雑誌）

ParA-mediated plasmid partition driven by protein pattern self-organization

Ling Chin Hwang, Anthony G. Vecchiarelli, Yong-Woon Han, Michiyo Mizuuchi, Yoshie Harada, Barbara E. Funnell, Kiyoshi Mizuuchi

EMBO Journal　Vol. 32　No. 9　p. 1238-1249　2013年5月2日　研究論文（学術雑誌）

Single-Molecule Imaging of the Oligomer Formation of the Nonhexameric Escherichia coli UvrD Helicase

Hiroaki Yokota, Yuko Ayabe Chujo, Yoshie Harada

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 104　No. 4　p. 924-933　2013年2月　研究論文（学術雑誌）

蛍光ダイヤモンドナノ粒子を使った新規1分子イメージング法の開発

五十嵐 龍治, 吉成 洋祐, 横田 浩章, 白川 昌宏, 原田 慶恵

電気学会研究会資料. OQD, 光・量子デバイス研究会　Vol. 2013　No. 1　p. 1-3　2013年1月22日

1P301 成長円錐における単一分子レベルでのアクチン関連mRNAの局在(27. バイオイメージング,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Koizumi Hidenori, Osakada Yasuko, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

1P300 X-ray excited optical luminescence via bio-molecule directed metal clusters(27. Bioimaging,Poster)

Osakada Yasuko, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

2P117 哺乳類ヌクレオチド除去修復タンパク質XPCの1分子イメージング(04.核酸結合蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Yokota Hiroaki, Tone Daisuke, Han Yong-Woon, Harada Yoshie, Sugasawa Kaoru

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

2P119 ナノ開口を用いた1分子イメージングによるRuvB多量体形成機構の解明(04.核酸結合蛋白質,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Iwasa Takuma, Han Yong-Woon, Yokota Hiroaki, Yokokawa Ryuji, Hiramatsu Ryo, Ono Teruo, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

1SCP-05 Optically detected magnetic resonance spectroscopy of nitrogen-vacancy centers for subnanoscopic measurement in vivo(1SCP Challenges to in vivo biophysics,Symposium,The 51th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Igarashi Ryuji, Kumiya Yuta, Sugi Takuma, Sugihara Fuminori, Tochio Hidehito, Yoshinari Yousuke, Harada Yoshie, Shirakawa Masahiro

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

3P306 DNAナノ構造体を用いたDNA-RNAポリメラーゼ・ハイブリッドナノマシンの構築と活性評価(28.バイオエンジニアリング,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Masubuchi Takeya, Tadakuma Hisashi, Endo Masayuki, Sugiyama Hiroshi, Harada Yoshie, Ueda Takuya

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

3P283 蛍光ダイアモンドナノ粒子を使った光検出磁気共鳴(26.計測,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Yoshinari Yohsuke, Kumiya Yuta, Sugi Takuma, Igarashi Ryuji, Sotoma Shingo, Shirakawa Masahiro, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 53　No. 1　2013年

Characterization of SRA-Methylated DNA Complexes Dynamics Related to Chromatin Structure Regulation

Yong-Woon Han, Hiroaki Yokota, Mariko Ariyoshi, Yasuo Tsunaka, Takuma Iwasa, Ryuji Yokokawa, Ryo Hiramatsu, Daichi Chiba, Teruo Ono, Yoshie Harada

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 104　No. 2　p. 255A-255A　2013年1月　研究論文（学術雑誌）

疾患克服を目指したケミカルバイオロジー 生きた細胞内の温度イメージング

岡部 弘基, 内山 聖一, 稲田 のりこ, 原田 慶恵, 船津 高志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集　Vol. 85回　p. 1S16-2　2012年12月

Binding of hairpin pyrrole and imidazole polyamides to DNA: relationship between torsion angle and association rate constants

Yong-Woon Han, Tomoko Matsumoto, Hiroaki Yokota, Gengo Kashiwazaki, Hironobu Morinaga, Kaori Hashiya, Toshikazu Bando, Yoshie Harada, Hiroshi Sugiyama

NUCLEIC ACIDS RESEARCH　Vol. 40　No. 22　p. 11510-11517　2012年12月　研究論文（学術雑誌）

「小さくてもキラリと光る仕事を」再考

原田 慶恵

生物物理　Vol. 52　No. 6　p. 263-263　2012年11月25日

Real-Time Background-Free Selective Imaging of Fluorescent Nanodiamonds in Vivo

Ryuji Igarashi, Yohsuke Yoshinari, Hiroaki Yokota, Takuma Sugi, Fuminori Sugihara, Kazuhiro Ikeda, Hitoshi Sumiya, Shigenori Tsuji, Ikue Mori, Hidehito Tochio, Yoshie Harada, Masahiro Shirakawa

NANO LETTERS　Vol. 12　No. 11　p. 5726-5732　2012年11月　研究論文（学術雑誌）

蛍光性温度センサーを利用した細胞内の温度分布計測

岡部 弘基, 稲田 のりこ, 郷田 千恵, 原田 慶恵, 船津 高志, 内山 聖一

日本分析化学会講演要旨集　Vol. 61年会　p. 136-136　2012年9月

Direct Observation of Strand Passage by DNA-Topoisomerase and Its Limited Processivity

Katsunori Yogo, Taisaku Ogawa, Masahito Hayashi, Yoshie Harada, Takayuki Nishizaka, Kazuhiko Kinosita

PLOS ONE　Vol. 7　No. 4　2012年4月　研究論文（学術雑誌）

生物物理の未来

石森 浩一郎, 伊藤 悦朗, 高田 彰二, 寺北 明久, 原田 慶恵, 望月 敦史, 安田 賢二, 若槻 壮市, 神取 秀樹, 木寺 詔紀

生物物理　Vol. 52　No. 2　p. 83-95　2012年3月25日

Intracellular temperature mapping with a fluorescent polymeric thermometer and fluorescence lifetime imaging microscopy

Kohki Okabe, Noriko Inada, Chie Gota, Yoshie Harada, Takashi Funatsu, Seiichi Uchiyama

NATURE COMMUNICATIONS　Vol. 3　2012年2月　研究論文（学術雑誌）

1PS042 多分子キネシン間の協調性は運搬物を効率的に長距離輸送するのに重要である(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Miyazono Yuya, Endo Masayuki, Ueda Takuya, Sugiyama Hiroshi, Harada Yoshie, Tadakuma Hisashi

生物物理　Vol. 52　2012年

1SD-01 Characterization of Protein-DNA complexes dynamics related to Chromatin structure regulation using Single-Molecule Techniques(1SD Molecular Dynamics in the Nucleus and Gene Regulation,Symposium,The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

韓 龍雲, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 52　2012年

3PS031 炎症時におけるヒト単球サイトカイン分泌のライブセルイメージング(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Shirasaki Yoshitaka, Shimura Nanako, Suzuki Nobutake, Izawa Kazushi, Nakahara Asahi, Yamagishi Mai, Harada Yoshie, Shouji Shuichi, Nishikomori Ryuta, Ohara Osamu

生物物理　Vol. 52　2012年

3PS010 生細胞内における温度分布のイメージング(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Okabe Kohki, Uchiyama Seiichi, Inada Noriko, Harada Yoshie, Funatsu Takashi

生物物理　Vol. 52　2012年

3PT111 DNAナノ構造を用いたDNA-RNAポリメラーゼ・ハイプリッドナノマシンの構築と機能評価(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Masubuchi Takeya, Tadakuma Hisashi, Endo Masayuki, Sugiyama Hiroshi, Harada Yoshie, Ueda Takuya

生物物理　Vol. 52　2012年

3C1046 大腸菌非六量体型DNAヘリカーゼUvrDは多量体でDNAを巻き戻す(核酸,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Yokota Hiroaki, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 52　2012年

Direct Visualization of the Movement of a Single T7 RNA Polymerase and Transcription on a DNA Nanostructure

Masayuki Endo, Koichi Tatsumi, Kosuke Terushima, Yousuke Katsuda, Kumi Hidaka, Yoshie Harada, Hiroshi Sugiyama

ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION　Vol. 51　No. 35　p. 8778-8782　2012年　研究論文（学術雑誌）

線形アンチセンスプローブを用いた生細胞内のmRNAイメージング

岡部 弘基, 張 ジュンウェイ, 原田 慶恵, 船津 高志

バイオイメージング　Vol. 20　No. 2　p. 143-144　2011年8月

Facilitated Intracellular Transport of TrkA by an Interaction with Nerve Growth Factor

Mami Nomura, Takeharu Nagai, Yoshie Harada, Tomomi Tani

DEVELOPMENTAL NEUROBIOLOGY　Vol. 71　No. 7　p. 634-649　2011年7月　研究論文（学術雑誌）

Real time monitoring of endogenous cytoplasmic mRNA using linear antisense 2′-O-methyl RNA probes in living cells

Kohki Okabe, Yoshie Harada, Junwei Zhang, Hisashi Tadakuma, Tokio Tani, Takashi Funatsu

Nucleic Acids Research　Vol. 39　No. 4　p. e20-e20　2011年3月　研究論文（学術雑誌）

1M1548 P46 ナノ開口によるAAA^+ DNA組換えATPaseの1分子イメージング : 6量体形成過程の解明に向けて(分子モーター2,第49回日本生物物理学会年会)

Iwasa Takuma, Han Yongwoon, Yokota Hiroaki, Yokokawa Ryuji, harada Yoshie

生物物理　Vol. 51　2011年

1M1524 DNA-kinesinハイブリッド・ナノマシンの構築(分子モーター2,第49回日本生物物理学会年会)

Miyazono Yuya, Endo Masayuki, Ueda Takuya, Sugiyama Hiroshi, Harada Yoshie, Tadakuma Hisashi

生物物理　Vol. 51　p. S64-S65　2011年

1C1548 Direct observation of P1 plasmid movement on an optical microscope(Nucleic acid,The 49th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Han Yong-Woon, Hwang Ling-Chin, Vecchiarelli Anthony G., Mizuuchi Michiyo, Funnell Barbara E., Harada Yoshie, Mizuuchi Kiyoshi

生物物理　Vol. 51　p. S35-S36　2011年

生体分子・細胞を「見る」「測る」「解る」ための新規分析法 生きた単一細胞内の内在性mRNAのイメージングと定量

岡部 弘基, 原田 慶恵, 船津 高志

日本薬学会年会要旨集　Vol. 130年会　No. 1　p. 314-314　2010年3月

日本生物物理学会第47回年会報告生物物理若手奨励賞 : 第5回選考過程報告

原田 慶恵

生物物理　Vol. 50　No. 1　p. 42-43　2010年1月25日

Strain through the neck linker ensures processive runs: a DNA-kinesin hybrid nanomachine study

Yuya Miyazono, Masahito Hayashi, Peter Karagiannis, Yoshie Harada, Hisashi Tadakuma

The EMBO Journal　Vol. 29　No. 1　p. 93-106　2010年1月6日　研究論文（学術雑誌）

2P332 単一細胞分泌タンパク質のリアルタイム定量法の開発(バイオイメージング,第48回日本生物物理学会年会)

Shirasaki Yoshitaka, Yamagishi Mai, Nakamura Asahi, Sasuga Yasuhiro, Suzuki Nobutake, Shimura Nanako, Kawai Kentaro, Mizuno Jun, Shoji Shuichi, Harada Yoshie, Ohara Osamu

生物物理　Vol. 50　No. 2　2010年

2P177 Strain through the neck linker ensures processive runs : a DNA-kinesin hybrid nanomachine study(The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Miyazono Yuya, Hayashi Masahito, Karagiannis Peter, Harada Yoshie, Tadakuma Hisashi

生物物理　Vol. 50　No. 2　2010年

1P125 Fixed interaction between the Escherichia coli RuvA and RuvB proteins during branch migration of Holliday junction(Nucleic acid binding proteins,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Han YongWoon, Yokota Hiroaki, Hishida Takashi, Iwasaki Hiroshi, Hayashi Masahito, Shinagawa Hideo, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 50　No. 2　2010年

Single-molecule Visualization of Binding Modes of Helicase to DNA on PEGylated Surfaces

Hiroaki Yokota, Yong-Woon Han, Jean-Francois Allemand, Xu Guang Xi, David Bensimon, Vincent Croquette, Yoshihiro Ito, Yoshie Harada

CHEMISTRY LETTERS　Vol. 38　No. 4　p. 308-309　2009年4月　研究論文（学術雑誌）

Hydrophilic Fluorescent Nanogel Thermometer for Intracellular Thermometry

Chie Gota, Kohki Okabe, Takashi Funatsu, Yoshie Harada, Seiichi Uchiyama

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY　Vol. 131　No. 8　p. 2766-+　2009年3月　研究論文（学術雑誌）

1P-269 線形アンチセンスプローブを用いた生細胞の内在性mRNAのリアルタイム追跡(バイオイメージング,第47回日本生物物理学会年会)

Okabe Kohki, Harada Yoshie, Funatsu Takashi

生物物理　Vol. 49　p. S104-S105　2009年

3P-253 DNA-ヘリカーゼ相互作用の1分子観察(バイオイメージング,口頭発表,第47回日本生物物理学会年会)

横田 浩章, Chujo Yuko, Nishimoto Emi, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 49　2009年

Single-Cell Chemical Lysis Method for Analyses of Intracellular Molecules Using an Array of Picoliter-Scale Microwells

Yasuhiro Sasuga, Tomoyuki Iwasawa, Kayoko Terada, Yoshihiro Oe, Hiroyuki Sorimachi, Osamu Ohara, Yoshie Harada

ANALYTICAL CHEMISTRY　Vol. 80　No. 23　p. 9141-9149　2008年12月　研究論文（学術雑誌）

細胞機能の3次元ナノイメージング 生きた細胞内における内在性mRNAの検出と定量(Three dimensional nano-imaging of cellular functions Real time monitoring and quantitation of endogenous mRNA in single living cells)

岡部 弘基, 原田 慶恵, 船津 高志

日本細胞生物学会大会講演要旨集　Vol. 60回　p. 78-78　2008年6月

生きた細胞内における内在性mRNAの検出と定量(Real time monitoring and quantitation of endogenous mRNA in single living cells)

岡部 弘基, 原田 慶恵, 船津 高志

日本細胞生物学会大会講演要旨集　Vol. 60回　p. 117-117　2008年6月

1分子が見えた！

原田慶恵

細胞工学　Vol. 27　No. 5　p. 425-425　2008年5月

2P-332 DNAヘリカーゼUvrDの機能単位の1分子解析(バイオイメージング(1),第46回日本生物物理学会年会)

Chujo Yuko, Harada Yoshie, Yokota Hiroaki

生物物理　Vol. 48　2008年

2P-331 同時計測顕微鏡によるDNA-ヘリカーゼ相互作用の1分子観察(バイオイメージング(1),第46回日本生物物理学会年会)

Yokota Hiroaki, Han Yong-Woon, Allemand Jean-Francois, Xi Xuguang, Croquette Vincent, Bensimon David, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 48　2008年

3P-054 マイクロビーズとマイクロ流路を組み合わせた新規プロテインアレイの開発(蛋白質・計測,解析の方法論,第46回日本生物物理学会年会)

Ooe Yoshihiro, Sasuga Yasuhiro, Ohara Osamu, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 48　p. S135-S136　2008年

1P-158 キネシンの連続歩行には適切な空間配置が重要である(分子モーター(1),第46回日本生物物理学会年会)

Miyazono Yuya, Hayashi Masahito, Harada Yoshie, Tadakuma Hisashi

生物物理　Vol. 48　2008年

3P-326 生きた単一細胞におけるmRNAとそれに対応するタンパク質の同時定量(バイオイメージング(2),第46回日本生物物理学会年会)

Kobayashi Toru, Okabe Kohki, Harada Yoshie, Funatsu Takashi

生物物理　Vol. 48　2008年

生きた単一細胞における内在性mRNAのリアルタイム定量(Real time quantitation of the endogenous mRNA in single living cells)

岡部 弘基, 船津 高志, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 47　No. Suppl.1　p. S282-S282　2007年11月

細胞質の分子篩効果によるmRNAの細胞質内局在化(Subcellular localization of mRNA is attributed to molecular sieving effect)

山岸 舞, 石浜 陽, 白崎 善隆, 貴家 康尋, 寺田 佳代子, 原田 慶恵, 船津 高志

生物物理　Vol. 47　No. Suppl.1　p. S282-S282　2007年11月

Direct observation of the reversible unwinding of a single DNA molecule caused by the intercalation of ethidium bromide

Masahito Hayashi, Yoshie Harada

NUCLEIC ACIDS RESEARCH　Vol. 35　No. 19　2007年10月　研究論文（学術雑誌）

世界物理年に学んだこと

原田慶恵

教師の広場　No. 152　p. 4-5　2007年6月

一分子蛍光法

原田 慶恵

化学と生物　Vol. 45　No. 5　p. 340-346　2007年5月1日

Inhibition of reversed electron transfer and proton transport in the beef heart cytochrome bc(1) complex by chemical modification

Toshiaki Miki, Masato Umeda, Yoshie Harada

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY　Vol. 141　No. 3　p. 377-387　2007年3月　研究論文（学術雑誌）

Visualization of RecA filaments and DNA by fluorescence microscopy

Taro Nishinaka, Yuko Doi, Makiko Hashimoto, Reiko Hara, Takehiko Shibata, Yoshie Harada, Kazuhiko Kinosita, Hiroyuki Noji, Eiji Yashima

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY　Vol. 141　No. 2　p. 147-156　2007年2月　研究論文（学術雑誌）

3P154 転写開始時の転写バブル形成の可視化(分子モーター,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

加藤 悠子, 林 正人, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 47　2007年

3P193 切断された神経軸索の再生における神経成長因子の作用(細胞生物学的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

野村 真未, 原田 慶恵, 谷 知己

生物物理　Vol. 47　2007年

3P320 同時計測顕微鏡によるDNA/ヘリカーゼ相互作用の1分子観察(バイオイメージング、行動、発生・分化、分子遺伝、その他,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

横田 浩章, 韓 龍雲, Allemand Jean-Francois, Xuguang Xi, Vincent Croquette, Bensimon David, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 47　2007年

3P317 生きた単一細胞における内在性mRNAのリアルタイム定量(バイオイメージング、生命の起源・進化,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

岡部 弘基, 船津 高志, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 47　2007年

3P319 DNA helicase UvrDの一分子観察(バイオイメージング、行動、発生・分化、分子遺伝、その他,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

中条 裕子, 横田 浩章, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 47　2007年

3P318 細胞質の分子篩効果によるmRNAの細胞質内局在化(バイオイメージング、行動、発生・分化、分子遺伝、その他,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

山岸 舞, 石浜 陽, 白崎 善隆, 貴家 康尋, 寺田 佳代子, 原田 慶恵, 船津 高志

生物物理　Vol. 47　2007年

バイオマシン・生物分子モーター

原田慶恵, 横田浩章

細胞工学　Vol. 25　No. 8　p. 878-883　2006年8月

Direct observation of DNA rotation during branch migration of Holliday junction DNA by Escherichia coli RuvA-RuvB protein complex

Yong-Woon Han, Tomomi Tani, Masahito Hayashi, Takashi Hishida, Hiroshi Iwasaki, Hideo Shinagawa, Yoshie Harada

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　Vol. 103　No. 31　p. 11544-11548　2006年8月　研究論文（学術雑誌）

2P525 Development of a microscopic platform for single-cell analyses using picoliter microwell array(52. Bio-imaging,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Sasuga Yasuhiro, Iwasawa Tomoyuki, Terada Kayoko, Sorimachi Hiroyuki, Ohara Osamu, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 46　No. 2　2006年

2P513 Real Time Imaging of Specific Messenger RNA in a Living Cell Using Artificial Nucleic Acids(52. Bio-imaging,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Okabe Kohki, Harada Yoshie, Funatsu Takashi

生物物理　Vol. 46　No. 2　2006年

1P556 Novel microscopy for simultaneous single molecule measurement of DNA/protein interaction(26. Single molecule biophysics,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yokota Hiroaki, Han Yong-Woon, Allemand Jean-Francois, Xi Xugang, Croquette Vincent, Bensimon David, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 46　No. 2　2006年

1P174 Labeling of iron-sulfur protein with a fluorescent dye to detect its conformation change in the cytochrome bc_1 complex(5. Heme protein,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Miki Toshiaki, Sakamoto Shun, Yokota Hiroaki, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 46　No. 2　2006年

1P297 Direct observation of T7 RNA polymerase rotation during transcription.(9. Molecular motor (I),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kato Yuko, Yokota Hiroaki, Hayashi Masahito, Terada Kayoko, Sasuga Yasuhiro, Harada Yoshie

生物物理　Vol. 46　No. 2　2006年

Development of a microscopic platform for real-time monitoring of biomolecular interactions

Y Sasuga, T Tani, M Hayashi, H Yamakawa, O Ohara, Y Harada

GENOME RESEARCH　Vol. 16　No. 1　p. 132-139　2006年1月　研究論文（学術雑誌）

神経細胞の軸索伸長反応を引き起こす神経成長因子のふるまい : その1分子解析

谷 知己, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　No. 6　p. 320-323　2005年11月25日

１個の生体分子の運動を観る

原田慶恵

総研大ジャーナル　2005年10月

ビーズを用いた生体分子間相互作用解析技術の開発

原田 慶恵

BIO INDUSTRYシーエムシー出版　Vol. 22　No. 10　p. 66-74　2005年10月

Structure-function analysis of the three domains of RuvB DNA motor protein

T Ohnishi, T Hishida, Y Harada, H Iwasaki, H Shinagawa

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY　Vol. 280　No. 34　p. 30504-30510　2005年8月　研究論文（学術雑誌）

分子イメージングによる分子間相互作用解析法の開発

貴家康尋, 原田慶恵

バイオテクノロジージャーナル　Vol. 5　No. 3　p. 303-305　2005年5月

Trafficking of a ligand-receptor complex on the growth cones as an essential step for the uptake of nerve growth factor at the distal end of the axon: A single-molecule analysis

T Tani, Y Miyamoto, KE Fujimori, T Taguchi, T Yanagida, Y Sako, Y Harada

JOURNAL OF NEUROSCIENCE　Vol. 25　No. 9　p. 2181-2191　2005年3月　研究論文（学術雑誌）

3SF55 1分子イメージングで生体分子の機能を探る(バイオとナノの融合 : 生物物理学からのアプローチ)(北海道大学21世紀COE共催シンポジウム)

原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

2P136 1分子DNA構造変化計測法を用いた臭化エチジウムのDNAへの結合定数の測定(核酸 A) 構造・物性))

林 真人, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

3P094 ミトコンドリア・チトクロムbc_1複合体の構造変化を可視化する試み(ヘム蛋白質))

三木 俊明, 谷 知己, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

1P120 RecA-DNA複合体フィラメントのヌクレオチド依存性形状解析(核酸結合蛋白質))

西中 太郎, 土井 ゆうこ, 橋本 牧子, 柴田 武彦, 原田 慶恵, 木下 一彦, 野地 博行, 八島 栄次

生物物理　Vol. 45　2005年

1P128 Holliday構造DNA分岐点移動反応に関与するRuvA-RuvB蛋白質複合体の動力学的解析(核酸結合蛋白質))

韓 龍霊, 谷 知己, 林 真人, 横田 浩章, 菱田 卓, 岩崎 博史, 品川 日出夫, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

1P349 人工核酸を用いた生きた細胞内における特定のmRNAのリアルタイムイメージング(バイオイメージング))

岡部 弘基, 池田 壽文, 原田 慶恵, 船津 高志

生物物理　Vol. 45　2005年

1P333 マイクロビーズアレイ技術を利用した単一細胞タンパク質発現プロファイリング(バイオイメージング))

貴家 康尋, 寺田 佳代子, 谷 知己, 小原 収, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

1P327 1分子力学/蛍光同時計測顕微鏡の開発II(バイオイメージング))

横田 浩章, 韓 龍雲, Allemand Jean-Francois, Xi Xueuang, Croquette Vincent, Bensimon David, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 45　2005年

1P348 mRNAの細胞内ラベリングと運動解析(バイオイメージング))

山岸 舞, 貴家 康尋, 寺田 佳代子, 原田 慶恵, 船津 高志

生物物理　Vol. 45　2005年

蛍光１分子イメージング.

谷知己, 原田慶恵

蛋白質 核酸 酵素　Vol. 49　No. 11　p. 1647-1651　2004年11月

Studies on Biomolecules Using Single Molecule Imaging and Manipulation Techniques.

Yoshie Harada

Sci. Tech. Adv. Mat.　Vol. 5　p. 709-713　2004年8月　研究論文（学術雑誌）

2P097 一分子解析法を用いたRuvA-RuvB蛋白質複合体のHolliday構造DNA分岐点移動反応の直接観察(核酸結合蛋白質)

韓 龍雲, 谷 知己, 林 真人, 菱田 卓, 岩崎 博史, 品川 日出夫, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 44　2004年

2P088 組み換え体の鉄イオウタンパク質を用いたミトコンドリア・チトクロムbc_1複合体の再構成(ヘム蛋白質)

三木 俊明, 貴家 康尋, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 44　2004年

2P277 1本のDNAに生じる2重らせん構造の変化を直接計測する(バイオイメージング)

林 真人, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 44　2004年

2P278 マイクロビーズアレイを利用した分子イメージングによる生体分子間相互作用解析法の開発(バイオイメージング)

貴家 康尋, 小原 収, 谷 知己, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 44　2004年

2P158 神経成長因子の結合に伴う後根節神経成長円錐の運動反応 : その刺激応答連関の1分子解析(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)

谷 知己, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 44　2004年

2P178 β-actin mRNAとzipcode-binding protein 1の結合・解離のキネティクス(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)

永川 豊広, 鞍馬 秀輝, 貴家 康尋, 原田 慶恵, 船津 高志

生物物理　Vol. 44　2004年

生体分子機能を観察できる光学顕微鏡システムの開発

貴家康尋, 原田 慶恵

月刊薬事　Vol. 46　No. 5　p. 149-154　2004年

熱ゆらぎを利用して動く？-モータータンパク質の新しい運動モデル

原田慶恵

Vol. 58　No. 11　p. 48-49　2003年11月

RNAポリメラーゼによるDNAの回転をみる

原田慶恵

実験医学　Vol. 21　No. 13　p. 1800-1801　2003年9月

生理学実験法講座「1分子生理学」 DNAモーターの1分子機能解析

原田慶恵

日生誌　Vol. 65　No. 7,8　p. 225-231　2003年7月

成長円錐における神経成長因子の輸送と集積 : 1分子単位の観察

谷 知己, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 43　2003年

「生物物理」分野の研究

原田慶恵

共同参画２１　2003年1月

1分子の動きを見て生体分子の機能を探る

原田慶恵

光技術コンタクト　Vol. 40　No. 3　p. 19-26　2002年12月

3N1545 蛍光標識β-actin mRNAの細胞内輸送と局在のイメージング(12.細胞生物学的課題,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)

鞍馬 秀輝, 貴家 康尋, 多田隈 尚史, 永川 豊広, 船津 高志, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 42　No. 2　2002年

RNAポリメラーゼはDNAを回転させて転写する

原田慶恵

化学と生物　Vol. 39　No. 7　p. 420-421　2001年7月

RNAポリメラーゼによるDNAの回転の可視化

原田慶恵

細胞工学　Vol. 20　No. 5　p. 636-637　2001年5月

S2D01転写中のRNAポリメラーゼによるDNAの回転の直接観察

原田 慶恵

生物物理　Vol. 41　2001年

Direct observation of DNA rotation during transcription by Escherichia coli RNA polymerase

Y Harada, O Ohara, A Takatsuki, H Itoh, N Shimamoto, K Kinosita

NATURE　Vol. 409　No. 6816　p. 113-115　2001年1月　研究論文（学術雑誌）

Stepping rotation of F-1-ATPase visualized through angle-resolved single-fluorophore imaging

K Adachi, R Yasuda, H Noji, H Itoh, Y Harada, M Yoshida, K Kinosita

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA　Vol. 97　No. 13　p. 7243-7247　2000年6月　研究論文（学術雑誌）

3F0945 蛍光性ATPアナログのATPase siteへの結合時間のビデオ高速イメージング

茶圓 茂, 白川 伊吹, 原田 慶恵

生物物理　Vol. 40　2000年

DNA分子に結び目をつくる

原田慶恵, 木下一彦

遺伝　Vol. 53　No. 10　p. 10-12　1999年10月

分子のひもを結ぶ

原田 慶恵

三田評論　Vol. 1015　p. 68-69　1999年7月1日

Tying a molecular knot with optical tweezers

Y Arai, R Yasuda, K Akashi, Y Harada, H Miyata, K Kinosita, H Itoh

NATURE　Vol. 399　No. 6735　p. 446-448　1999年6月　研究論文（学術雑誌）

Single-molecule imaging of RNA polymerase-DNA interactions in real time

Y Harada, T Funatsu, K Murakami, Y Nonoyama, A Ishihama, T Yanagida

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 76　No. 2　p. 709-715　1999年2月　研究論文（学術雑誌）

エバネッセント波を用いたDNA-RNAポリメラーゼ１分子相互作用のイメージング

原田慶恵

精密工学会誌　Vol. 65　No. 2　p. 205-208　1999年2月

3PD044 DNAのねじれ弾性測定

羽田 裕子, 原田 慶恵, 木下 一彦

生物物理　Vol. 39　1999年

3PD042 磁気ピンセットを用いたマニピュレート法の開発

竹中 啓, 原田 慶恵, 伊藤 博康, 木下 一彦

生物物理　Vol. 39　1999年

蛍光顕微鏡システムによる生体分子の1分子イメージング

原田慶恵, 船津高志

細胞工学　Vol. 17　No. 4　p. 626-633　1998年4月

Single molecule imaging and nanomanipulation of biomolecules

Y Harada, T Funatsu, M Tokunaga, K Saito, H Higuchi, Y Ishii, T Yanagida

METHODS IN CELL BIOLOGY, VOL 55　Vol. 55　p. 117-128　1998年

Imaging and nano-manipulation of single biomolecules

Takashi Funatsu, Yoshie Harada, Hideo Higuchi, Makio Tokunaga, Kiwamu Saito, Yoshiharu Ishii, Ronald D. Vale, Toshio Yanagida

Biophysical Chemistry　Vol. 68　No. 1-3　p. 63-72　1997年10月　研究論文（学術雑誌）

生体分子における１分子イメージング・操作

原田慶恵

オプトロニクス　Vol. 188　No. 8　p. 140-144　1997年8月

タンパク質分子のイメージング

原田慶恵

応用物理　Vol. 66　No. 5　p. 490-491　1997年5月

Single molecular assay of individual ATP turnover by a myosin-GFP fusion protein expressed is vitro

Atsuko Hikikoshi Iwane, Takashi Funatsu, Yoshie Harada, Makio Tokunaga, Osamu Ohara, Sayuri Morimoto, Toshio Yanagida

FEBS Letters　Vol. 407　No. 2　p. 235-238　1997年4月28日　研究論文（学術雑誌）

Coupling of protein surface hydrophobicity change to ATP hydrolysis by myosin motor domain

M Suzuki, J Shigematsu, Y Fukunishi, Y Harada, T Yanagida, T Kodama

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 72　No. 1　p. 18-23　1997年1月　研究論文（学術雑誌）

Direct inhibition of the actomyosin motility by local anesthetics in vitro

Y Tsuda, T Mashimo, Yoshiya, I, K Kaseda, Y Harada, T Yanagida

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 71　No. 5　p. 2733-2741　1996年11月　研究論文（学術雑誌）

分子モーター１分子の動きを観る

船津高志, 原田慶恵

実験医学　Vol. 14　No. 16　p. 2255-2257　1996年10月

Direct observation of single kinesin molecules moving along microtubules

RD Vale, T Funatsu, DW Pierce, L Romberg, Y Harada, T Yanagida

NATURE　Vol. 380　No. 6573　p. 451-453　1996年4月　研究論文（学術雑誌）

ゾウリムシにおける食胞形成

三島祥二, 原田慶恵, 菊池嘉子

茨城大学教養部紀要　1996年1月　研究論文（学術雑誌）

Multiple- and single-molecule analysis of the actomyosin motor by nanometer piconewton manipulation with a microneedle: Unitary steps and forces

A Ishijima, H Kojima, H Higuchi, Y Harada, T Funatsu, T Yanagida

BIOPHYSICAL JOURNAL　Vol. 70　No. 1　p. 383-400　1996年1月　研究論文（学術雑誌）

アクトミオシン滑り運動実験法のポイント

原田慶恵

生物物理　Vol. 35　No. 6　p. 51-52　1995年12月

１分子の酵素反応を見る

原田慶恵

パリティ　Vol. 10　No. 11　p. 28-30　1995年11月

局所麻酔薬とタンパク質の分子機能

津田祐里, 真下節, 吉矢生人, 原田慶恵, 柳田敏雄

麻酔と蘇生　Vol. 31　No. 2　p. 97-101　1995年6月

生物分子モーター

原田 慶恵

計測と制御 = Journal of the Society of Instrument and Control Engineers　Vol. 34　No. 4　p. 335-335　1995年4月

Effects of local anesthetics on the ATPase activity and motility of actomyosin directly studied by in vitro motility assay

Y TSUDA, T MASHIMO, YOSHIYA, I, Y HARADA, T YANAGIDA

PROGRESS IN ANESTHETIC MECHANISM, VOL 3, SPECIAL ISSUE, 1995　p. 290-295　1995年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

Imaging of single fluorescent molecules and individual ATP turnovers by single myosin molecules in aqueous solution

Takashi Funatsu, Yoshie Harada, Makio Tokunaga, Kiwamu Saito, Toshio Yanagida

Nature　Vol. 374　No. 6522　p. 555-559　1995年　研究論文（学術雑誌）

生物分子モーターのナノ操作と動作原理

原田慶恵, 齋籐究, 石島秋彦, 柳田敏雄

光学　Vol. 23　No. 5　p. 290-296　1994年5月

SINGLE-MOLECULE ANALYSIS OF THE ACTOMYOSIN MOTOR USING NANO-MANIPULATION

A ISHIJIMA, Y HARADA, H KOJIMA, T FUNATSU, H HIGUCHI, T YANAGIDA

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS　Vol. 199　No. 2　p. 1057-1063　1994年3月　研究論文（学術雑誌）

Force-generating domain of myosin motor

Shinji Itakura, Hisashi Yamakawa, Yoko Yano Toyoshima, Akihiko Ishijima, Takaaki Kojima, Yoshie Harada, Toshio Yanagida, Takeyuki Wakabayashi, Kazuo Sutoh

Biochemical and Biophysical Research Communications　Vol. 196　No. 3　p. 1504-1510　1993年11月15日　研究論文（学術雑誌）

NANO-MANIPULATION OF ACTOMYOSIN MOLECULAR MOTORS IN-VITRO - A NEW WORKING PRINCIPLE

T YANAGIDA, Y HARADA, A ISHIJIMA

TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES　Vol. 18　No. 9　p. 319-324　1993年9月　研究論文（学術雑誌）

Do the two heads of the myosin molecule function independently or cooperatively？

Yoshie Harada, Toshio Yanagida

Molecular and Cellular Biology　p. 464-465　1993年1月

COUPLING BETWEEN ATPASE AND FORCE-GENERATING ATTACHMENT-DETACHMENT CYCLES OF ACTOMYOSIN IN-VITRO

T YANAGIDA, A ISHIJIMA, K SAITO, Y HARADA

MECHANISM OF MYOFILAMENT SLIDING IN MUSCLE CONTRACTION　Vol. 332　p. 339-347　1993年　研究論文（国際会議プロシーディングス）

メカノカップリングの本質に迫る

柳田敏雄, 原田慶恵

日本の科学と技術　Vol. 32　No. 262　p. 41-47　1991年7月

Chemomechanical coupling in actomyosin system: An approach by in vitro movement assay and kinetic analysis of ATP hydrolysis by shortening myofibrils

Toshio Yanagida, Yoshie Harada, Takao Kodama

Advances in Biophysics　Vol. 27　No. C　p. 237-257　1991年　研究論文（学術雑誌）

0.1nm 分解能で生物分子エンジン1つの動きを計測する

石島秋彦, 原田慶恵, 柳田敏雄

計測と制御　Vol. 29　No. 12　p. 1123-1130　1990年12月

MECHANOCHEMICAL COUPLING IN ACTOMYOSIN ENERGY TRANSDUCTION STUDIED BY INVITRO MOVEMENT ASSAY

Y HARADA, K SAKURADA, T AOKI, DD THOMAS, T YANAGIDA

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY　Vol. 216　No. 1　p. 49-68　1990年11月　研究論文（学術雑誌）

蛍光ラベル

原田慶恵

実験医学　Vol. 8　No. 5　p. 129-133　1990年5月

運動蛋白質の分子直視・分子超微操作

柳田敏雄, 原田慶恵

蛋白質 核酸 酵素　Vol. 34　No. 13　p. 1784-1792　1989年12月

The elementary process in the actomyosin energy transduction system.

Yoshie Harada, Toshio Yanagida

Muscle Energetics　p. 27-36　1989年6月

Caged ATP

原田慶恵

生体の科学　Vol. 40　No. 4　p. 394-395　1989年4月

アクトミオシン系のエネルギー変換機構

原田慶恵

生物物理　Vol. 28　No. 5　p. 219-223　1988年10月

Direct observation of molecular motility by light microscopy.

Yoshie Harada, Toshio Yanagida

Cell Motility and the Cytoskeleton　Vol. 10　p. 71-76　1988年5月　研究論文（学術雑誌）

Minimum structural unit required for energy transduction in muscle.

Toshio Yanagida, Yoshie Harada

Molecular Mechanism of Muscle Contraction　p. 277-287　1988年3月　研究論文（学術雑誌）

筋肉におけるエネルギー変換の素過程

原田慶恵, 柳田敏雄

生体の科学　Vol. 39　No. 2　p. 110-114　1988年2月

筋収縮メカニズムのなぞに迫る

原田慶恵, Ewa Prochniewicz-Nakayama, 柳田敏雄

日本物理学会誌　Vol. 42　No. 5　p. 424-432　1987年5月

Sliding movement of single actin filaments on one-headed myosin filaments

Yoshie Harada, Akira Noguchi, Akiyoshi Kishino, Toshio Yanagida

Nature　Vol. 326　No. 6115　p. 805-808　1987年　研究論文（学術雑誌）

アクチンとATP

原田慶恵, 柳田敏雄

遺伝　Vol. 40　No. 7　p. 37-42　1986年7月

Paramecium multimicronucleatum の交配活性を発現しないクローン

三島祥二, 原田慶恵

茨城大学教養部紀要　No. 17　p. p81-85　1985年1月　研究論文（学術雑誌）